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中級(jí)會(huì)員 | 第14年

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電泳儀常見問(wèn)題處理方法

時(shí)間:2023/8/9閱讀:885
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注意事項(xiàng)
1、電泳中使用的溴化乙錠(EB)為中度毒性、強(qiáng)致癌性物質(zhì),務(wù)必小心,勿沾染于衣物、
皮膚、眼睛、口鼻等。所有操作均只能在專門電泳區(qū)域操作,戴一次性手套,并及時(shí)更換。
2、預(yù)先加入EB 時(shí)可能使 DNA 的運(yùn)動(dòng)速度下降15%左右,且不同構(gòu)型的 DNA 的影響程度不同。所以為取得較真實(shí)的電泳結(jié)果可以在電泳結(jié)束后再用 0.5μg/ml 的 EB 溶液浸泡染色。EB在光照下易降解,若凝膠放置一段時(shí)間后才觀察,即使原來(lái)膠內(nèi)或樣品已加 EB,建議選擇EB溶液浸泡染色。
3、加樣進(jìn)膠時(shí)不要形成氣泡,需在凝膠液未凝固之前及時(shí)**,否則,需重新制膠。
4、電泳時(shí)溴酚蘭在瓊脂糖凝膠中的運(yùn)動(dòng)速度可以用于參考電泳速度,已實(shí)際電泳條帶運(yùn)動(dòng)速度為準(zhǔn)。
常見問(wèn)題分析

常見問(wèn)題

原因

對(duì)策

DNA條帶模糊

DNA降解

實(shí)驗(yàn)過(guò)程避免核酸酶污染

電泳緩沖液陳舊

電泳緩沖液多次使用后,離子強(qiáng)度降低,PH值上升,緩沖能力減弱,從而影響電泳效果。TBE建議使用10次就更換緩沖液

所用電泳條件不合適

電泳時(shí)電壓不應(yīng)超過(guò)6V/CM,溫度<30℃,巨大DNA鏈電泳,溫度應(yīng)<15℃,核查所用電泳緩沖液的緩沖能力,注意經(jīng)常更換

DNA上樣量過(guò)多

減少凝膠中DNA上樣量

DNA含鹽過(guò)高

電泳前通過(guò)乙醇沉淀去除多余鹽分

有蛋白污染

電泳前酚抽提去除蛋白

DNA變性

電泳前勿加熱,用TE緩沖液稀釋DNA

出現(xiàn)片狀拖帶或涂抹帶

PCR擴(kuò)增有時(shí)出現(xiàn)涂抹帶或片狀帶或地毯樣帶。其原因往往PCR體系需要優(yōu)化,PCR程序需要摸索。

其對(duì)策有:調(diào)整PCR體系和PCR程序,摸索出合適的條件。

不規(guī)則DNA帶遷移

電泳條件不合適

電泳時(shí)電壓不應(yīng)超過(guò)6V/CM,溫度<30℃,巨大DNA鏈電泳,溫度應(yīng)<15℃,核查所用電泳緩沖液的緩沖能力,注意經(jīng)常更換

DNA變性

電泳前勿加熱,用TE緩沖液稀釋DNA

帶弱或無(wú)DNA帶

DNA上樣量不夠

增加DNA上樣量,聚丙烯酰胺凝膠電泳比瓊脂糖電泳靈敏度高,上樣量可適當(dāng)降低

DNA降解

實(shí)驗(yàn)過(guò)程避免核酸酶污染

DNA跑出凝膠

縮短電泳時(shí)間,降低電壓,增強(qiáng)凝膠濃度

EB染色的DNA,所用光源不合適

應(yīng)用短波長(zhǎng)(254nm)的紫外光源

DNA帶缺失

DNA跑出凝膠

縮短電泳時(shí)間,降低電壓,增強(qiáng)凝膠濃度

分子大小相近的DNA帶不易分辨

增加電泳時(shí)間,核準(zhǔn)正確凝膠濃度

DNA變性

電泳前勿加熱,用20mM Nacl 緩沖液稀釋DNA

DNA鏈巨大,常規(guī)凝膠電泳不合適

在脈沖凝膠電泳上分析

電泳時(shí)Ladder扭曲

配膠的緩沖液和電泳緩沖液不是同時(shí)配置

同時(shí)配置,電泳緩沖液高出液面1-2mm即可

電泳時(shí)電壓過(guò)高

電泳時(shí)電壓不應(yīng)超過(guò)6V/CM

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