心肌細(xì)胞收縮力評(píng)估測(cè)量分析系統(tǒng)
背景及系統(tǒng)重要性
心血管疾病是球死亡的重要原因。為了開(kāi)發(fā)新的治療策略,許多研究將分離的心肌細(xì)胞(CM)作為藥物發(fā)現(xiàn)的平臺(tái)或作為研究心臟病潛在機(jī)制的體外模型。
分離的心肌細(xì)胞也被廣泛用于回答有關(guān)心臟細(xì)胞生理學(xué)的基本問(wèn)題,并表征疾病發(fā)展過(guò)程中發(fā)生的興奮-收縮耦合的變化。
分析分離CM的一個(gè)重要參數(shù)是收縮性,它提供了反映其細(xì)胞功能的信息。收縮力的測(cè)量已被廣泛用于成人和新生兒肌細(xì)胞的研究
細(xì)胞膜變形是許多生理過(guò)程中發(fā)生的重要特征,其研究已被很好地用于研究心肌細(xì)胞功能。目前市面上沒(méi)單一平臺(tái)設(shè)備上提供一種直接的方法來(lái)獲取、處理和量化這種類型的細(xì)胞動(dòng)力學(xué)。
我們引進(jìn)歐美進(jìn)口的CMWave系統(tǒng)在單個(gè)平臺(tái)中結(jié)合了一種強(qiáng)大的方法,內(nèi)置的用戶友好、簡(jiǎn)潔直觀的界面,通過(guò)圖像捕獲和光流獲取、可視化、分析和量化不同發(fā)育階段的心肌細(xì)胞的收縮參數(shù)。
高性能算法可以快速準(zhǔn)確地自動(dòng)處理大數(shù)據(jù)圖像文件。此外, 還提供了一種創(chuàng)新方法,可以同時(shí)顯示在與運(yùn)動(dòng)矢量及其各自的圖形表示相關(guān)的收縮-松弛周期中獲得的細(xì)胞圖像。
因此,該系統(tǒng)將高處理能力和靈活性與用戶友好界面相結(jié)合,提供了涉及藥物篩選和心臟病建模的實(shí)驗(yàn)室和生物技術(shù)公司所需的解決方案。
用戶能夠通過(guò)圖像捕獲和密集光流算法在收縮-松弛循環(huán)期間獲取細(xì)胞收縮性的膜動(dòng)力學(xué)數(shù)據(jù)。可用于檢查疾病動(dòng)物模型中心肌細(xì)胞收縮力的變化以及藥物發(fā)現(xiàn)期間的藥理學(xué)和毒理學(xué)篩選。
該系統(tǒng)可以讓用戶以簡(jiǎn)單直觀的格式可視化、量化和分析細(xì)胞收縮參數(shù)。應(yīng)用密集光流同時(shí)測(cè)量細(xì)胞收縮力和電生理學(xué)參數(shù)。
系統(tǒng)特性:
1、使用密集光流量化細(xì)胞收縮性-精準(zhǔn)、快速、信息豐富:
光流是物體在連續(xù)序列幀之間的運(yùn)動(dòng),由物體和相機(jī)之間的相對(duì)運(yùn)動(dòng)引起,密集光流為每幀的每個(gè)像素計(jì)算光流矢量,提供了更準(zhǔn)確的結(jié)果和更密集的結(jié)果。
光流標(biāo)記視頻素材準(zhǔn)確計(jì)算出圖像中每個(gè)點(diǎn)的運(yùn)動(dòng),達(dá)到亞像素精度,光流場(chǎng)是所觀察場(chǎng)景的巨大信息寶庫(kù),看到光流與計(jì)算機(jī)視覺(jué)任務(wù)的應(yīng)用很有趣、很豐富。
光流技術(shù)可以準(zhǔn)確量化與電生理學(xué)結(jié)果密切相關(guān)的 CM 收縮力參數(shù)。隨后基于圖像的研究通過(guò)使用基于光流的不同算法來(lái)表征 CM 收縮參數(shù)。
該系統(tǒng)通過(guò)對(duì)在明場(chǎng)顯微鏡下觀察到的單個(gè)CM進(jìn)行延時(shí)圖像分析來(lái)測(cè)量收縮性。為了獲取細(xì)胞運(yùn)動(dòng),系統(tǒng)根據(jù)光流原理計(jì)算生成圖像的收縮性,計(jì)算密集光流。
該系統(tǒng)的密集光流方法具有以定向矢量的形式報(bào)告運(yùn)動(dòng)方向和以u(píng)m/s為單位的速度校準(zhǔn)測(cè)量的優(yōu)點(diǎn)。不需要高斯濾波器來(lái)獲取細(xì)胞位移,并且與像素強(qiáng)度原理相比,該分析對(duì)光照條件的敏感性較低,后者可以影響收縮幅度參數(shù)。
2、不同于通過(guò)使用捕獲與細(xì)胞收縮和松弛相關(guān)的細(xì)胞運(yùn)動(dòng)的方法來(lái)實(shí)現(xiàn),該系統(tǒng)無(wú)需精密的儀器、經(jīng)驗(yàn)豐富的分析師、高額的財(cái)務(wù)投資和耗時(shí)的實(shí)驗(yàn)。以更準(zhǔn)確和非侵入性地評(píng)估細(xì)胞收縮力,細(xì)胞無(wú)損傷。
3、不同于通過(guò)測(cè)量細(xì)胞邊界運(yùn)動(dòng)的邊緣檢測(cè)法,該系統(tǒng)能捕獲整個(gè)細(xì)胞區(qū)域的運(yùn)動(dòng),而不只是分析用戶定義的特定感興趣區(qū)域,在采集和分析處理過(guò)程中給結(jié)果無(wú)偏差。
4、 多線程允許同時(shí)處理多個(gè)大型數(shù)據(jù)集。此外,可以實(shí)時(shí)跟蹤圖像處理的進(jìn)度,并且可以在處理新數(shù)據(jù)集的同時(shí)進(jìn)行數(shù)據(jù)分析。
5、可以靈活調(diào)整設(shè)置:
具有可用于大多數(shù)細(xì)胞實(shí)驗(yàn)的光流默認(rèn)設(shè)置,但該程序允許用戶根據(jù)圖像質(zhì)量或細(xì)胞類型調(diào)整和選擇蕞佳實(shí)驗(yàn)參數(shù) 。為了以物理單位 (um/s) 提供細(xì)胞運(yùn)動(dòng)的測(cè)
量值,用戶需要插入實(shí)驗(yàn)設(shè)置,例如每秒幀數(shù)和像素大小 (um)。
6、讓用戶可以選擇單個(gè)收縮周期或多個(gè)周期的平均值。在波檢測(cè)窗口中,一旦做出選擇,將顯示二個(gè)顯示所選間隔的縮放版本的圖以幫助用戶選擇檢測(cè)到的感興
趣的波進(jìn)行分析。
7、細(xì)胞收縮力和電生理學(xué)參數(shù)同步高通量量化分析:
8、使用戶能夠通過(guò)圖像捕獲在收縮-松弛循環(huán)期間獲取有關(guān) 心肌細(xì)胞CM 膜動(dòng)力學(xué)的數(shù)據(jù)
(A) 樣本圖像顯示在成人 CM 的收縮-松弛周期中,通過(guò)視覺(jué)和數(shù)字強(qiáng)度尺度檢測(cè)的幅度和矢量場(chǎng)檢測(cè)膜運(yùn)動(dòng)。比例尺,40 微米。
(B) 左側(cè),從電刺激 CM 中的一個(gè)收縮-松弛周期中獲取的樣本平均速度波。(B) 中用羅馬數(shù)字標(biāo)識(shí)的所有點(diǎn)對(duì)應(yīng)于 (A) 中定義的收縮周期的階段。
右圖是在收縮-放松周期中獲得的收縮波形參數(shù)總結(jié)。
9、可以獲取成人 CM 細(xì)胞長(zhǎng)度的縮短百分比
10、提供了一種創(chuàng)新的解決方案,可滿足在收縮-松弛周期中量化心臟細(xì)胞生物力學(xué)和運(yùn)動(dòng)動(dòng)力學(xué)所需的高處理能力和靈活性。
使用密集光流算法,與舊的光流方法相比,它對(duì)“窗口大小"的選擇不太敏感。這意味著不需要為每個(gè)類似的應(yīng)用程序優(yōu)化光流參數(shù)的顯著變化。
此外,該算法的二個(gè)優(yōu)點(diǎn)是它計(jì)算圖像中所有像素的位移,從而提高靈敏度。
為了驗(yàn)證該系統(tǒng),我們研究了三種成熟的心肌細(xì)胞類型模型的收縮性:
(1) 急性分離的成年小鼠或大鼠心室肌細(xì)胞 (adult-CMs);
(2) 培養(yǎng)的新生兒-CMs;和 (3) hiPSC-CM
在成人肌細(xì)胞收縮中的應(yīng)用
該系統(tǒng)被理想化和開(kāi)發(fā)以消除光學(xué)邊緣檢測(cè)和分割方法的局限性,例如在成人 CM 的采集過(guò)程中對(duì)適當(dāng)?shù)募?xì)胞對(duì)齊和細(xì)胞旋轉(zhuǎn)的要求(Delbridge 和 Roos,1997 年;Ren 和 Wold , 2001年) . 為了測(cè)試我們方法的有效性和敏感性,我們將細(xì)胞暴露于對(duì)收縮參數(shù)有明確影響的藥物。成人 CM 接受異丙腎上腺素 (ISO) (100 nmol L -1 ) 或維拉帕米(VERA) (100 nmol L -1). 異丙腎上腺素是一種 β-腎上腺素能激動(dòng)劑,通過(guò)增加平均速度和縮短長(zhǎng)度的程度顯著增強(qiáng) CM 收縮力,從而減少收縮和松弛所需的時(shí)間(Butler 等人,2015 年;Harmer 等人,2012年)。維拉帕米是一種鈣通道阻滯劑,廣泛用于治療心律失常(Bourgonje 等人,2013 年),同時(shí)也是一種抗高血壓藥,因?yàn)樗谛呐K系統(tǒng)中具有負(fù)性肌力和變時(shí)作用(Harmer 等人,2012 年;斯特恩等人,1986 年)。圖 4Ai-ii 分別顯示了樣本空間圖像和平均速度軌跡,這些記錄是從以 1 Hz 刺激并用異丙腎上腺素或維拉帕米處理 60 秒的細(xì)胞記錄的。圖 4 Aiii 顯示了從一個(gè)收縮-松弛周期獲得的一條平均速度軌跡的放大視圖。圖 4 B–4D顯示了來(lái)自三個(gè)立實(shí)驗(yàn)的異丙腎上腺素和維拉帕米對(duì)成人 CM 收縮參數(shù)影響的濃度響應(yīng)分析。如圖4 B所示,ISO 和 VERA 都減少了收縮和松弛時(shí)間,對(duì)松弛時(shí)間的影響更顯著。此外,ISO 增加了大收縮和松弛速度(圖 4 C)并縮短了面積(圖 4D) 成人 CM 的濃度依賴性方式。當(dāng)用 VERA 處理細(xì)胞時(shí),觀察到相反的效果(圖 4C和 4D)。表 S1列出了用不同濃度的 ISO 和 VERA 處理的成人 CM 獲得的所有收縮參數(shù)。值得注意的是,數(shù)據(jù)分析不需要用戶操作圖像,因?yàn)檐浖梢蕴幚韺?shí)驗(yàn)生成的整個(gè)圖像。
該系統(tǒng) 的另一個(gè)特點(diǎn)是可以獲取成人 CM 細(xì)胞長(zhǎng)度的縮短百分比。在 Motion Visualization 的窗口中(Advanced > Export cell length data— Methods S1:User Manual— section 7.4 Figure 70),用戶可以打開(kāi)一個(gè)新窗口來(lái)測(cè)量細(xì)胞長(zhǎng)度的縮短百分比(圖 S3)。該窗口顯示波選擇框,其中包含先前選擇的收縮-松弛波(圖 S3 A上的藍(lán)色條,左側(cè))及其各自的圖形(圖 S3 A,右側(cè))。該系統(tǒng) 使用細(xì)胞分割過(guò)程來(lái)獲取細(xì)胞邊界長(zhǎng)度并應(yīng)用過(guò)濾器來(lái)找到細(xì)胞的佳分割(圖 S3B). 數(shù)據(jù)可以可視化并實(shí)時(shí)繪制圖表(圖 S3 C)。然后,可以導(dǎo)出分析的波形數(shù)據(jù)。為了驗(yàn)證我們的分割方法,我們通過(guò)使用經(jīng)異丙腎上腺素和維拉帕米處理或未處理的成人 CM 進(jìn)行了縮短細(xì)胞長(zhǎng)度百分比分析。如圖 4 E所示,ISO 增加了成人 CM 細(xì)胞長(zhǎng)度的縮短百分比,而 VERA 減少了它。綜上所述,我們的數(shù)據(jù)表明,該系統(tǒng) 可以可靠、高效地處理和分析來(lái)自成人 CM 的數(shù)據(jù),檢測(cè)藥物作用下收縮參數(shù)的差異。例如,這種敏感性允許研究可能具有心臟保護(hù)作用的藥物,以及與現(xiàn)有心臟病相關(guān)的變化。
該系統(tǒng) 在大鼠高血壓模型中的適用性
收縮力缺陷是高血壓動(dòng)物模型的一個(gè)共同特征(Jesus 等人,2020 年;Kovács 等人,2016 年)。在這里,我們使用了一種充分表征的高血壓大鼠模型,該模型由腎外組織中腎素的基因過(guò)度表達(dá)引起,即 TGR (mREN2)27 大鼠(Langheinrich,1996 年;Mullins 等人,1990 年)。mREN CM 的一個(gè)重要特征是細(xì)胞面積增加,這是心肌肥大的特征(Jesus 等人,2020 年)). 鑒于 該系統(tǒng) 獲取幅度速度的平均值,比較的單元格之間的大小差異越大,獲取可能存在的差異的靈敏度就越低。因此,與 Sprague-Dawley (SD) 大鼠肌細(xì)胞相比,測(cè)量肥大 mREN 肌細(xì)胞的數(shù)據(jù)時(shí)可能會(huì)出現(xiàn)問(wèn)題。為了避免這個(gè)問(wèn)題,我們通過(guò)使用新的過(guò)濾器(幅度閾值)實(shí)現(xiàn)了一個(gè)管道(有關(guān)詳細(xì)信息,請(qǐng)參見(jiàn)方法 S1:用戶手冊(cè)—— 7.3 節(jié),幅度閾值過(guò)濾器)。
圖 4 Fi–ii 顯示了帶有運(yùn)動(dòng)矢量的 CM 圖像以及 SD 和 mREN 肌細(xì)胞的平均速度軌跡的比較。如圖 4 Fiii–iv所示,SD 和 mREN 肌細(xì)胞之間的大收縮或舒張速度沒(méi)有差異。另一方面,與 SD 細(xì)胞相比,該系統(tǒng) 檢測(cè)到 mREN 肌細(xì)胞的收縮和舒張時(shí)間顯著增加(圖 4 Fv-vi)。收縮參數(shù)詳見(jiàn)表S2。這些結(jié)果通過(guò)更詳細(xì)地顯示通過(guò)矢量場(chǎng)的細(xì)胞運(yùn)動(dòng)以及整個(gè)細(xì)胞,擴(kuò)展了先前的發(fā)現(xiàn)( Jesus 等人,2020 年)。
新生兒 CM 培養(yǎng)和 hiPSC-CM 中的 該系統(tǒng) 驗(yàn)證
來(lái)自不同發(fā)育階段的心肌細(xì)胞顯示出功能和結(jié)構(gòu)差異。該系統(tǒng) 旨在獲取 CM 在不同成熟和細(xì)胞發(fā)育階段的多個(gè)實(shí)驗(yàn)條件下的收縮參數(shù)。hiPSC-CM 和新生兒-CM 是未成熟細(xì)胞,與成年心室肌細(xì)胞相比表現(xiàn)出明顯的形態(tài)和結(jié)構(gòu)組織特征(Bedada 等人,2016 年;Khan 等人,2015 年;Li 等人,2017 年;Rohr 等人, 1991). 這種結(jié)構(gòu)上的不成熟會(huì)影響 CM 的收縮性,它比成人 CM 的強(qiáng)度要低得多,并對(duì)其采集和分析提出了挑戰(zhàn)。此外,hiPSC-CM 和新生兒 CM 會(huì)自組織成合胞體并表現(xiàn)出自發(fā)收縮(Bedada 等人,2016 年;Li 等人,2017 年)。
HiPSC-CM 已通過(guò)不同的技術(shù)進(jìn)行探索,以獲得收縮和松弛的細(xì)胞動(dòng)力學(xué)(Czirok 等人,2017 年;Huebsch 等人,2015 年;Maddah 等人,2015 年;Pointon 等人,2017 年)。然而,它們?cè)谘芯亢团R床中心作為常規(guī)應(yīng)用仍然是一個(gè)挑戰(zhàn),要么是由于實(shí)施困難,要么是因?yàn)槿匀蝗鄙倬哂袕?qiáng)大處理能力的工具以及為非專業(yè)觀眾設(shè)計(jì)的界面。該系統(tǒng) 提供了一種可靠、快速且易于訪問(wèn)的方法來(lái)處理和分析這些細(xì)胞類型的收縮動(dòng)力學(xué),從圖像到終結(jié)果集。
使用 該系統(tǒng),我們確定了 hiPSC-CM(圖 5和S4)和新生兒 CM(圖 6 )在基礎(chǔ)控制條件下以及與 ISO 和 VERA 孵育后的收縮和松弛周期的平均速度。圖 5 A 顯示了檢測(cè)所有 hiPSC-CM 合胞體運(yùn)動(dòng)的示例空間圖像,它允許用戶從多個(gè)收縮-松弛周期中提取平均速度軌跡(圖 5 B)。為了在單波水平上更好地了解 ISO 和 VERA 治療,圖 5繪制了每個(gè)特定波的圖表C. ISO 和 VERA 對(duì) hiPSC-CM 的影響也以濃度依賴的方式發(fā)生,并且在速度依賴參數(shù)(圖 S4 A)和平均縮短面積(圖 S4 B)上顯示出相反的結(jié)果,正如我們對(duì)這些藥物的預(yù)期. 正如先前在文獻(xiàn)中報(bào)道的那樣(Hayakawa 等人,2014 年),在使用 ISO 和 VERA 治療后觀察到收縮和舒張時(shí)間的相當(dāng)減少(圖 S4 C)。此外,ISO 和 VERA 增加了 hiPSC-CM 的跳動(dòng)頻率(圖 S4 D)??偠灾?,這些結(jié)果證實(shí)了我們系統(tǒng)的多功能性,為用戶提供了獲得視覺(jué)和定量評(píng)估的可能性通過(guò)微妙的修改不同的收縮細(xì)胞類型。
同樣,圖 6 A 顯示該系統(tǒng)通過(guò)膜位移和運(yùn)動(dòng)矢量的生成,有效檢測(cè) ISO 和 VERA 新生兒 CM 治療組的細(xì)胞收縮力差異(圖 6 Ai-iii )。此外,分析表明,ISO 和 VERA 均以濃度依賴性方式顯著減少新生兒 CM 的收縮和松弛時(shí)間(圖6 B)。正如對(duì)這些藥物所預(yù)期的那樣,用 ISO 治療會(huì)導(dǎo)致速度相關(guān)參數(shù)(圖 6 C)和 CM 縮短區(qū)域(圖 6D),而 VERA 處理的細(xì)胞觀察到減少。此外,該系統(tǒng)檢測(cè)了接受藥物治療或未接受藥物治療的新生兒 CM 的自律。在分析新生兒 CM 的搏動(dòng)頻率時(shí),也觀察到 ISO 和 VERA 的相反結(jié)果(圖 6 E)。hiPSC-CM 和新生兒-CM 在用不同濃度的藥物治療后的收縮參數(shù)分別列于表 S3和S4中。
為了總結(jié)我們的發(fā)現(xiàn),表 S5比較了收縮和松弛速度的大倍數(shù)變化,以及用 ISO 或 VERA 處理的成人 CM、新生兒 CM 和 hiPSC-CM 之間的縮短面積參數(shù)。如表S5所示,與成人 CM 和新生兒 CM 相比,hiPSC-CM 在收縮和松弛速度大倍數(shù)變化方面對(duì) ISO 的響應(yīng)較弱。這一發(fā)現(xiàn)表明,與 hiPSC-CM 相比,新生細(xì)胞的 β-腎上腺素能反應(yīng)有所改善,并表明這兩種細(xì)胞類型之間的成熟度存在差異。盡管成人 CM 和新生兒 CM 具有相似的大倍數(shù)變化值,但前者表現(xiàn)出較低的半數(shù)大有效濃度,證實(shí)了這些細(xì)胞對(duì) ISO 的反應(yīng)更強(qiáng)。這與以下事實(shí)一致:與成人 CM 相比,hiPSC-CM 和新生兒 CM 呈現(xiàn)不成熟的 β-腎上腺素能受體信號(hào)(Jung 等人,2016 年;Slotkin 等人,1995 年)). 然而,與成人 CM 相比,新生兒 CM 和 hiPSC-CM 對(duì) VERA 的反應(yīng)更強(qiáng),在新生兒細(xì)胞中觀察到更明顯的抑制收縮作用。同樣,與成人 CM 相比,新生兒 CM 和 hiPSC-CM 顯示 MCS 對(duì) VERA 的半數(shù)大抑制濃度降低。這些差異至少部分反映了未成熟細(xì)胞對(duì)肌膜 Ca 2+循環(huán)的高度依賴性和未成熟 Ca 2+釋放單元的存在( Korhonen 等人,2009 年;Louch 等人,2015 年)。總的來(lái)說(shuō),這些數(shù)據(jù)增強(qiáng)了我們軟件檢測(cè)細(xì)胞對(duì)不同藥物的收縮反應(yīng)差異的敏感性。
心肌細(xì)胞收縮力評(píng)估測(cè)量分析系統(tǒng)