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質(zhì)粒小科普

質(zhì)粒(Plasmid)是廣泛存在于生物界中的環(huán)狀雙鏈DNA分子。目前在細菌、放線菌、真菌和不少動植物細胞中均發(fā)現(xiàn)有質(zhì)粒的存在，其中細菌質(zhì)粒是研究最深入、應(yīng)用較廣泛的^[1]。因為質(zhì)粒分子本身具有復(fù)制功能的遺傳結(jié)構(gòu)，可攜帶一些遺傳信息，并且其自我復(fù)制能力和攜帶遺傳信息能力非常強大，經(jīng)過基因表達后可使其宿主細胞表現(xiàn)相應(yīng)的性狀，所以質(zhì)粒常被用作基因載體，在分子生物學(xué)、生物化學(xué)與細胞生物學(xué)等學(xué)科中得到廣泛的應(yīng)用^[2]。

圖1 大腸桿菌質(zhì)粒分子結(jié)構(gòu)示意圖

質(zhì)粒提取方法及原理

質(zhì)粒的提取是分子克隆中常用的一種技術(shù)，即去除RNA，將質(zhì)粒與細菌基因組DNA分開，去除蛋白質(zhì)及其它雜質(zhì)，以得到相對純凈的質(zhì)粒的過程。質(zhì)粒的質(zhì)量直接影響到基因操作的后續(xù)步驟，如轉(zhuǎn)化、酶切和序列分析等，因此獲得足夠量的質(zhì)粒是質(zhì)粒應(yīng)用的重要一步。生物學(xué)實驗中質(zhì)粒的獲取方式主要是通過在大腸桿菌中擴增，從而獲取大量的含有目的基因的載體質(zhì)粒。其主要過程是對感受態(tài)細菌進行轉(zhuǎn)化，挑取克隆菌落，在LB培養(yǎng)基中搖菌進行擴增和質(zhì)粒抽提^[3]?？蒲泄ぷ髡咭呀?jīng)開發(fā)出很多質(zhì)粒抽提的方法，目前普遍采用的質(zhì)粒提取方法主要有堿裂解法、煮沸法、SDS裂解法和有機溶劑法等。堿裂解法提取質(zhì)粒具有得率高，適用面廣、快速、純度高等特點，因此堿裂解法目前被廣泛采用。下面著重介紹堿裂解法提取質(zhì)粒的原理。

圖2 質(zhì)粒提取過程

堿裂解法提取質(zhì)粒主要原理是利用共價閉合環(huán)狀質(zhì)粒和線性染色質(zhì)在拓撲學(xué)上的差異。利用NaOH和SDS溶液使細胞裂解，在堿性溶液中，線性的大分子量細菌染色體DNA氫鍵斷裂，雙螺旋結(jié)構(gòu)遭破壞而發(fā)生變性，但由于質(zhì)粒DNA分子量相對較小，且呈環(huán)狀超螺旋結(jié)構(gòu)，即使在高堿性pH條件下，兩條互補鏈也不會充分分離。當(dāng)加入中性緩沖液調(diào)和時，變性的質(zhì)粒DNA又恢復(fù)到原來的構(gòu)型，而染色體DNA不能復(fù)性，它們之間交聯(lián)形成不溶性網(wǎng)狀結(jié)構(gòu)，并與細胞碎片、蛋白質(zhì)、SDS等結(jié)合沉淀下來。通過離心沉淀，細胞碎片、染色體DNA及大部分蛋白質(zhì)等可被除去，而質(zhì)粒DNA小分子量的RNA留在上清液中，混雜的RNA用RNaseA除去。一些可溶性蛋白，可通過酚/氯仿抽提除去，最后獲得純度較高的質(zhì)粒DNA。由于堿裂解法的眾多優(yōu)勢，市面上大多數(shù)的質(zhì)粒抽提試劑盒基本采用的方法是堿裂解法。

質(zhì)粒提取分類

大多數(shù)實驗室都會選擇基于堿裂解法的質(zhì)粒提取試劑盒來提取質(zhì)粒，根據(jù)不同的樣本量及獲取目標質(zhì)粒的產(chǎn)量分為質(zhì)粒小提、質(zhì)粒中提、質(zhì)粒大提。

1、質(zhì)粒小提

質(zhì)粒小提主要是對于1-5mL的菌液中質(zhì)粒DNA進行小量提取，獲得的質(zhì)粒用來進行常規(guī)的載體構(gòu)建實驗。

Absin金牌產(chǎn)品：無內(nèi)毒素高純度質(zhì)粒小量快速提取試劑盒（abs60023）

1、采用改進SDS-堿裂解法裂解細胞，粗提物通過過濾柱除去內(nèi)毒素； 
2、離心吸附柱內(nèi)硅基質(zhì)膜全部采用進口特制吸附膜，柱與柱之間吸附量差異極小，可重復(fù)性好。
3、特殊的去蛋白液配方，可以高效去除核酸酶。即使是核酸酶含量豐富的菌株如JM系列、HB101也可以輕松去除。有效防止了質(zhì)粒被核酸酶降解。
4、特別內(nèi)毒素清除方法，清除內(nèi)毒素效果一般小于<0.1EU/μg。

Absin質(zhì)粒小提產(chǎn)品清單：

2、質(zhì)粒中提

質(zhì)粒中提是在質(zhì)粒小提的基礎(chǔ)上進一步去除菌液中的內(nèi)毒素，獲得的質(zhì)?？梢杂糜诩毎D(zhuǎn)染，常規(guī)需要菌液量為10-15mL。

3、質(zhì)粒大提

質(zhì)粒大提與中提方法相同，一次可對100-200mL菌液進行抽提，從而獲得大量質(zhì)粒。

Absin金牌產(chǎn)品：去內(nèi)毒素中大量質(zhì)粒富集提取試劑盒（abs60300）

1、高效提取中大量菌液質(zhì)粒DNA，提取菌液量：5mL、10mL、20mL、50mL、100mL或以上；
2、提取質(zhì)粒DNA純度高，可高效去除質(zhì)粒中污染的內(nèi)毒素，內(nèi)毒素去除率可高達90%以上，有效提升質(zhì)粒轉(zhuǎn)染實驗的成功率；
3、真空濃縮，大幅提升洗脫液中質(zhì)粒DNA濃度，DNA濃度可達2ug/uL以上；
4、用于培養(yǎng)菌液樣本中質(zhì)粒DNA的提取，提取后的質(zhì)粒DNA可用于細胞轉(zhuǎn)染、酶切、PCR、測序、體外轉(zhuǎn)錄與翻譯、構(gòu)建文庫等多種分子生物學(xué)實驗。

Absin質(zhì)粒中提、大提產(chǎn)品清單：

質(zhì)粒提取其實并不難，但是選擇符合我們實驗的質(zhì)粒提取方法和試劑盒非常重要，因為又快又好地提取出符合下游實驗要求的質(zhì)粒，無疑會對我們的實驗起到錦上添花的作用。

本期的分子小課堂就到這里啦，祝大家實驗順利，我們下期再見啦！

[1] Lars M?lbak, Tett A, Ussery D W, et al. The plasmid genome database.[J]. Microbiology, 2003, 149(Pt 11):3043-5. DOI:10.1099/mic.0.C0123-0.

[2] Diaz Ricci J C ,Hernández ME. Plasmid Effects on Escherichia coli Metabolism[J]. Critical Reviews in Biotechnology, 2000, 20(2):79-108. DOI:10.1080/07388550008984167.

[3] Li G , Liu J , Chen N, et al. A new method to recover L-tyrosine from E. coli fermentation broth A new method to recover L-tyrosine from E. coli fermentation broth[J].Bioengineered, 2020, 11(1):1080-1083.DOI:10.1080/21655979.2020.1827893.

好消息！Absin文獻獎勵重磅升級！

Absin特色產(chǎn)品線：

WB相關(guān)：ECL發(fā)光液、預(yù)染marker、預(yù)制膠；IHC相關(guān)：二抗試劑盒、組化筆；IP/CoIP試劑盒；激動劑/抑制劑；血清、BSA、蛋白酶K、CTB、TTX、CEE；凋亡試劑盒；呼吸爆發(fā)試劑盒；ELISA試劑盒；重組蛋白；抗體: 二抗、標簽抗體、對照抗體；定制服務(wù)(抗體/多肽/蛋白/標記/檢測)...