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Rubicon PicoPLEX 全基因組擴增用于單細(xì)胞無創(chuàng)產(chǎn)前檢測

閱讀:2605發(fā)布時間:2018-5-23

 

Rubicon PicoPLEX

英文名:Rubicon PicoPLEX WGA Kit

中文名:Rubicon單細(xì)胞全基因組擴增試劑盒

 

 單細(xì)胞或6pg基因組DNA起始的全基因組DNA擴增試劑盒。

 單個反應(yīng)管、3小時,3步反應(yīng)的簡單操作流程(手動操作時間只需要15分鐘)。

 適合拷貝數(shù)變異分析(CNV)、染色體異倍性(aneuploidy)分析。

 

PicoPLEX WGA Kit采用技術(shù),設(shè)計優(yōu)化用于從單細(xì)胞中擴增基因組DNA。起始樣本量低至單細(xì)胞或6pg基因組DNA。便捷的單管操作流程降低污染節(jié)省時間。結(jié)果穩(wěn)定性、重復(fù)性好。

 

應(yīng)用推薦:PGS/PGD,單細(xì)胞NIPT,循環(huán)腫瘤細(xì)胞分析

 

Rubicon PicoPLEX用于NIPT的文獻(xiàn)

文獻(xiàn)范圍:2014年以后發(fā)表的文獻(xiàn)

應(yīng)用概述:PicoPLEX單細(xì)胞擴增所得文庫在下游單細(xì)胞的STR、CNV、SNP等遺傳變異檢測表現(xiàn)良好,適用于單細(xì)胞產(chǎn)前無創(chuàng)檢測。

 

1. 

文獻(xiàn):Short Tandem Repeat analysis after Whole Genome Amplification of single B-lymphoblastoid cells.(B淋巴母細(xì)胞系單細(xì)胞全基因組擴增后的微衛(wèi)星分析)

Lieselot Deleye(Laboratory of Pharmaceutical Biotechnology, Ghent University根特大學(xué)藥物生物技術(shù)實驗室),et al.

Scientific Reportsvolume 8, Article number: 1255 (2018)

 

遺傳變異檢測:短串聯(lián)重復(fù)序列,英文Short Tandem Repeat,簡稱STR。又稱微衛(wèi)星(Microsalite),簡單重復(fù)序列(英語:Simple Sequence Repeats,SSRs)。

 

意義:使用單細(xì)胞全基因組擴增(WGA)試劑,以用于下游的單細(xì)胞微衛(wèi)星分析??捎糜诨趩渭?xì)胞檢測的無創(chuàng)產(chǎn)前檢測。

 

Rubicon PicoPLEX作用:PicoPLEX雖然沒有檢測到所有微衛(wèi)星標(biāo)記,但仍適用于臨床單細(xì)胞的遺傳學(xué)鑒別。

 

2.

文獻(xiàn):STR profiling and Copy Number Variation analysis on single, preserved cells using current Whole Genome Amplification methods.(使用現(xiàn)行全基因組擴增方法對單個保存細(xì)胞進(jìn)行STR和染色體拷貝數(shù)變異分析)

Ann-Sophie Vander Plaetsen(Laboratory of Pharmaceutical Biotechnology, Ghent University根特大學(xué)藥物生物技術(shù)實驗室),et al.

Scientific Reportsvolume 7, Article number: 17189 (2017)

 

遺傳變異檢測

STR

CNV:英文 Copy Number Variation,染色體拷貝數(shù)變異

 

意義:單細(xì)胞無創(chuàng)產(chǎn)前檢測等液體活檢因為細(xì)胞的稀有和脆弱,需要更的單細(xì)胞分析技術(shù)。PicoPLEX等單細(xì)胞全基因組擴增試劑盒可以對微量DNA進(jìn)行無偏向的WGA擴增,以用于下游STR和CNV分析。

 

方法:細(xì)胞用Streck Cell-Free DNA BCT 采血管保存,使用PicoPLEX等WGA試劑盒進(jìn)行單細(xì)胞全基因組擴增后進(jìn)行STR與CNV分析。

Rubicon PicoPLEX作用:在幾種WGA試劑盒中,PicoPLEX表現(xiàn)良好,對于STR和CNV均適用。

 

3.

文獻(xiàn):Performance of four modern whole genome amplification methods for copy number variant detection in single cells.(四種全基因組擴增方法用于單細(xì)胞拷貝數(shù)變異檢測的性能表現(xiàn))

Lieselot Deleye(Laboratory of Pharmaceutical Biotechnology, Ghent University根特大學(xué)藥物生物技術(shù)實驗室),et al.

 

遺傳變異檢測:CNV

 

意義:單細(xì)胞全基因組擴增技術(shù)可用于胚胎植入前遺傳診斷,單細(xì)胞無創(chuàng)產(chǎn)前檢測和循環(huán)腫瘤細(xì)胞的液體活檢。即PGD、NIPT和CTC。

 

Rubicon PicoPLEX作用:PicoPLEX試劑擴增單細(xì)胞后,適合通過低深度全基因組大規(guī)模平行測序(MPS,又名NGS)進(jìn)行CNV分析。

 

4.

文獻(xiàn):Evidence for feasibility of fetal trophoblastic cell‐based noninvasive prenatal testing.(胎兒滋養(yǎng)細(xì)胞用于單細(xì)胞無創(chuàng)產(chǎn)前檢測可行性的證據(jù))

Amy M. Breman(Department of Molecular and Human Genetics, Baylor College of Medicine貝勒醫(yī)學(xué)院 分子與人類遺傳學(xué)系),et al.

PRENATAL DIAGNOSIS,First published: 12 September 2016.

 

遺傳變異檢測:染色體和亞染色體變異

意義:通過孕早期(10-16周期)母體血液獲得胎兒細(xì)胞,單細(xì)胞全基因組擴增后,進(jìn)行基因分型。

 

方法

擴增:WGA技術(shù)

分析:array CGH 或 NGS

 

Rubicon PicoPLEX作用:用于單細(xì)胞全基因組擴增。

 

5.

文獻(xiàn):Comparison of three whole genome amplification methods for detection of genomic

aberrations in single cells.(三種用于單細(xì)胞基因組結(jié)構(gòu)異常檢測的全基因組擴增方法比較)

Elizabeth Normand(Department of Molecular and Human Genetics, Baylor College of Medicine貝勒醫(yī)學(xué)院 分子與人類遺傳學(xué)系),et al.

PRENATAL DIAGNOSIS,First published: 02 July 2016

 

Keywords: Whole genome amplification, array CGH, genotyping, non-invasive prenatal

diagnosis, fetal cells

關(guān)鍵詞:全基因組擴增,微陣列比較基因組雜交,基因分型,無創(chuàng)產(chǎn)前診斷,胎兒細(xì)胞

 

遺傳變異檢測:染色體拷貝數(shù)異常

意義:比較了三種商業(yè)全基因組擴增(WGA)試劑盒從單細(xì)胞中獲得高質(zhì)量DNA的能力。結(jié)果顯示W(wǎng)GA試劑所得DNA文庫適合用于單細(xì)胞分子分型和拷貝數(shù)分析。

 

Rubicon PicoPLEX作用:PicoPLEX相比其他品牌試劑盒對于非固定細(xì)胞的SNP檢測較好。

 

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RB3050 / R30050

 PicoPLEX WGA Kit

50Rxns

 

 

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