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干貨:WB, IHC實驗問題總結(jié)與處理方案

時間:2024/7/9閱讀:141
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1、western blot 的優(yōu)點

答:靈敏,可達ng級,用Ecl顯色法理論上可達pg 級。方便,特異性高。


2、為什么我的細胞提取液中沒有目標蛋白?

答:原因有很多:

a) 你的細胞中不表達這種蛋白質(zhì),換一種細胞;

b) 你的細胞中的蛋白質(zhì)被降解掉了,你必須加入PMSF,抑制蛋白酶活性;

c) 你的抗體不能識別目標蛋白,多看看說明,看是否有問題。


3、我的細胞提取液有的有沉淀,有的很清亮,為什么呢?

答:a) 有沉淀可能因為你的蛋白沒有變性完,可以適當提高SDS 濃度,同時將樣品煮沸時間延長, b) 也不排除你的抗原濃度過高,這時再加入適量上樣緩沖液即可。


4、我做的蛋白質(zhì)分子量很?。?0KD),請問怎么做WB?

答:可以選擇0.2μml的膜,同時縮短轉(zhuǎn)移時間。也可以將兩張膜疊在一起,再轉(zhuǎn)移。其他按步驟即可。


5、我的目的帶很弱,怎么加強?

答:可以加大抗原上樣量。這是最主要的。同時也可以將一抗稀釋比例降低。


6、膠片背景很臟,有什么解決方法?

答:減少抗原上樣量,降低一抗?jié)舛?,改變一抗孵育時間,提高牛奶濃度。


7、目標帶是空白,周圍有背景,是為什么?

答:你的一抗?jié)舛容^高,二抗上HRP 催化活力太強,同時你的顯色底物處于一個臨界點,反應時間不長,將周圍底物催化完,形成了空白即“反亮現(xiàn)象"。將一抗和二抗?jié)舛冉档?,或更換新底物。


8、我的膠片是一片空白,是怎么回事?

答:如果能夠排除下面的幾個問題那么問題多半出現(xiàn)在一抗和抗原制備上。

a) 二抗的HRP 活性太強,將底物消耗光;

b) ECM底物中H2O2,不穩(wěn)定,失活;

c) ECL底物沒覆蓋到相應位置;

d) 二抗失活。


9、我在顯影液中顯影1分鐘和5分鐘后,底片漆黑一片,是什么原因呢?

答:a) 可能是紅燈造成的, 膠片本來就被曝光了,可以在黑暗的情況下操作.看是否有改善.;b) 顯影時間過長。


10、DAB好還是ECM好?

答:DAB 有毒,但是比較靈敏,是HRP 最敏感的底物;ECM結(jié)果容易控制,但被催化時靈敏度差一點,但如果達到閥值,就特別靈敏,可以檢測pg 級抗原。要看你實驗的情況。


11、抗原檢測出的分子量比資料上的大,是怎么回事?

答:a)抗原形成了二聚體。增多巰基乙醇量,煮沸變性時間延長,可以打開二聚體。b)蛋白本身的修飾如:糖基化,磷酸化等。


12、蛋白轉(zhuǎn)移不到膜上,但膠上有,同時Marker 轉(zhuǎn)上去了,為什么?

答:可能是:a)樣品濃度過低;b)轉(zhuǎn)移時間不夠。


13、磷酸化抗體的檢測樣本制備時是否一定要加NaF等?

答:NaF是一種廣譜磷酸化酶的抑制劑,一般最好加。但是不加也可以,大部分時候是不用加的。


14、要驗證某個細胞上有無該蛋白的存在,需要做免疫組化和western blot試驗嗎?做這兩個試驗時的一抗和二抗可以共用嗎?

答:① 免疫組化可以用來進行定位,但是不能精確定量,而且有時會有假陽性,不易與背景區(qū)分;Western blot可以特異性檢測某個蛋白質(zhì)分子,進行定量,但是不能定位。

② 兩種實驗的一抗有時候不能通用,公司的產(chǎn)品說明一般都會說明可以進行什么實驗,在免疫組化時,是否適合石蠟切片或者冰凍切片。


15、做Western Blot時,提取蛋白后凍存(未加蛋白酶抑制劑),用的博士德的一抗,開始還有點痕跡,現(xiàn)在越來越差,上樣量已加到120μg,換了個santa cloz的一抗仍不行。是什么原因?蛋白酶抑制劑單加PMSF行嗎?

答:懷疑是樣品問題,可能是:

1,樣品不能反復凍融;

2,樣品未加蛋白酶抑制劑。同時,建議檢查Western Blot過程, 提高一抗?jié)舛?。對于加蛋白酶抑制劑來說,一般加PMSF就可以了,最好能多加幾種蛋白酶抑制劑。


16、細胞水平要做western blot,多少細胞提的蛋白夠做western blot?

答:一般5×10^6就足夠了。


17、同一樣品能同時提RNA又提蛋白么?這樣對western blot有無影響?

答:能,沒有問題。


18、同一蛋白樣品能同時進行兩種因子的Western Blot檢測嗎?

答:當然可以,有的甚至可以同時測幾十種樣品。


19、如果目標蛋白是膜蛋白或是胞漿蛋白,操作需要注意什么?

答:如果是膜蛋白和胞漿蛋白,所用的去垢劑要溫和得多,這時最好加上NaF去抑制磷酸化酶的活性。


20、我的樣品的蛋白含量很低,每微升不到1微克,但是在轉(zhuǎn)膜時經(jīng)常會發(fā)現(xiàn)只有一部分蛋白轉(zhuǎn)到了膜上,就是在轉(zhuǎn)膜后染膠發(fā)現(xiàn)有的孔所有的蛋白條帶都在,只是顏色變淡了,有什么辦法可以解決?

答:你可以加大上樣量,沒有問題,還有轉(zhuǎn)移時你可以用減少電流延長時間,加20%甲醇。

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