每種途徑的啟動都會產(chǎn)生與目標(biāo)表面結(jié)合的蛋白水解酶復(fù)合物（C3 轉(zhuǎn)化酶）。這些酶會裂解 C3 中的一個肽鍵，釋放出無性毒素 C3a 并激活 C3b。在短暫的時間內(nèi)（約 60 微秒），這種新生的 C3b 能夠與目標(biāo)表面的羥基反應(yīng)并共價偶聯(lián)。碳水化合物是首要目標(biāo)，但蛋白質(zhì)羥基和氨基也會發(fā)生反應(yīng)。這種用 C3b 標(biāo)記目標(biāo)表面的過程被稱為 "超聲化"（opsonization）。新生 C3b 的反應(yīng)位點是硫代酯（Tack B.J. 等人（1980 年）；Pangburn M.K. 和 MüllerEberhard H.J. （1980 年）），C3b 通過共價酯鍵（如果 C3b 與氨基相連，則形成酰胺鍵）與目標(biāo)相連。補體激活過程中活化的大部分 C3 從未附著到表面，因為其硫代酯與水反應(yīng)形成液相 C3b，而液相 C3b 會被因子 H 和 I 迅速滅活，形成 iC3b。