微生物環(huán)境監(jiān)測(cè)是測(cè)定代表環(huán)境質(zhì)量的各種指標(biāo)數(shù)據(jù)的過程，包括環(huán)境分析、物理測(cè)定和生物監(jiān)測(cè)。其中生物監(jiān)測(cè)是利用各種生物信息作為判斷環(huán)境污染狀況的一種手段。生物生活在環(huán)境中，不僅可以反映多種因子污染的綜合效應(yīng)，而且還能反映環(huán)境污染的歷史狀況。因此，生物監(jiān)測(cè)可以彌補(bǔ)物理、化學(xué)測(cè)試的不足。
 

　　

　　開展微生物環(huán)境監(jiān)測(cè)時(shí)，我們可以通過監(jiān)測(cè)水體中特定微生物的數(shù)量和種類的變化，反映水質(zhì)變化趨勢(shì)。但是環(huán)境中微生物的數(shù)量和種類太龐大，工作量巨大，因此無(wú)法對(duì)水體中各種可能存在的有害致病微生物一一進(jìn)行檢測(cè)。通常還可以選擇適當(dāng)?shù)闹甘揪鳛楸O(jiān)測(cè)的主要對(duì)象，來(lái)預(yù)報(bào)水質(zhì)的污染趨勢(shì)，以保證水質(zhì)的衛(wèi)生安全。雖然微生物作為環(huán)境污染的指示物在應(yīng)用上不及動(dòng)植物廣泛，但是微生物的某些特性使微生物在環(huán)境監(jiān)測(cè)中具有特殊的作用。

　　

　　微生物環(huán)境監(jiān)測(cè)應(yīng)當(dāng)制定清潔、消毒、衛(wèi)生的標(biāo)準(zhǔn)操作規(guī)程，其中應(yīng)當(dāng)涉及環(huán)境監(jiān)測(cè)結(jié)果。實(shí)驗(yàn)室使用前后應(yīng)進(jìn)行消毒，并定期監(jiān)測(cè)消毒效果。應(yīng)有足夠的洗手和手部消毒設(shè)施。應(yīng)當(dāng)有有害微生物污染的處理程序。使用的消毒劑種類應(yīng)符合潔凈實(shí)驗(yàn)室的相關(guān)要求，并定期更換。理想的消毒劑不僅能殺滅多種微生物，對(duì)人體無(wú)毒性，不會(huì)腐蝕或污染設(shè)備，而且具有去污功能，性能穩(wěn)定，起效快，殘留少，價(jià)格合理。對(duì)所用消毒劑、清潔劑的微生物污染情況進(jìn)行監(jiān)測(cè)，并在規(guī)定的有效期內(nèi)使用，潔凈區(qū)應(yīng)使用無(wú)菌或無(wú)菌的消毒劑和清潔劑。