PFGE 以其重復(fù)性好，分辨力強(qiáng)而被譽(yù)為細(xì)菌分子分型技術(shù)的“金標(biāo)準(zhǔn)”。它可以用于大分子DNA的分離，其分辨范圍達(dá)到10 Mb。PFGE選用識別低頻率酶切位點(diǎn)的內(nèi)切酶切割基因組DNA，獲得的DNA大片段在外加脈沖電場的低濃度瓊脂糖凝膠中分離，產(chǎn)生數(shù)量有限的DNA條帶，在凝膠上按染色體片段長度的不同而呈現(xiàn)出電泳帶型，從而實(shí)現(xiàn)對菌株分型以檢測菌株的基因多態(tài)性。

MLST 是基于細(xì)菌核苷酸序列比對的一種分子分型方法，其原理是通過比較細(xì)菌個(gè)體7個(gè)或者更多管家基因的核苷酸序列的多態(tài)性，確定其基因多態(tài)性，同時(shí)通過劃分序列群和構(gòu)建最小生成樹來揭示細(xì)菌群體遺傳結(jié)構(gòu)。

MLVA 是基于細(xì)菌基因組中多個(gè)位點(diǎn)的數(shù)目可變化的串聯(lián)重復(fù)序列核心序列的拷貝數(shù)的差異來對不同細(xì)菌個(gè)體進(jìn)行分型的一種技術(shù)。MLVA具有快速高通量易于操作等優(yōu)點(diǎn)，不僅能確定基因多態(tài)性，而且能揭示細(xì)菌群體遺傳結(jié)構(gòu)特征。

使用PFGE、MLST、MLVA中的一種或者綜合使用多種分型方法，可以揭示細(xì)菌的基因多態(tài)性和群體遺傳結(jié)構(gòu)，結(jié)合細(xì)菌的三間分布信息以及其他生物學(xué)信息（如耐藥特征、特殊表型、毒力基因檢測）等可以進(jìn)行細(xì)菌的流行特征、傳播機(jī)制、變異特征分析，以及特殊意義克隆群的甄別等研究；另外還可以為后續(xù)的研究，如全基因組測序、致病機(jī)制研究等項(xiàng)目篩選具有基因組代表性的測試菌株。

另外，我司還提供其它分子分型服務(wù)，例如ERIC-PCR、RAPD等，以及宏基因組、耐藥基因譜、毒力基因譜檢測和數(shù)據(jù)分析等技術(shù)服務(wù)。

數(shù)據(jù)分析服務(wù)內(nèi)容：

• PFGE typing

• RiboPrinter typing

• MLST analysis、MLVA typing

• MALDI、AFLP、RFLP、RAPD

• REP-PCR、ARDRA、DGGE、TGGE

• Whole genome MLST

• Antibiotic resistance profiling

• Community fingerprinting

• Hetero-Duplex Analysis (HDA)

• HIV drugresistance prediction

• ISSR-PCR using QIAxcel

• ITS typing

• MIRU-VNTR typing

• MLPA analysis

• Molecular surveillance

• Sequence-based typing

• Sequence repeat typing

• spa-typing

• Taqman-based SNP genotyping