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翌圣生物科技（上海）股份有限公司
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12806ES08Globin mRNA Depletion Probe （Human）
| 參考價: | 面議 |
具體成交價以合同協(xié)議為準(zhǔn)- 12806ES08 產(chǎn)品型號
- Yeasen/翌圣生物 品牌
- 生產(chǎn)商 廠商性質(zhì)
- 上海市 所在地
訪問次數(shù)：546更新時間：2023-03-15 09:05:15
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產(chǎn)品簡介
| 供貨周期 | 現(xiàn)貨 | 應(yīng)用領(lǐng)域 | 生物產(chǎn)業(yè) |
|---|
產(chǎn)品介紹
Globin mRNA Depletion Probe (Human)
產(chǎn)品信息
產(chǎn)品名稱 | 產(chǎn)品編號 | 規(guī)格 | 價格 |
Globin mRNA Depletion Probe (Human)
| 12806ES08 | 8 T | 285.00 |
12806ES24 | 24 T | 725.00 | |
12806ES96 | 96 T | 2655.00 |
產(chǎn)品描述
Globin mRNA Depletion Probe (Human)是針對人的珠蛋白mRNA設(shè)計的探針，能夠有效去除成年個體、嬰兒及胚胎來源的珠蛋白mRNA，包括HBA1/2， HBB，HBD，HBM，HBG1/2，HBE1，HBQ1，HBZ。該產(chǎn)品搭配Hieff NGS® MaxUp rRNA Depletion Kit (Human/Mouse/Rat) (Yeasen#12253)使用，有效去除總RNA中的rRNA及Globin mRNA以保留其他信使RNA（mRNA）和非編碼RNA。該試劑盒對于完整和部分降解的總RNA均具有良好的rRNA去除效果。經(jīng)rRNA & Globin mRNA去除所獲得的RNA樣本可用于高通量測序分析mRNA和非編碼RNA，可顯著提高測序結(jié)果中有效數(shù)據(jù)比例，也可用于cDNA合成或其它下游應(yīng)用。
適用范圍
適用于人、小鼠、大鼠血液來源的100 ng~1 μg 總RNA樣品；適用于完整或部分降解RNA樣品。
產(chǎn)品組分
組分編號和名稱 | 12806ES08 | 12806ES24 | 12806ES96 |
| 8 μL | 24 μL | 96 μL |
運輸與保存方法
干冰運輸，-20°C存放，有效期一年。
注意事項
1. 請使用無RNase污染的耗材，并對實驗區(qū)域定期進行清理，推薦使用Thermo Fisher公司的RNAZapTM 高效核酸去除噴霧去除RNA酶污染。
2. RNA樣品應(yīng)不含基因組DNA污染，若樣品中有g(shù)DNA殘留，應(yīng)先進行DNase I消化并純化后再用于本試劑盒。
3. RNA樣品大投入體積為10 μL，若樣品體積較大，可先進行濃縮。
自備材料
1. RNA純化磁珠：Hieff NGS® Cleaner（Cat#12602）或其他等效產(chǎn)品。
2. qRT-PCR質(zhì)檢rRNA去除效率：Hieff® qPCR SYBR Green Master Mix(No Rox) （Cat#11201）或其他等效產(chǎn)品；
3. 其他材料： 無水乙醇、無菌超純水、低吸附槍頭、PCR管、磁力架、PCR儀等。
操作步驟
1. 探針雜交
1.1 將探針和雜交Buffer從-20 °C 取出，解凍后顛倒混勻，置于冰上備用。
1.2 準(zhǔn)備RNA樣品：根據(jù)投入量和樣品濃度，計算RNA取樣體積，用Nuclease free H2O稀釋至10 μL。
1.3 按照表1于200 μL PCR管中配制rRNA去除反應(yīng)體系。
表 1 探針雜交反應(yīng)體系
名稱 | 體積（μL） |
Hybridization Buffer | 3 |
Probe Mix(H/M/R) | 1 |
Globin Probe(Human) | 1 |
Total RNA | 10（100 ng~1 μg） |
Total | 15 |
1.4 使用移液器輕輕吹打混勻，瞬離將反應(yīng)液離心至管底。
1.5 將上述 PCR 管置于PCR儀中，按照表2所示反應(yīng)程序，進行探針雜交反應(yīng)。
表 2 探針雜交反應(yīng)程序
溫度 | 時間 |
熱蓋105°C | On |
95℃ | 2 min |
95℃-22℃ | 0.1℃/s |
22℃ | 5 min |
4℃ | hold |
2. RNase H消化
2.1將RNase H消化試劑從-20 °C取出，解凍后顛倒混勻，置于冰上備用。按照表 3 所示，配制RNase H消化反應(yīng)體系。
表3 RNase H消化反應(yīng)體系
名稱 | 體積（μL） |
RNase H Buffer | 3 |
RNase H | 2 |
上步產(chǎn)物 | 15 |
Total | 20 |
2.2 使用移液器輕輕吹打混勻，瞬離將反應(yīng)液離心至管底。
2.3 將上述 PCR 管置于PCR儀中，設(shè)置反應(yīng)程序：(熱蓋關(guān)) 37℃，30 min； 4℃，hold，進行RNase H消化反應(yīng)。
3. DNase I 消化
3.1將DNase I消化試劑從-20 °C 取出，解凍后顛倒混勻，置于冰上備用。按照表4所示，配制DNase I消化反應(yīng)體系。
表4 DNase I消化反應(yīng)體系
名稱 | 體積（μL） |
DNase I Buffer | 27.5 |
DNase I | 2.5 |
上一步產(chǎn)物 | 20 |
Total | 50 |
3.2 使用移液器輕輕吹打混勻，瞬離將反應(yīng)液離心至管底。
3.3 將上述 PCR 管置于PCR儀中，設(shè)置反應(yīng)程序：(熱蓋關(guān)) 37℃，30min； 4℃，hold，進行DNase I消化反應(yīng)。
4. RNA純化
4.1 準(zhǔn)備工作：將 Hieff NGS® RNA Cleaner （Cat#12602）磁珠由冰箱中取出，室溫平衡至少 30 min。用Nuclease free H2O配制 80%乙醇。
4.2 渦旋振蕩或充分顛倒磁珠以保證充分混勻。
4.3 吸取 110 μL Hieff NGS® RNA Cleaner（2.2×，Beads:DNA=2.2:1）至上一步產(chǎn)物中，移液器充分吹打混勻，室溫孵育 5 min。
4.4 將PCR管置于磁力架中分離磁珠和液體，待溶液澄清后（約3 min），小心移除上清。
4.5 保持PCR管始終置于磁力架中，加入 200 μL Nuclease free H2O新鮮配制的80%乙醇漂洗磁珠，室溫孵育 30 sec 后，小心移除上清。
4.6 重復(fù)步驟 4.5，總計漂洗兩次。用 10 μL移液器吸干凈殘留液體。
4.7 保持 PCR 管始終置于磁力架中，室溫下開蓋干燥磁珠（5~10 min）。
4.8 RNA洗脫：將PCR 管從磁力架上取下，加入 11 μL Nuclease free H2O（或使用適合下游實驗的相應(yīng)體積Nuclease free H2O或洗脫緩沖液），使用移液器輕輕吹打至充分混勻，室溫靜置 5 min。
4.9將 PCR管短暫離心并置于磁力架中靜置，待溶液澄清后（約3 min），小心移取 10 μL 上清（可根據(jù)步驟4.8選擇的實際洗脫體積進行相應(yīng)調(diào)整）至新的Nuclease free PCR 管中。
【注】洗脫后的樣品請立即進行下游實驗，或置于-80℃存放。
案例展示
Human Blood Total RNA分別進行rRNA去除、rRNA&Globin 去除后建庫測序，對比Globin mRNA含量。
相關(guān)產(chǎn)品
建庫試劑盒 | 產(chǎn)品編號 | 規(guī)格 |
Hieff NGS® Ultima DNA Library Prep Kit for Illumina® | 12199ES24/96 | 24/96 T |
Hieff NGS® Ultima Pro DNA Library Prep Kit for Illumina® | 12201ES24/96 | 24/96 T |
Hieff NGS® OnePot Pro DNA Library Prep Kit for Illumina® | 12205ES24/96 | 24/96 T |
Hieff NGS® OnePotⅡ DNA Library Prep Kit for Illumina® | 12204ES24/96 | 24/96 T |
Hieff NGS® Fast Tagment DNA Library Prep Kit for Illumina® | 12206/7ES24/96 | 24/96 T |
Hieff NGS® Ultima Dual-mode mRNA Library Prep Kit for Illumina® | 12301ES24/96 | 24/96 T |
文庫構(gòu)建磁珠 | 產(chǎn)品編號 | 規(guī)格 |
Hieff NGS® cfDNA Clean Beads（100~200 bp） | 12599ES08/56 | 5/60 mL |
Hieff NGS® Smarter DNA Clean beads (50 bp以上） | 12600ES08/56 | 5/60 mL |
Hieff NGS® DNA Selection Beads（Superior AMPure XP alternative） | 12601ES08/56 | 5/60 mL |
Hieff NGS® RNA Cleaner | 12602ES08/56 | 5/60 mL |
Hieff NGS® mRNA Isolation Master Kit | 12603ES24/96 | 24/96 T |
建庫接頭 | 產(chǎn)品編號 | 規(guī)格 |
Hieff NGS® 96 Single Index Primer Kit for Illumina®, Set 1/2 | 12611/12612ES02 | 48×2 T |
Hieff NGS® 384 CDI Primer for Illumina®, Set1/2 | 12412/12413ES02 | 96×2 T |
Hieff NGS® RNA 384 CDI Primer for Illumina®, Set1/ 2 | 12414/12415ES02 | 96×2 T |
Hieff NGS® Complete Adapter Kit for Illumina®, Set 1/2 | 12615/12616ES04/16 | 12×4/12×16 T |
Hieff NGS® Complete Adapter Kit for Illumina®, Set 3/4 | 12617/12618ES04/16 | 12×4/12×16 T |
Hieff NGS® Tagment Index Kit for Illumina®,(96 Index) | 12610ES96 | 96 T |
建庫模塊 | 產(chǎn)品編號 | 規(guī)格 |
Hieff NGS® Fast-Pace DNA Fragmentation Reagent | 12609ES24/96 | 24/96 T |
Hieff NGS® Ultima DNA Ligation Module | 12604ES24/96 | 24/96 T |
Hieff NGS® Ultima Endprep Mix | 12605ES24/96 | 24/96 T |
Hieff NGS® Fast-Pace DNA Ligation Module | 12607ES24/96 | 24/96 T |
Hieff NGS® Fast-Pace End Repair/dA-Tailing Module | 12608ES24/96 | 24/96 T |
2×Ultima Amplification Mix | 12620ES24/96 | 24/96 T |
2×Super Canace®Ⅱ High-Fidelity Mix | 12621ES03/08 | 24/96 T |
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Hieff NGS® FFPE DNA Repair Reagent | 12606ES24/96 | 24/96 T |
文庫定量 | 產(chǎn)品編號 | 規(guī)格 |
Hieff NGS® Library Quantification Kit for Illumina®, qPCR Master Mix | 12302ES05 | 500 T |
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