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北京普天同創(chuàng)生物科技有限公司

研究發(fā)現(xiàn)具有乙烷厭氧功能的古菌及其代謝途徑

時(shí)間:2019-4-17 閱讀:2674
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3月28日,學(xué)術(shù)刊物《自然》(Nature)在線發(fā)表了關(guān)于乙烷厭氧生物氧化的研究論文“Anaerobic oxidation of ethane by archaea from a marine hydrocarbon seep”,報(bào)道了具有乙烷厭氧功能的古菌及其代謝途徑。該研究由德國(guó)亥姆霍茲環(huán)境研究中心(UFZ)Florin Musat團(tuán)隊(duì)、中國(guó)科學(xué)院生態(tài)環(huán)境研究中心朱永官團(tuán)隊(duì)和德國(guó)Max-Planck海洋微生物研究所Freidrich Widdel團(tuán)隊(duì)聯(lián)合完成。中科院生態(tài)中心博士生陳松燦為作者,德國(guó)亥姆霍茲環(huán)境研究中心Florin Musat為論文的通訊作者。

天然氣,包括甲烷、乙烷、丙烷和丁烷等氣態(tài)烷烴,是海洋及陸地生態(tài)系統(tǒng)中有機(jī)碳庫的重要組分,其形成和分解對(duì)地球環(huán)境和氣候變化影響極大。在海洋及陸地環(huán)境中,天然氣從巖層深部向上擴(kuò)散至油氣藏上部沉積物及土壤,是其間微生物重要的碳源及能源。甲烷厭氧氧化是海洋底泥及土壤中普遍存在的微生物過程。此外,近期的研究表明丙烷和丁烷等小分子烷烴也能在無氧條件下被古菌或者細(xì)菌氧化利用。相反,乙烷,作為天然氣中第二豐富的烷烴,是否能夠被微生物厭氧降解尚不明確。

該研究通過富集培養(yǎng)、熒光原位雜交、宏基因組、宏蛋白組以及宏代謝組技術(shù)揭示了乙烷厭氧氧化古菌及其代謝機(jī)制。研究所用的共培養(yǎng)體系能夠在硫酸鹽還原條件下將乙烷*氧化為二氧化碳。古菌為該富集體系的主導(dǎo)微生物菌群,作者將其命名為Candidatus Argoarchaeum ethanivorans;Ca. Argoarchaeum基因組含有甲基輔酶M還原酶(methyl-coenzyme M reductase,MCR)所有編碼基因,且對(duì)應(yīng)的基因表達(dá)產(chǎn)物在宏蛋白組中被檢測(cè)。利用傅里葉回旋共振質(zhì)譜以及液相色譜-質(zhì)譜技術(shù),該研究進(jìn)一步確認(rèn)了中間代謝產(chǎn)物乙基輔酶M(ethyl-coenzyme M)的存在。這些結(jié)果表明Ca. Argoarchaeum通過合成乙基輔酶M來催化乙烷的活化,與近期報(bào)道的Ca. Syntrophoarchaeum厭氧丁烷氧化的機(jī)制相似。宏蛋白質(zhì)組學(xué)分析表明乙烷氧化生成的中間產(chǎn)物乙酰輔酶A通過Wood Ljungdahl途徑被氧化為二氧化碳。Ca. Argoarchaeum及其功能基因在深海天然氣滲漏環(huán)境中廣泛分布,暗示Ca. Argoarchaeum所介導(dǎo)的乙烷氧化可能是海洋環(huán)境中氣態(tài)烷烴生物降解的重要途徑。

該研究團(tuán)隊(duì)長(zhǎng)期致力于氣態(tài)烷烴厭氧氧化的研究,并取得系列成果和進(jìn)展,包括在世界上分離培養(yǎng)了具有丙烷和丁烷降解功能的硫還原細(xì)菌Desulfosarcina sp. BuS5(Nature,2007);報(bào)道了嗜熱丁烷氧化古菌Ca. Syntrophoarchaeum butanivorans及其代謝途徑(Nature,2016)。該研究發(fā)現(xiàn)了乙烷厭氧氧化古菌,*長(zhǎng)期以來科學(xué)界對(duì)氣態(tài)烷烴厭氧氧化過程認(rèn)識(shí)上的空白,拓展了人們對(duì)MCR酶功能特異性的理解,開啟了對(duì)土壤環(huán)境(如濕地和稻田等)中烷烴厭氧過程的新探索。同時(shí),該研究能夠?yàn)闇p少小分子烷烴的大氣排放提供新的思路,也可為開發(fā)油氣藏微生物勘探技術(shù)提供科學(xué)依據(jù)和方向。

該研究得到中科院戰(zhàn)略性先導(dǎo)專項(xiàng)B(XDB15020302和XDB15020402)的資助。

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