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貨物所在地：河北保定市
更新時間：2024-05-27 17:07:40
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在功能基因組學和表觀遺傳學研究中，轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點（TFBS）的發(fā)掘一直是研究熱點。傳統(tǒng)的ChIP-seq（染色質(zhì)免疫共沉淀測序）方法，在抗體質(zhì)量很好的情況下能夠有效檢測到TFBS。然而，好的抗體可遇不可求，這限制了ChIP-seq更廣泛的應用。DAP-seq技術(shù)的出現(xiàn)，使TFBS 的研究不再局限于物種，不再受抗體質(zhì)量的限制，為生命科學領(lǐng)域轉(zhuǎn)錄因子的研究提供了新的有效工具。
DAP-seq與ChIP-seq技術(shù)對比：
| 技術(shù)名稱 | DAP-seq | ChIP-seq |
| 實驗模式 | 體外 | 體內(nèi) |
| 是否需要特異性抗體 | 否 | 是 |
| 是否適用于非模式物種 | 是 | 否 |
| 時間成本 | 低 | 高 |
| 是否高通量 | 是 | 否 |
| 服務項目 | 周期 | 交付結(jié)果 | 報價 |
| 蛋白表達載體構(gòu)建 | 1-2周 | 構(gòu)建載體的測序結(jié)果 實驗過程圖 原始測序數(shù)據(jù) 分析結(jié)果 | 詳細報價請咨詢 |
| 蛋白無細胞表達 | 1-2周 | ||
| DAP-seq文庫構(gòu)建 | 1周 | ||
| DNA親和純化 | 1-2周 | ||
| 上機測序 | 2周 | ||
| 標準數(shù)據(jù)分析 | 2周 |
| 生信分析 |
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|
| 項目可行性分析 |
開展項目之前，我們會根據(jù)您具體的轉(zhuǎn)錄因子做可行性分析報告，供您參考，從多個方面進行可行性分析，包括轉(zhuǎn)錄因子分子量，亞細胞定位預測，跨膜區(qū)預測，蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域預測、翻譯后修飾預測，并且根據(jù)文獻報道和我們的經(jīng)驗來進行可行性分析。
| 已做物種 | ||||||||
| 植物 | ||||||||
| 擬南芥 | 莖瘤芥 | 甘藍型油菜 | 白菜型油菜 | 不結(jié)球白菜 | 菜心 | 小麥 | 大麥 | 花生 |
| 辣椒 | 番茄 | 草莓 | 黃花棘豆 | 苦蕎 | 紅薯 | 木薯 | 馬鈴薯 | 普通煙草 |
| 人參 | 鴨茅 | 海島棉 | 甘蔗 | 短芒大麥草 | 二色補血草 | 煙草 | 百脈根 | 芍藥 |
| 丹參 | 狗尾草 | 菠菜 | 玉米 | 大豆 | 高粱 | 藜麥 | 陸地棉 | 甜瓜 |
| 黃瓜 | 葡萄 | 灰氈毛忍冬 | 粉葛 | 三葉青 | 獼猴桃 | 香蕉 | 蒺藜苜蓿 | 紫花苜蓿 |
| 伴礦景天 | 苔蘚 | 地錢 | 毛果楊 | 717楊 | 84K楊 | 小黑楊 | 胡楊 | 山新楊 |
| 小葉楊 | 歐美楊 | 大青楊 | 毛白楊 | 剛毛檉柳 | 白樺 | 光皮樺 | 油松 | 毛竹 |
| 麻竹 | 銀杏 | 油桐 | 荔枝 | 柑橘 | 甜橙 | 歐洲云杉 | 核桃 | 柿子 |
| 閩楠 | 木荷 | 臍橙 | 板栗 | 棗 | 枳 | 杜梨 | 蘋果 | 桃 |
| 櫻桃 | 麻瘋樹 | 茶樹 | 梅 | 月季 | ||||
| 動物 | ||||||||
| 驢 | 飛蝗 | 新孢子蟲 | ||||||
| 真菌 | ||||||||
| 擬輪枝鐮孢菌 | 豬苓真菌 | 意大利青霉 | 草酸青霉 | 腐霉 | 金黃殼囊孢 | 靈芝 | 糙皮側(cè)耳 | 草菇 |
| 灰蓋鬼傘 | 蟲草 | 亞洲鐮刀菌 | ||||||
| 細菌 | ||||||||
| 路德維希腸桿菌 | 嗜熱厭氧桿菌 | 生氮假單胞菌 | 伯克赫爾德氏菌 | 布魯氏菌 | 肺炎克雷伯菌 | |||
我們可為您提供DNA親和純化測序（DAP-seq）技術(shù)服務和個性化數(shù)據(jù)分析，具有100多個物種，1000多個轉(zhuǎn)錄因子的實驗經(jīng)驗，歡迎咨詢。
參考文獻：
O'Malley RC, Huang SC, Song L, Lewsey MG, Bartlett A, Nery JR, Galli M, Gallavotti A, Ecker JR. Cistrome and Epicistrome Features Shape the Regulatory DNA Landscape. Cell. 2016. 165(5):1280-1292. doi: 10.1016/j.cell.2016.04.038.
2016-Cell-DAP Seq-Cistrome and Epicistrome Features Shape the Regulatory DNA Landscape.pdf
Bartlett A, O'Malley RC, Huang SC, Galli M, Nery JR, Gallavotti A, Ecker JR. Mapping genome-wide transcription-factor binding sites using DAP-seq. Nat Protoc. 2017. (8):1659-1672. doi: 10.1038/nprot.2017.055.
2017-Nature Protocols-Mapping genome-wide transcription-factor binding sites using DAP-seq.pdf
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