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iTRAQ定量蛋白質(zhì)組學(xué)
- 公司名稱 武漢傲星生物科技有限公司
- 品牌 其他品牌
- 型號(hào)
- 產(chǎn)地
- 廠商性質(zhì) 經(jīng)銷商
- 更新時(shí)間 2024/3/11 11:07:52
- 訪問次數(shù) 70
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實(shí)驗(yàn)介紹
iTRAQ(isobaric tags for relative and absolute quantitation)技術(shù)是一種多肽體外標(biāo)記技術(shù)。該技術(shù)采用4-plex或8-plex同位素的標(biāo)簽,通過特異性標(biāo)記多肽的氨基基團(tuán),進(jìn)行LC-MS/MS分析,可同時(shí)比較多種不同樣本中蛋白質(zhì)的相對(duì)表達(dá)含量
實(shí)驗(yàn)流程
*包括蛋白質(zhì)定量、SDS-PAGE測(cè)試、酶解和質(zhì)譜分析,對(duì)樣本質(zhì)量及樣本之間的平行性進(jìn)行初步判斷。
應(yīng)用方向
生物領(lǐng)域各個(gè)研究方面,如:
? 農(nóng)林領(lǐng)域:抗逆脅迫機(jī)制,生長(zhǎng)發(fā)育機(jī)制,育種保護(hù)研究等
? 畜牧業(yè):肉類及乳品質(zhì)研究,致病機(jī)理研究等
? 基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)、臨床診斷:生物標(biāo)志物,疾病機(jī)理機(jī)制,疾病分型,個(gè)性化治療等
? 生物醫(yī)藥:藥物作用機(jī)理,藥效評(píng)價(jià),藥物開發(fā)等
? 微生物領(lǐng)域:致病機(jī)理,耐藥機(jī)制,病原體-宿主相互作用研究等
? 海洋水產(chǎn):漁業(yè)資源,海水養(yǎng)殖,漁業(yè)環(huán)境與水產(chǎn)品安全等
? 生物能源、環(huán)境科學(xué)領(lǐng)域:發(fā)酵過程優(yōu)化,生物燃料生產(chǎn),環(huán)境危定風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估研究等
? 食品營(yíng)養(yǎng):食品儲(chǔ)藏及加工條件優(yōu)化,食品組分及品質(zhì)鑒定,功能性食品開發(fā),食品安全監(jiān)檢測(cè)等
數(shù)據(jù)分析
標(biāo)準(zhǔn)數(shù)據(jù)分析內(nèi)容 | |
蛋白質(zhì)總鑒定數(shù)量分析 | 蛋定與定量結(jié)果統(tǒng)計(jì)、差異結(jié)果統(tǒng)計(jì)、火山圖、聚類熱圖 |
差異蛋白質(zhì)功能分析 | 亞細(xì)胞定位、結(jié)構(gòu)域分析、GO功能分析、KEGG通路分析、PPT互作網(wǎng)絡(luò)分析 |
質(zhì)量控制分析 | 肽段離子質(zhì)量偏差分布、肽段離子得分分布、蛋白質(zhì)豐度比分布 |
高級(jí)數(shù)據(jù)分析內(nèi)容 | |
WGCNA共表達(dá)分析 | 獲得與表型強(qiáng)關(guān)聯(lián)的核心蛋白質(zhì) |
趨勢(shì)聚類分析 | 探討蛋白質(zhì)的表達(dá)趨勢(shì)模式 |
技術(shù)優(yōu)勢(shì)
? 具有2-8 plex標(biāo)簽,可同時(shí)標(biāo)記2-8組樣本進(jìn)行表達(dá)差異分析
? 是一種體外標(biāo)記技術(shù),可標(biāo)記動(dòng)物、植物、微生物、臨床、體液或細(xì)胞等多種樣本
? 不同標(biāo)簽混合后上機(jī),具有較好的平行性,避免技術(shù)誤差,提高檢測(cè)效率
? 與凝膠方法相比,iTRAQ可發(fā)現(xiàn)膜蛋白、核蛋白、胞外蛋白、強(qiáng)堿和強(qiáng)酸蛋白以及小于10KD和大于200KD的蛋白質(zhì),對(duì)低豐度蛋白質(zhì)亦有較好的檢出率