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2019-5-20 閱讀(4203)
2018年腫瘤治療的偉大突破必然有一篇是關(guān)于NTRK Fusion的，隨著LOXO-101和LOXO-292的數(shù)據(jù)披露，優(yōu)異的臨床數(shù)據(jù)讓科學家、投資者都非?？春?，2018年11月FDA加速批準larotrectinib上市，僅有30多人的Loxo Oncology被禮來lilly以80億美元收購，同時NCCN指南更新，NTRK寫入2019非小細胞肺癌指南，NTRK的巨大成功也帶來了Basket Trial和Umbrella Trial的重新思考，NTRK fusion的人群占比不是很高(Figure 1)，但是選擇合適的病人入組，帶來了優(yōu)異的緩釋率，Basket Trial方案被越來越多的臨床實驗考慮，選擇病人入組顯得尤為重要，那我們?nèi)绾芜x擇病人？
首先介紹下NTRK的致病機理：
1. 三個NTRK基因（NTRK1，NTRK2和NTRK3）分別編碼TRK蛋白，依次為TRKA，TRKB和TRKC；
2. 作為跨膜蛋白，這些激酶通過配體依賴性起作用，將細胞外信號傳遞到細胞核，刺激細胞生長，增殖和存活，如MAPK / ERK和PI3K / AKT途徑(Figure 2)；
3. NTRK基因融合導致嵌合體蛋白表達，他保留TRK激酶結(jié)構(gòu)域，但不保留配體結(jié)合域。NTRK基因傾向于與管家基因融合，一旦融合，具有組成型活性。因此導致各種組織類型的實體瘤發(fā)生(Figure 3)。
如何檢測NTRK translocation or Fusion？(Figure 4)
Immunohistochemistry(IHC)：PDA批準了abcam的Anti-Pan TRK antibody，能同時測NTRK1、NTRK2、NTRK3，不能區(qū)分是wide-type還是Fusion，同時不是所有的基因融合都導致蛋白高表達。
DNA fluorescence in situ hybridization(FISH)：FISH是根據(jù)融合設(shè)計探針，每個融合類型都需要單獨設(shè)計，未知融合信息的就沒法設(shè)計和檢測。
相比較而言NGS是合適的選擇，其中RNA-Seq為適合，因為DNA層面的斷點一般在內(nèi)含子，內(nèi)含子較大，且往往GC比例高，擴增檢測和生信分析，都會遇到問題，而且不能確定是否轉(zhuǎn)錄，而RNA-seq，斷點明確，容易檢測到，靈敏度高，可以檢測到所有融合信息，也明確發(fā)生了轉(zhuǎn)錄。
因此RNA-seq是臨床選擇病人合適的方法，市場急需對應(yīng)的檢測試劑盒上市，國外已經(jīng)有一些試劑盒被批上市，國內(nèi)暫時還沒有NTRK的檢測試劑盒被批。
好的試劑盒離不開好的標準品，科佰生物推出NTRK RNA標準品，助力臨檢試劑盒的開發(fā)。
現(xiàn)在已經(jīng)開發(fā)的位點如下，全部經(jīng)過QC驗證
