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艾美捷CUT&Tag技術(shù):信噪比高,重復(fù)性好
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更新時(shí)間:2024-06-08 21:00:07

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CUT&Tag In-Place-Sequencing,用于快速富集與蛋白質(zhì)結(jié)合的DNA,并繪制全基因組蛋白質(zhì)/DNA相互作用圖。具有“兩高一低"的優(yōu)勢(shì):高分辨、高時(shí)效以及低輸入。

CUT&Tag是蛋白質(zhì)-DNA互作關(guān)系研究的新方法,2019年弗雷德哈欽森癌癥研究中心的Henikoff博士在Nature Communication公開(kāi)了該技術(shù)的詳細(xì)結(jié)果與實(shí)驗(yàn)方案。與以往的ChIP-Seq、pA-MNase等方法相比,這種技術(shù)方法簡(jiǎn)便易行,信噪比高,重復(fù)性好,需要的細(xì)胞數(shù)量少至60個(gè)細(xì)胞,且有望將ChIP-Seq做到單細(xì)胞水平。

 

開(kāi)發(fā)的技術(shù),使用核酸酶在靶標(biāo)下切割和釋放(CUT&RUN-sequencing)以及在靶標(biāo)下切割和標(biāo)記(CUT&Tag-sequencing),用于從低輸入材料來(lái)繪制蛋白質(zhì)-DNA相互作用,并顯著提高了映射分辨率。然而,這兩種技術(shù)的成本都較高。CUT&RUN-sequencing使用昂貴的 pA/MNase融合蛋白,該蛋白具有顯著的A/T序列偏差,導(dǎo)致目標(biāo)蛋白結(jié)合的DNA 區(qū)域譜受到MNase消化水平的嚴(yán)重影響。CUT&Tag-sequencing顯示出相同的消化偏差,并且由于Tn5轉(zhuǎn)座酶導(dǎo)致染色質(zhì)的脫靶可及性,因此特異性較低。

 

為解決這些問(wèn)題,EpiGentek開(kāi)發(fā)了兩種新技術(shù)—CUT&RUN FastCUT&Tag In-Place-Sequencing,用于快速富集與蛋白質(zhì)結(jié)合的DNA,并繪制全基因組蛋白質(zhì)/DNA相互作用圖。新技術(shù)具有“兩高一低"的優(yōu)勢(shì):高分辨、高時(shí)效以及低輸入。

 

艾美捷 EpiGente CUT&RUN和CUT&Tag技術(shù)來(lái)了。特別是 EpiQuik CUT&RUN M6A RNA富集試劑盒(P-9018)和EpiNext CUT&RUN M6A RNA-Seq試劑盒(P-9016),可以在zui小的非特異性背景水平上,從低輸入RNA樣本中特異性捕獲和富集含有m6A修飾的RNA片段。富集的 RNA 特別適用于快速構(gòu)建非條形碼(單重)和條形碼(多重)文庫(kù),允許以更小的偏差和高分辨率繪制 m6A 區(qū)域。

 

結(jié)果展示:

艾美捷 CUT&Tag技術(shù) 相關(guān)研究工具:

cat# 名稱(chēng)   時(shí)長(zhǎng)

P-2028 EpiNext CUT&RUN Fast Kit  <3小時(shí)

P-9018 EpiQuik CUT&RUN m6A RNA Enrichment (MeRIP) Kit  <3小時(shí)


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