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[供應(yīng)]BD Rhapsody 單細(xì)胞分析系統(tǒng),RNA轉(zhuǎn)錄組分析
產(chǎn)地：美國(guó)
更新時(shí)間：2024-11-25 09:38:08
有效期：2024年11月25日 -- 2025年5月28日
已獲點(diǎn)擊：2010
捕獲并分離細(xì)胞，通過(guò)磁珠對(duì)細(xì)胞和mRNA轉(zhuǎn)錄本進(jìn)行分類(lèi)
分子標(biāo)簽可以克服PCR偏差
可以定制靶向組合（panel）
提供數(shù)據(jù)分析工具
產(chǎn)品英文名：BD RhapsodyTM Single-Cell Analysis System
產(chǎn)品中文名：BD RhapsodyTM 單細(xì)胞分析系統(tǒng)
應(yīng)用：?jiǎn)渭?xì)胞的RNA-seq測(cè)序，基因表達(dá)分析。Onco-BC 靶向檢測(cè)，免疫反應(yīng)檢測(cè)，T-細(xì)胞靶向檢測(cè)。
優(yōu)勢(shì)：同時(shí)分析數(shù)千個(gè)細(xì)胞，每個(gè)細(xì)胞提取獨(dú)立數(shù)據(jù)，體現(xiàn)異質(zhì)性。
品牌產(chǎn)地：美國(guó)BD
BD RhapsodyTM 單細(xì)胞分析系統(tǒng)及更多BD產(chǎn)品由華雅再生醫(yī)學(xué)旗艦公司：紅榮微再（上海）生物工程技術(shù)有限公司 代理。紅榮微再以“傳遞科學(xué)價(jià)值，服務(wù)科學(xué)研究”為宗旨，主營(yíng)干細(xì)胞、精準(zhǔn)醫(yī)療、細(xì)胞治療、器官再生四大板塊的產(chǎn)品。
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BD RhapsodyTM 單細(xì)胞分析系統(tǒng)
數(shù)千個(gè)單細(xì)胞數(shù)百個(gè)基因的平行分析
單細(xì)胞 RNAseq 正在改變我們對(duì)細(xì)胞的理解。BDRhapsody™單細(xì)胞分析系統(tǒng)基于 BD 在細(xì)胞生物學(xué)領(lǐng)域 40年的專(zhuān)業(yè)技術(shù)，滿(mǎn)足您的實(shí)驗(yàn)需求，在單細(xì)胞水平理解細(xì)胞形態(tài)和功能。
這種全新的分析系統(tǒng)克服了傳統(tǒng)檢測(cè)的局限性，例如微陣列和大量細(xì)胞 RNAseq，這些檢測(cè)通過(guò)實(shí)現(xiàn)對(duì)各個(gè)細(xì)胞之間的微妙差異的觀察，依賴(lài)于對(duì)多個(gè)細(xì)胞的平均檢測(cè)。用戶(hù)可以鑒定和表征新型和罕見(jiàn)細(xì)胞類(lèi)型，其進(jìn)一步幫助理解從免疫學(xué)到腫瘤學(xué)等多個(gè)領(lǐng)域內(nèi)的生物學(xué)過(guò)程。
BD Rhapsody 單細(xì)胞分析系統(tǒng)能夠?qū)Τ汕先f(wàn)個(gè)單細(xì)胞的數(shù)百個(gè)表達(dá)基因進(jìn)行數(shù)字定量，提供足夠靈活的定制測(cè)定法以滿(mǎn)足任何實(shí)驗(yàn)需要，其有效系統(tǒng)可縮短實(shí)驗(yàn)時(shí)間和降低測(cè)序成本。
系統(tǒng)組件包括：
□ BD Rhapsody 掃描儀
□ BD Rhapsody 上樣臺(tái)
□ BD Rhapsody 卡式芯片
□ 分子標(biāo)簽試劑和文庫(kù)制備
□ 特定應(yīng)用的靶向檢測(cè)試劑盒（panel）
BD Rhapsody 單細(xì)胞分析系統(tǒng)工作原理
下圖顯示了該系統(tǒng)如何實(shí)現(xiàn)對(duì)數(shù)百個(gè)基因的基因表達(dá)水平進(jìn)行數(shù)字化定量。其采用新的平面陣列微孔用于細(xì)胞捕獲并進(jìn)行基于微球的 3'RNAseq 測(cè)定。
開(kāi)始 - 細(xì)胞捕獲和分離步驟
BD Rhapsody 卡式芯片可以在磁性的寡核苷酸條形碼標(biāo)記微球上實(shí)現(xiàn)單細(xì)胞捕獲和 mRNA 轉(zhuǎn)錄子的分子標(biāo)簽。然后將這些微球合并到單個(gè)管中用于 cDNA 擴(kuò)增和文庫(kù)構(gòu)建。
1.在微孔中，一個(gè)細(xì)胞與一個(gè)條碼標(biāo)記微球匹配
2.裂解細(xì)胞將 mRNA與微球上條碼標(biāo)記的捕獲寡核苷酸雜交
3. 微球回收
4. cDNA 合成
5. 測(cè)序和構(gòu)建單細(xì)胞基因表達(dá)譜
圖： mRNA 捕獲和文庫(kù)制備步驟。
克服 PCR 偏差 – BD 分子標(biāo)簽
當(dāng)對(duì)序列讀取進(jìn)行計(jì)數(shù)時(shí)，PCR 擴(kuò)增偏差可導(dǎo)致基因定量不準(zhǔn)確。BD 的分子標(biāo)簽技術(shù)為單個(gè)細(xì)胞的單個(gè)基因分配了*的分子索引，也稱(chēng)為“分子條形碼”。實(shí)驗(yàn)者可借此克服擴(kuò)增偏差，更準(zhǔn)確地計(jì)算轉(zhuǎn)錄水平。
為您的實(shí)驗(yàn)定制工作流程
對(duì)于不同用戶(hù)和實(shí)驗(yàn)，單細(xì)胞實(shí)驗(yàn)工作流程往往需要不同程度的樣本操作、質(zhì)量和通量。BD 儀器選項(xiàng)可以根據(jù)具體需求進(jìn)行配置。BD FACS 分選機(jī)（如 BD FACSMelody™）是 BD Rhapsody 系統(tǒng)上游樣本富集的良好選擇。BD Rhapsody掃描儀提供自動(dòng)化細(xì)胞計(jì)數(shù)和細(xì)胞樣本活性測(cè)試，幫助用戶(hù)制備適用于卡式芯片單細(xì)胞捕獲的*濃度的樣本。掃描儀提供了卡式芯片上微球捕獲細(xì)胞的計(jì)數(shù)。BD Rhapsody 上樣臺(tái)輕巧便攜，可在實(shí)驗(yàn)室內(nèi)輕松移動(dòng)。同樣還提供生物信息學(xué)途徑和可視化工具。這些工具包括 UMI 分析算法和可視化工具，即使沒(méi)有經(jīng)驗(yàn)的用戶(hù)也可分析和理解單細(xì)胞數(shù)據(jù)。
圖. 實(shí)例：BD Rhapsody 工作流程，包括細(xì)胞分離（FACS 可選），細(xì)胞捕獲和分子標(biāo)簽、測(cè)序和數(shù)據(jù)分析。
1. 樣本
2. 通過(guò) BD Rhapsody 進(jìn)行單細(xì)胞
3. 在 Illumina 平臺(tái)上進(jìn)行測(cè)序
4. BD 基因組數(shù)據(jù)分析
更有效的測(cè)序可以更低的成本實(shí)現(xiàn)更高的通量
由于與高通量實(shí)驗(yàn)方法相關(guān)的測(cè)序成本，單細(xì)胞實(shí)驗(yàn)往往非常昂貴。BD Rhapsody 單細(xì)胞分析系統(tǒng)設(shè)計(jì)有多個(gè)功能，可以更有效地利用測(cè)序來(lái)降低實(shí)驗(yàn)成本。
靶向測(cè)定 - 由于檢測(cè)靈敏度的提高，特定的基因組合方法可使用少量的時(shí)間和成本，幫助產(chǎn)生類(lèi)似于全轉(zhuǎn)錄組分析（Whole Transcriptome Analysis，WTA）測(cè)定的結(jié)果。這種方法還提高了 UMI 計(jì)數(shù)效率，從而極大程度的節(jié)省了實(shí)驗(yàn)時(shí)間和成本。
儲(chǔ)存 - 從樣本中得到的完整 cDNA 可在磁性微球上穩(wěn)定存儲(chǔ)，允許將珍貴樣本保存長(zhǎng)達(dá) 16 周。這可使用戶(hù)在時(shí)間允許的情況下靈活地對(duì)樣本進(jìn)行測(cè)序，并通過(guò)對(duì)儲(chǔ)存的微球池進(jìn)行等分或分樣來(lái)實(shí)現(xiàn)同一樣本的多個(gè)測(cè)定。
分樣—在磁性微球上儲(chǔ)存的 cDNA A 可以分成一個(gè)或多個(gè)等分試樣，并使用定制或預(yù)先設(shè)計(jì)的組合（panel）進(jìn)行擴(kuò)增。通過(guò)提供對(duì)部分樣本進(jìn)行測(cè)序的選項(xiàng)和對(duì)樣本不同組合（panel）進(jìn)行測(cè)試的靈活性，分樣可降低成本。
評(píng)估 BD Rhapsody 的性能
為了確定 BD Rhapsody 單細(xì)胞分析系統(tǒng)的技術(shù)性能，將人 293T 和小鼠 NIH / 3T3 細(xì)胞的 1：1 混合物以不同濃度上樣到 BD Rhapsody 卡式芯片上。儲(chǔ)存的 cDNA 分子普遍擴(kuò)增并進(jìn)行低通量測(cè)序（每個(gè)細(xì)胞約8,700 個(gè)讀數(shù)）。在測(cè)序數(shù)據(jù)中檢測(cè)到 1,109 個(gè)細(xì)胞的上樣條件下，每個(gè)細(xì)胞中，來(lái)自每個(gè)細(xì)胞的平均 99.4％的分子經(jīng)檢測(cè)僅為人或小鼠，這表明微孔之間的串?dāng)_非常小。在測(cè)序數(shù)據(jù)中檢測(cè)到 1，000 個(gè)或更少細(xì)胞的上樣密度下，多重態(tài)發(fā)生率接近零，并且在 15，000 個(gè)細(xì)胞下小于 5％。
圖：使用 BD Rhapsody 的微孔之間的zui小串?dāng)_和低多重態(tài)率
使單細(xì)胞測(cè)序效率更高
靶向方法對(duì)單細(xì)胞分析的益處通過(guò)使用競(jìng)爭(zhēng)產(chǎn)品的WTA 測(cè)定和 BD Rhapsody 免疫反應(yīng)組合（panel）（人）在相似的測(cè)序深度下對(duì)外周血單核細(xì)胞（PBMC）進(jìn)行表達(dá)譜分析來(lái)證明。雖然兩種測(cè)定方法的 t-SNE 表達(dá)譜分析都顯示了已知 PMBC 細(xì)胞類(lèi)型的聚類(lèi)結(jié)果，靶向組合（panel）顯示了比 WTA 更高的靈敏度（讀數(shù)/細(xì)胞）和 UMI 計(jì)數(shù)效率。BD Rhapsody 測(cè)定實(shí)現(xiàn)了與競(jìng)品 WTA 測(cè)定類(lèi)似的聚類(lèi)性能，而測(cè)序讀數(shù)降低了近 10 倍（靶向讀數(shù) 2k vs. WTA 讀數(shù) 20k）。與使用 WTA 方法不同，靶向組合（panel）避免了對(duì)多個(gè)高表達(dá)基因的測(cè)序如核糖體蛋白或低表達(dá)變異性，從而提高測(cè)定效率。
競(jìng)爭(zhēng)產(chǎn)品 WTA 3'RNA-seq
BD Rhapsody 靶向
圖：實(shí)例結(jié)果顯示競(jìng)品 WTA 和 BD Rhapsody 靶向測(cè)定之間的測(cè)定靈敏度和 UMI 計(jì)數(shù)效率。通過(guò)避免具有低變異性的高表達(dá)蛋白質(zhì)（例如核糖體蛋白質(zhì)），靶向測(cè)定產(chǎn)生高質(zhì)量的聚類(lèi)結(jié)果，讀數(shù)顯著減少（2k 對(duì) 20k），從而降低測(cè)序成本。
混合微球的測(cè)試儲(chǔ)存（參見(jiàn)下圖），從含有稀少轉(zhuǎn)移性乳腺癌細(xì)胞的淋巴結(jié)所得的 1，000 個(gè)細(xì)胞的兩個(gè)分樣使用BD Rhapsody Onco-BC 靶向組合（panel）進(jìn)行分析。在 4℃下保存微球，在 0、6 和 12 周對(duì)樣本進(jìn)行測(cè)定。在分樣之間基因表達(dá)具有很強(qiáng)的相關(guān)性，表明儲(chǔ)存 cDNA 具有極小的批次效應(yīng)和較高的穩(wěn)定性。
主要應(yīng)用的靶向基因檢測(cè)試劑盒（panel）
靶向方法有助于提高單細(xì)胞測(cè)序效率，并推動(dòng)對(duì)當(dāng)今一些挑戰(zhàn)性的科學(xué)領(lǐng)域的進(jìn)一步探索。我們經(jīng)驗(yàn)證的檢測(cè)試劑盒（panel）顯示穩(wěn)定且可重現(xiàn)的細(xì)胞異質(zhì)性陣列，可用于探索與眾多應(yīng)用相關(guān)的細(xì)胞類(lèi)型。BD Rhapsody 系統(tǒng)包括以下檢測(cè)試劑盒（panel）：
● BD Rhapsody Onco-BC 靶向檢測(cè)試劑盒（panel） – 與乳腺癌和免疫細(xì)胞相關(guān)的 400 個(gè)基因
● BD Rhapsody 免疫反應(yīng)檢測(cè)試劑盒（panel） – 免疫細(xì)胞類(lèi)型譜分析
● BD Rhapsody T-細(xì)胞靶向檢測(cè)試劑盒（panel）
● BD Rhapsody 補(bǔ)充檢測(cè)試劑盒（panel）
● BD Rhapsody 自定義檢測(cè)試劑盒（panel）
高級(jí)軟件和可視化功能增加您結(jié)果的靈活性
BD Rhapsody 系統(tǒng)還提供生物信息學(xué)途徑和可視化工具。這些工具包括 UMI 分析算法和可視化工具，即使沒(méi)有經(jīng)驗(yàn)的用戶(hù)也能夠分析和理解單細(xì)胞數(shù)據(jù)。
1. 序列發(fā)生器輸出.fastq 文件
- 多路分用 讀數(shù)；調(diào)準(zhǔn)讀數(shù)
- 計(jì)算每個(gè)細(xì)胞每個(gè)基因的*分子標(biāo)識(shí)符（UMI）
- 執(zhí)行 UMI 調(diào)整算法
- 進(jìn)行細(xì)胞標(biāo)記篩選
- 單細(xì)胞表達(dá)譜
BD Rhapsody 系統(tǒng)數(shù)據(jù)集可從 www.xxxxx。。ｃｏｍ 下載
實(shí)例數(shù)據(jù)集：
◎ 來(lái)自健康捐贈(zèng)者的 PMBC 的單細(xì)胞譜分析
◎ T 細(xì)胞表型分析
◎ 乳腺癌腫瘤活檢的單細(xì)胞譜分析
單細(xì)胞研究的完整端到端系統(tǒng)
BD Rhapsody 單細(xì)胞分析系統(tǒng)通過(guò)完整的工具系統(tǒng)（包括試劑和分析軟件）來(lái)加強(qiáng)和簡(jiǎn)化您的研究，這些工具可以協(xié)同工作，以滿(mǎn)足您*的單細(xì)胞實(shí)驗(yàn)需求。我們將使您直接通過(guò)樣本獲取結(jié)果，同時(shí)使用實(shí)驗(yàn)成本和復(fù)雜性顯著降低的測(cè)定方法節(jié)省時(shí)間和成本，改善數(shù)據(jù)和提高測(cè)序效率。40 年來(lái)，BD 一直是單細(xì)胞生物學(xué)領(lǐng)域值得信賴(lài)的合作伙伴。您可以依靠我們來(lái)幫助您拓展單細(xì)胞分析的新領(lǐng)域。
BD RhapsodyTM 單細(xì)胞分析系統(tǒng)及更多BD產(chǎn)品由華雅再生醫(yī)學(xué)旗艦公司：紅榮微再（上海）生物工程技術(shù)有限公司 代理。紅榮微再以“傳遞科學(xué)價(jià)值，服務(wù)科學(xué)研究”為宗旨，主營(yíng)干細(xì)胞、精準(zhǔn)醫(yī)療、細(xì)胞治療、器官再生四大板塊的產(chǎn)品。
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