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研究建成小鼠腸道微生物資源庫(kù)
1月7日,《自然-通訊》發(fā)表了中國(guó)科學(xué)家完成的小鼠腸道微生物資源庫(kù)工作。
腸道微生物是近年來(lái)生命科學(xué)和健康領(lǐng)域研究的前沿和熱點(diǎn)。越來(lái)越多的證據(jù)表明,腸道微生物與宿主健康和生長(zhǎng)發(fā)育密切相關(guān),在未來(lái)人體健康管理和醫(yī)療產(chǎn)業(yè)發(fā)展中,具有十分重要的作用。腸道微生物資源庫(kù)的建設(shè),是開(kāi)發(fā)利用腸道微生物的基礎(chǔ),是認(rèn)知宿主—微生物互作機(jī)制和開(kāi)發(fā)微生物藥物的關(guān)鍵。
此次報(bào)道的小鼠腸道微生物資源庫(kù)包括126種微生物及其基因組。其中77種微生物是*成功分離培養(yǎng)的新物種,并對(duì)其進(jìn)行了分類學(xué)鑒定和命名,這些新物種的發(fā)現(xiàn)和鑒定,大幅度提高了對(duì)于小鼠腸道菌群高通量16SrRNA擴(kuò)增子測(cè)序數(shù)據(jù)的物種注釋比例。該小鼠菌株資源庫(kù)覆蓋了超過(guò)88%小鼠腸道的核心屬,其基因組代表了超過(guò)52%的小鼠腸道微生物的非冗余功能基因集。該資源庫(kù)的構(gòu)建使得可培養(yǎng)的小鼠腸道微生物菌株資源從48個(gè)屬增加到110個(gè)屬、從76種增加到180種,為后續(xù)基于小鼠模型開(kāi)展腸道菌-宿主互作機(jī)理研究和功能菌株開(kāi)發(fā)奠定了資源基礎(chǔ)。研究人員前期利用該資源庫(kù)中的一株狄氏副擬桿菌開(kāi)展了腸道菌群與宿主互作的研究,發(fā)現(xiàn)狄氏副擬桿菌通過(guò)產(chǎn)生琥珀酸、次級(jí)膽酸來(lái)激活不同的信號(hào)通路,發(fā)揮多靶點(diǎn)整體調(diào)節(jié)作用,是一種潛在的、新型抗代謝綜合征益生菌(Wangetal.2019.CellRep.)。
該項(xiàng)工作由中國(guó)科學(xué)院微生物研究所博士劉暢等人完成,研究員劉雙江和劉宏偉為文章通訊作者。該項(xiàng)工作歷時(shí)二年多,得到了中科院微生物組計(jì)劃項(xiàng)目和國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目的支持。