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重磅:2018諾貝爾化學(xué)獎(jiǎng)花落誰(shuí)家
閱讀:1301 發(fā)布時(shí)間:2018-10-1110月,2018年度諾貝爾化學(xué)獎(jiǎng)揭曉。今年該獎(jiǎng)項(xiàng)的獲得者是美國(guó)科學(xué)家弗朗西絲·阿諾德(Frances H. Arnoid)、喬治·史密斯(George P. Smith)和英國(guó)科學(xué)家格雷戈里·溫特(Sir Gregory P. Winter)。他們的獲獎(jiǎng)理由是在酶的定向演化以及用于多肽和抗體的噬菌體展示技術(shù)方面取得的成果。
Frances H. Arnoid從1993年起,進(jìn)行了酶的次定向進(jìn)化,這是一種催化化學(xué)反應(yīng)蛋白質(zhì)。她的方法經(jīng)常用于開(kāi)發(fā)新催化劑,用這種方法產(chǎn)生的酶,用途包括開(kāi)發(fā)更環(huán)保的化學(xué)物質(zhì)、藥品以及為運(yùn)輸部門(mén)生產(chǎn)更環(huán)保的可再生燃料。
酶是由活細(xì)胞產(chǎn)生的、對(duì)其底物具有高度特異性和高度催化效能的蛋白質(zhì)或RNA,因此是一類(lèi)重要的生物催化劑。1993年Arnoid完成了首ge酶的定向演化實(shí)驗(yàn),也就是實(shí)現(xiàn)了她的理論,此后她不斷完善這個(gè)方法,現(xiàn)在已能用于開(kāi)發(fā)新的催化劑?;贏rnoid的研究成果,業(yè)界可以通過(guò)更環(huán)保的方式來(lái)化學(xué)物質(zhì),比如生產(chǎn)藥物和可再生能源等。
另外兩名獲獎(jiǎng)?wù)?mdash;—George P. Smith和Sir Gregory P. Winter則因?yàn)殚_(kāi)發(fā)了噬菌體展示的方法,來(lái)進(jìn)行抗體的定向進(jìn)化,進(jìn)而生產(chǎn)新的藥物。種基于這種方法的阿達(dá)木單抗已在2002年獲批,用于治療類(lèi)風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎、牛皮癬和炎癥性腸病。從那時(shí)起,噬菌體展示產(chǎn)生了可以中和毒素、抵抗自身免疫疾病和轉(zhuǎn)移性癌癥的抗體。
1985年,Smith開(kāi)發(fā)出了一種被稱(chēng)為“噬菌體呈現(xiàn)”的技術(shù),該方法基于專(zhuān)門(mén)感染細(xì)菌的噬菌體病毒。這些病毒本身只不過(guò)是包裹著遺傳物質(zhì)的蛋白質(zhì)膠囊。通過(guò)將基因?qū)胧删w,Smith可以在噬菌體中演化出新型蛋白質(zhì)。Winter則應(yīng)用噬菌體呈現(xiàn)技術(shù)出藥物抗體。抗體是我們的免疫細(xì)胞用來(lái)識(shí)別其他細(xì)胞的標(biāo)簽分子。
瑞典科學(xué)院認(rèn)為,“我們正處于直接進(jìn)化革命的早期階段,它以多種不同方式為人類(lèi)帶來(lái)zui大利益”。
成果回顧:
世界shou個(gè)人工酶
英國(guó)醫(yī)學(xué)研究委員會(huì)的科學(xué)家們生成了世界上個(gè)由人工遺傳物質(zhì)制成的酶。他們的合成酶,是由自然界中不會(huì)產(chǎn)生的分子制成,能夠在實(shí)驗(yàn)室引發(fā)化學(xué)反應(yīng)。
這些結(jié)果基于MRC分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室以前的工作,他們生成了稱(chēng)為“XNAs”的合成分子,這些分子能夠以類(lèi)似DNA的方式儲(chǔ)存和傳遞遺傳物質(zhì)。
該研究小組用實(shí)驗(yàn)室自制的XNAs作為構(gòu)建模塊,制備了“XNAzymes”,它能引發(fā)簡(jiǎn)單的反應(yīng),例如切割或縫合小片段RNA,就像天然酶一樣。
MRC 分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室的Philipp Holliger博士帶領(lǐng)了這項(xiàng)研究,他說(shuō):“地球上所有生命都依賴(lài)于一系列的化學(xué)反應(yīng),從消化食物到在細(xì)胞中DNA。這些反應(yīng)大多數(shù)在環(huán)境溫度和壓力下發(fā)生的太過(guò)遲緩,需要酶來(lái)啟動(dòng)或‘催化’這個(gè)過(guò)程。”
首ge人工金屬酶
來(lái)自巴塞爾大學(xué)、蘇黎世聯(lián)邦理工大學(xué)和NCCR分子系統(tǒng)工程的科學(xué)家,開(kāi)發(fā)了一種人工金屬酶,可催化細(xì)胞內(nèi)的反應(yīng),在大自然中沒(méi)有等價(jià)物。這可能是“在活細(xì)胞內(nèi)創(chuàng)建新的非自然代謝途徑”的例子。
這種人工金屬酶,稱(chēng)為biot-Ru-SAV,是采用生物素-鏈親和素技術(shù)制備而成的。這種方法依賴(lài)于蛋白質(zhì)鏈霉親和素對(duì)維生素生物素的高親和力,其中結(jié)合生物素的化合物可以被引入到蛋白質(zhì),以產(chǎn)生人工酶。在這項(xiàng)研究中,作者介紹了一種金屬有機(jī)化合物,它的底部有金屬釕。有機(jī)金屬化合物在一個(gè)金屬原子和一個(gè)碳原子之間至少有一個(gè)鍵,通常用于工業(yè)化學(xué)反應(yīng)的催化劑。然而,如果真起作用的話,有機(jī)金屬催化劑在水溶液中或細(xì)胞環(huán)境中的表現(xiàn)并不佳,需要被合并到像鏈霉親和素這樣的蛋白支架,來(lái)克服這些局限。
該研究的資深作者、巴塞爾大學(xué)化學(xué)系教授Thomas R Ward說(shuō):“我們的目標(biāo)是制備一種人工金屬酶,可以催化烯烴復(fù)分解反應(yīng),這是不存在于天然酶當(dāng)中的一種反應(yīng)機(jī)制。”烯烴復(fù)分解反應(yīng)是一種方法,用于碳碳雙鍵的形成和再分配,碳碳雙鍵被廣泛用于各種化學(xué)產(chǎn)品的實(shí)驗(yàn)室研究和大規(guī)模工業(yè)生產(chǎn)。Biot-Ru-SAV可催化一種關(guān)環(huán)復(fù)分解反應(yīng),以生產(chǎn)一種易于檢測(cè)和定量熒光分子。
活細(xì)胞內(nèi)的環(huán)境難以實(shí)現(xiàn)有機(jī)金屬酶的正常運(yùn)作。蘇黎世聯(lián)邦理工大學(xué)生物系統(tǒng)科學(xué)與工程系的Markus Jeschek說(shuō):“主要的突破是,‘使用大腸桿菌的周質(zhì)作為反應(yīng)室’的這個(gè)想法,其環(huán)境更適合于烯烴復(fù)分解催化劑。”周質(zhì)——革蘭氏陰性菌的內(nèi)細(xì)胞膜和細(xì)菌外膜之間的間隙,含有低濃度的金屬酶抑制劑,如谷胱甘肽。
作者發(fā)現(xiàn)在體內(nèi)條件下是理想的,之后又進(jìn)了一步,決定通過(guò)采用定向進(jìn)化原則——這種方法模擬自然選擇的過(guò)程來(lái)進(jìn)化出性能或活性增強(qiáng)的蛋白質(zhì),來(lái)優(yōu)化biot-Ru-SAV。Ward解釋說(shuō):“然后,我們可以開(kāi)發(fā)一種簡(jiǎn)單和可靠的篩選方法,可讓我們測(cè)試幾千個(gè)biot-Ru-SAV突變體,并識(shí)別zui活躍的變種。”
作者不僅能顯著改善biot-Ru-SAV的催化特性,而且也表明,這種有機(jī)金屬基酶可以被設(shè)計(jì)和優(yōu)化成不同的底物,從而產(chǎn)生各種不同的化學(xué)產(chǎn)品。Ward說(shuō):“這一結(jié)果令人興奮的地方在于,像biot-Ru-SAV這樣的人工金屬酶,可用于生產(chǎn)新的高附加值化學(xué)品。它有很多的潛力,可結(jié)合化學(xué)和生物學(xué)工具,zui終利用細(xì)胞作為分子工廠。”
有益的噬菌體組
長(zhǎng)期以來(lái)科學(xué)家們總在懷疑,人體內(nèi)的噬菌體組(phageome)是不是能通過(guò)調(diào)節(jié)我們的免疫系統(tǒng)影響人類(lèi)生理。直到近期,澳大利亞莫納什大學(xué)噬菌體研究員Jeremy Barr團(tuán)隊(duì)在mBio發(fā)表文章證明“的確如此”。
過(guò)去幾十年,大多數(shù)有關(guān)噬菌體的醫(yī)學(xué)研究都集中在努力將這些微生物轉(zhuǎn)化為“抗生素”,其中一些已經(jīng)取得了成功。不過(guò),跳出抗生素圈子,作為一門(mén)獨(dú)立的治療方法,“噬菌體療法”正在崛起。
Barr的早期研究表明,噬菌體的自然屬性有助于保護(hù)我們免受病原體侵害。在調(diào)查了不同物種后,Barr發(fā)現(xiàn),粘液層中噬菌體數(shù)量明顯增多。原來(lái),噬菌體的蛋白質(zhì)外殼能結(jié)合粘蛋白(mucins)。粘蛋白和水共同構(gòu)成粘液。
這對(duì)生產(chǎn)粘液的主人和噬菌體都有好處。吸附在粘液上,讓噬菌體有機(jī)會(huì)遇到更多細(xì)菌。噬菌體能保護(hù)細(xì)胞免受潛在細(xì)菌病原體侵害,為機(jī)體提供額外的免疫層。
體外培養(yǎng)的上皮細(xì)胞實(shí)驗(yàn)表明,人類(lèi)細(xì)胞能吸收噬菌體并將它們傳送至細(xì)胞內(nèi)部。運(yùn)輸機(jī)制尚不明確。
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