微生物環(huán)境監(jiān)測是測量代表環(huán)境質(zhì)量的各種指標(biāo)數(shù)據(jù)的過程，它包括環(huán)境分析，物理測量和生物監(jiān)測。所謂的生物監(jiān)測是利用生物體對(duì)環(huán)境污染的各種信息作為判斷環(huán)境污染的一種手段。生物在自然界中長期生存，不僅可以反映多因素污染的綜合影響，還可以反映環(huán)境污染的歷史條件。因此，生物監(jiān)測可以彌補(bǔ)理化分析和測試的不足。特別地，微生物具有*的特征并且與環(huán)境密切相關(guān)。因此，微生物學(xué)方法在生物學(xué)監(jiān)測中占有特殊的地位。

　　1、微生物環(huán)境監(jiān)測糞便污染指示劑細(xì)菌

　　糞便污染指示劑細(xì)菌的存在是水體中糞便污染的指示劑。根據(jù)對(duì)正常人糞便中微生物的分析和測量結(jié)果，認(rèn)為以大腸菌和糞鏈球菌為指標(biāo)更合適，前者使用更廣泛。

　　大腸菌群是指與大腸桿菌相似的一大類需氧和兼性厭氧革蘭氏陰性非細(xì)菌細(xì)菌。它們可以在48小時(shí)內(nèi)發(fā)酵乳糖以產(chǎn)生酸和氣體，包括大腸桿菌，檸檬酸桿菌，腸桿菌，克雷伯菌等。確定大腸菌的常用方法有兩種：發(fā)酵法和膜濾法。

　　有兩種表達(dá)大腸菌群數(shù)量的方法。一種是“大腸菌數(shù)量”，也稱為“大腸菌指數(shù)”，即1升水中所含大腸菌的數(shù)量。第二個(gè)是“大腸菌群值”，是指可以檢測到水樣中的1種大腸菌群的小水樣體積（mL）。值越大，水中的大腸菌數(shù)量越少。

　　我國的飲用水衛(wèi)生標(biāo)準(zhǔn)規(guī)定，每1升水中的大腸菌群總數(shù)不得超過3個(gè)，即大腸菌群的含量不得少于333mL。

　　2、微生物環(huán)境監(jiān)測水污染指標(biāo)生物區(qū)

　　普通生物更適合用于清潔水體，但有些生物適合于一定程度的污染水體。在具有不同污染水平的各種水體中，每個(gè)都有其自身的生物種類和組成。根據(jù)水域中動(dòng)植物的微生物區(qū)系，可以推斷水域的污染狀況，并通過上述檢測確定污水生物區(qū)。水體通常分為多個(gè)污染區(qū)，中等污染區(qū)和低污染區(qū)。中型臟污帶分為A型中型臟污帶和B型中型臟污帶。