蛋白質(zhì)與RNA的互作: CLIP
染色質(zhì)免疫沉淀分析(CLIP) 實(shí)驗(yàn)意義
是染色質(zhì)免疫沉淀技術(shù)(Chromatin ImmunoPrecipitation assay)的簡(jiǎn)稱,屬于兔疫沉淀技術(shù)的一種,用于檢測(cè)蛋白質(zhì)與DNA的相互作用。
實(shí)驗(yàn)原理
其主要原理是基于RNA與其相應(yīng)的RNA結(jié)合蛋白會(huì)在紫外照射下會(huì)發(fā)生共價(jià)結(jié)合,以RNA結(jié)合蛋白的特異性抗體將RNA-蛋白復(fù)合物沉淀之后,回收其中的RNA片段,進(jìn)行qRT-PCR檢測(cè)或測(cè)序分析。
實(shí)驗(yàn)流程
1.根據(jù)研究目的決定研究方案,檢測(cè)抗體是否適用于Chip反應(yīng),設(shè)計(jì)檢測(cè)引物;
2.對(duì)生物樣品進(jìn)行甲醛交聯(lián);
3.超聲破碎基因組DNA
4.染色質(zhì)免疫共沉淀;
5.qPCR檢測(cè)或(克隆)測(cè)序;1
實(shí)驗(yàn)完成周期及交付標(biāo)準(zhǔn)
1.實(shí)驗(yàn)周期: 1-3個(gè)月 .
2.交付標(biāo)準(zhǔn): CLIP鑒定結(jié)果報(bào)告、分析報(bào)告、實(shí)驗(yàn)報(bào)告(試劑、 耗材、實(shí)驗(yàn)步驟)、原始數(shù)據(jù)等
需確認(rèn)的信息
1.目的基因與蛋白信息。
2.樣本類型與種屬
3.是否需要生信分析
部分實(shí)驗(yàn)代做服務(wù)
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