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Millipore的Amicon®Ultra超濾管的使用方法
閱讀:2190 發(fā)布時(shí)間:2023-11-15默克 Millipore Amicon® Ultra 離心式超濾管因其wan美的設(shè)計(jì)一經(jīng)推出即成為生物樣品操作的產(chǎn)品。不論是蛋白、核酸、病毒或顆粒物,抑或低濃度樣品或?qū)氋F的活性樣品,Amicon® Ultra 都能兼顧高回收率和操作的方便性及標(biāo)準(zhǔn)化,并滿足下游各種應(yīng)用的要求,使研究者處理樣品時(shí)倍感輕松。但是,在默克生命科學(xué)團(tuán)隊(duì)推出超濾管中文說明書(AU0.5/4/15)之前,我們發(fā)現(xiàn)近90%的使用者在選擇和使用過程中因?yàn)槿狈Ρ匾畔⒍鴽]有獲得最佳體驗(yàn),更重要的是,寶貴的樣本會(huì)遭受本可避免的損失!
選對(duì)截留分子量,事半功倍
如果目的蛋白是120kDa,請(qǐng)問應(yīng)該選擇的超濾管規(guī)格是100k,50k,還是30k甚至10k?你采用的是1/2,1/3抑或1/6算法?這些沒有統(tǒng)一的說法,是因?yàn)椴煌瑥S家的膜的截留分子量的定義不同。Millipore的超濾管采用其有的再生纖維素膜,定義為:一個(gè)確定NMWL 的超濾膜應(yīng)該截留至少90% 以上的這個(gè)大小的球形分子,即100kDa的球形蛋白用100k的Ultracel®再生纖維素膜得率超過90%。請(qǐng)仔細(xì)查看以下默克生命科學(xué)數(shù)據(jù):
(以0.5mL的AU0.5為例,其它型號(hào)截留分子量的選擇原則一致,具體離心力和離心時(shí)間不同。)
截留分子量選小啦!看到這個(gè)表,你是否發(fā)現(xiàn)原來抱怨Millipore超濾管流速偏慢的根源來自對(duì)于Millipore截留分子量定義的誤解。膜孔徑要小于目的分子這是第一原則。如果分子有近似球形的立體結(jié)構(gòu)(而非明顯的線性分子),在Millipore再生纖維素超濾膜體系內(nèi),選擇“等于"或“略小于"目的分子的截留分子量的超濾管是zui選擇,這樣操作起來又快又好,既保證了樣品回收率,又縮短了離心時(shí)間,大幅降低大分子損傷風(fēng)險(xiǎn)。
Amicon® Ultra系列超濾管產(chǎn)品需要根據(jù)起始樣品體積、目標(biāo)蛋白或核酸的分子量、終體積及濃縮倍數(shù)等選擇具體型號(hào)。下表為選擇適合截留分子量的超濾管提供了一些參考建議。
收取體積已經(jīng)很小的濃縮好的樣品時(shí),你會(huì):
A 購(gòu)買最尖細(xì)的槍頭,把樣品吸回來
B 濃縮倍數(shù)低一點(diǎn),以便用槍頭把樣品吸回來
C 反轉(zhuǎn)離心回收,獲得最高得率
正確答案“C",你答對(duì)了么?
Millipore的Amicon® Ultra系列超濾管上樣體積有0.5/2/4/15/70mL等五種,除了采用低吸附的管材和低蛋白吸附的再生纖維素超濾膜,其中0.5mL,2mL和70mL的規(guī)格還特別設(shè)計(jì)了反轉(zhuǎn)回收模式,以便使已經(jīng)濃縮的樣品回收。
現(xiàn)在你總該知道為什么收到AU0.5的時(shí)候會(huì)有兩個(gè)外管了吧~
更多關(guān)于超濾管的正確使用問題:
蛋白在濃縮時(shí)出現(xiàn)了沉淀,如何改進(jìn)?
蛋白如果濃縮過快或者過度濃縮都有可能引起蛋白沉淀。建議蛋白濃縮后的最終濃度不超過20mg/ml。對(duì)于對(duì)濃縮速度敏感而容易沉淀的蛋白,建議的改進(jìn)方法是:
1)離心力降為推薦離心力的30%-50%
2)改用截留分子量更大的超濾管(如原本選用10k,此時(shí)可以選擇30k)
3)在濃縮過程中取出超濾管,用槍頭反復(fù)吹吸幾次后再繼續(xù)濃縮
4)體積較大的樣品可考慮選用攪拌式超濾杯,減少沉淀的發(fā)生。
Amicon® Ultra超濾管可以用酒精消毒滅菌么?
Amicon® Ultra與70%乙醇是兼容的,但是對(duì)滅菌處理的具體方法沒有做相關(guān)的測(cè)試,所以無法提供更進(jìn)一步的參考信息。建議采用Ultrafree無菌離心管對(duì)濃縮后的樣品進(jìn)行過濾除菌。
Amicon® Ultra超濾裝置是否可以用于高壓滅菌?
Amicon® Ultra都是采用熱封設(shè)計(jì),不可以用高壓高溫滅菌。
懷疑濃縮過程中目的蛋白和超濾膜之間可能存在非特異性吸附,如何改善?
Amicon® Ultra超濾管使用的是再生纖維素膜,這種材質(zhì)是蛋白吸附的超濾膜。但是對(duì)于一些疏水性蛋白或非極性蛋白,它們和膜的非特異吸附可能會(huì)增強(qiáng)。對(duì)于這種情況,可以嘗試在實(shí)驗(yàn)前對(duì)超濾管進(jìn)行封閉處理,也可以嘗試換成Amicon® Ultra 0.5或2來進(jìn)行實(shí)驗(yàn),通過減小膜面積來降低非特異性吸附。
有時(shí)候用超濾離心管連水都離不下來,可能是什么原因?
Amicon® Ultra超濾膜中含有微量甘油。如果出現(xiàn)這種情況,請(qǐng)先用0.1 N NaOH清洗再離心。最后用緩沖液或Milli-Q®水再次清洗后甩干。清洗后的濾膜應(yīng)立即使用,如暫時(shí)不用,請(qǐng)保持潤(rùn)濕狀態(tài),避免重新干燥。
如果要用超濾的方法分離兩種蛋白,那么這兩個(gè)蛋白的大小需要相差多少?
按照經(jīng)驗(yàn),建議兩個(gè)蛋白的分子量要相差一個(gè)數(shù)量級(jí)(10倍)。
說明書中推薦在室溫下進(jìn)行離心,考慮到蛋白的穩(wěn)定性,是否可以在4℃進(jìn)行離心?
可以,但是低溫會(huì)增加蛋白樣品的粘性,導(dǎo)致流速減慢,建議可將離心時(shí)間延長(zhǎng)到原來的1.5倍。
濃縮后發(fā)現(xiàn)濃縮液中沒有目的蛋白,可能的原因有哪些?
首先,Amicon® Ultra超濾管的蛋白zui低起始濃度為25ug/ml。請(qǐng)確保樣本的起始濃度大于這個(gè)濃度。其次,如果問題仍然出現(xiàn),請(qǐng)不要丟棄樣本濾過液以便用于分析可能的原因:
1)如果目的樣本在濾過液中,那么請(qǐng)排查:
a) 是否選擇了合適截留分子量的超濾管(目的蛋白分子量的1/2或者1/3)?
b)使用的離心力是否是在限定范圍內(nèi)?如果使用的是rpm,請(qǐng)換算成相應(yīng)的g離心力,具體換算方法請(qǐng)垂詢。
c)離心機(jī)最近是否有校準(zhǔn)過?
d)是否嘗試這個(gè)蛋白?如果能確保用同樣的超濾管對(duì)其它蛋白成功操作的話,那么有可能是這個(gè)目的蛋白的原因。有時(shí)蛋白會(huì)因其本身的一些特性(構(gòu)象差異)而影響濃縮效果,建議選用更小截留分子量的超濾管(如原本選用30k,此時(shí)可以選擇10k)
2)如果目的樣本也不在濾過液中,那么:
a)蛋白樣本起始濃度是否大于25ug/mL?
b)用來確定樣本濃度的方法是什么?是否可信?
c)目的蛋白是不是沉淀了?如果是,具體解決方法請(qǐng)參考上面的關(guān)于蛋白沉淀問題的解釋。