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高深度、超多重 —— 定義血漿蛋白質(zhì)組學(xué)檢測新高度
血漿蛋白質(zhì)組學(xué)檢測在現(xiàn)代醫(yī)學(xué)與生命科學(xué)領(lǐng)域占據(jù)著舉足輕重的地位。其重要性在于能夠從蛋白質(zhì)層面全面剖析血漿這一復(fù)雜的生物樣本，為眾多疾病的早期診斷提供價值的生物標(biāo)志物。然而，血漿是一個復(fù)雜的樣品，血漿中蛋白質(zhì)種類繁多，數(shù)量可達(dá)上萬種，且濃度分布極不均衡，濃度跨度超過 10 個數(shù)量級，其中前 22 個蛋白質(zhì)約占總蛋白質(zhì)質(zhì)量的 99％。在其他 1％的總蛋白質(zhì)質(zhì)量中發(fā)現(xiàn)了數(shù)千種較不豐富的蛋白質(zhì)，并對生物學(xué)和健康產(chǎn)生重要影響。目前蛋白質(zhì)組研究的主要挑戰(zhàn)是許多當(dāng)前用于研究蛋白質(zhì)的方法在深度或通量方面有限，因此無法訪問足夠強(qiáng)大的研究來檢測生物信號中的數(shù)千種低豐度蛋白質(zhì)。
一、Proteonano™低豐度蛋白組富集技術(shù)：
珞米Proteonano™富集低豐度血漿蛋白組試劑盒是基于選擇性親和超順磁性納米探針的技術(shù)，納米粒子直徑僅為 200 nm，并且具有均一性。其表面通過化學(xué)偶聯(lián)反應(yīng)蛋白質(zhì)富集探針，每個納米磁珠表面約有 300,000 個蛋白質(zhì)結(jié)合位點(diǎn)用于富集人類蛋白質(zhì)組。每個納米探針物理空間僅為10 飛升，比傳統(tǒng)100 μL 體系小了100億倍，這使得對低豐度蛋白質(zhì)的檢測靈敏度提升100萬倍。因此，傳統(tǒng)質(zhì)譜蛋白質(zhì)組學(xué)無法檢測蛋白質(zhì)組也能夠被鑒定到，這為蛋白質(zhì)組學(xué)分析帶來大規(guī)模并行檢測和超寬豐度范圍，并且為大規(guī)模蛋白質(zhì)生物標(biāo)志物的發(fā)現(xiàn)提供一把研究利器。
一、Proteonano高深度超多重蛋白組學(xué)整體方案：
Nanomation™ G1內(nèi)置整套針對Nanomics Discover Panel和蛋白質(zhì)組學(xué)常用試劑的工作流
程，客戶只需要根據(jù)程序提示擺放試劑和耗材即可開始實(shí)驗(yàn)。
一、12K人類人類血漿蛋白組數(shù)據(jù)庫
珞米12K人類血漿蛋白組數(shù)據(jù)庫在前期8K數(shù)據(jù)庫的基礎(chǔ)上實(shí)現(xiàn)了顯著擴(kuò)展，現(xiàn)已覆蓋蛋白組學(xué)平臺的數(shù)據(jù)，涵蓋了超65%的Olink 5K、SomaLogic 11K蛋白組數(shù)據(jù)，約93%的HPPP人類血漿蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)庫，以及84%的FDA-approved circulating biomarkers，涵蓋12000個蛋白600種疾病，是珞米在蛋白組學(xué)研究領(lǐng)域的一個里程碑突破。
一、實(shí)測數(shù)據(jù)：穩(wěn)定 & 客觀
l 蛋白質(zhì)鑒定數(shù)顯著提升：不同Discover Panel檢測蛋白質(zhì)數(shù)目均超過3000種，達(dá)到5000種
l 穩(wěn)定性：蛋白質(zhì)定量CV平均值為15%，中位值為11%
l 蛋白質(zhì)鑒定深度顯著拓寬：蛋白質(zhì)動態(tài)范圍橫跨超9個數(shù)量級（>9 logs），大大拓寬了檢測的動態(tài)范圍
l 大量低豐度蛋白捕獲：捕獲的蛋白中，70%為豐度低于10 ng/mL的低豐度蛋白
五、血漿蛋白質(zhì)組樣本標(biāo)準(zhǔn)化采集注意事項(xiàng)
血液蛋白質(zhì)組分析是臨床蛋白質(zhì)組學(xué)需要實(shí)現(xiàn)的挑戰(zhàn)性的任務(wù)之一，因?yàn)闃颖镜膹?fù)雜性，如蛋白質(zhì)在非常動態(tài)的濃度下的異質(zhì)性，以及血漿/血清標(biāo)本樣本收集和存儲條件不當(dāng)均會對檢測結(jié)果造成的不良影響，以至得出錯誤結(jié)論，為此，項(xiàng)目開展前，應(yīng)當(dāng)考察樣本質(zhì)量。可能存在的樣本因素：
① 樣本溶血
② 樣本存在污染
③ 樣本凍存時間
④ 血漿樣本預(yù)處理方式
推薦血漿預(yù)處理方式:
血漿：新采集的樣品在室溫下1 小時內(nèi)或4℃條件下 8 小時內(nèi)離心。
血清：新采集的樣品在室溫下凝血 30-60 分鐘，然后離心。
保存或運(yùn)輸：樣品應(yīng)儲存在- 80°C的冰箱中，使用干冰運(yùn)輸。
其他:
記錄如何收集和處理樣品。
保證一項(xiàng)研究所有樣品的處理方法盡可能一致。例如: 所有樣本離心時溫度和離心速度保持一致，血漿抗凝劑應(yīng)保持一致；采集血清時，應(yīng)保持凝血時間和條件一致。
如果可能盡量使所有樣品凍融循環(huán)次數(shù)保持在相同范圍內(nèi)。