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lncRNA測序

簡介
       長鏈非編碼RNA(longnoncodingRNA,lncRNA)是指長度在200~100000nt之間不具有蛋白編碼功能的RNA分子。它們存在帶polyA尾和不帶polyA尾兩種形式，具有跨物種的低保守性，組織特異性表達(dá)和豐度低等特點。lncRNA的種類遠(yuǎn)遠(yuǎn)超過編碼RNA，保守估計哺乳動物基因組序列中4%~9%的序列產(chǎn)生lncRNA轉(zhuǎn)錄本，而相應(yīng)的蛋白編碼RNA的比例僅是1%~5%。目前研究提示lncRNA的功能機(jī)制主要包括參與轉(zhuǎn)錄調(diào)控、轉(zhuǎn)錄后調(diào)控、蛋白質(zhì)運輸和mRNA降解。lncRNA已經(jīng)成為非編碼RNA研究領(lǐng)域的一個熱點，借助高通量測序，研究人員能夠快速獲得與疾病或者特定生物學(xué)過程相關(guān)的lncRNA并進(jìn)行深入研究。


流程圖

技術(shù)優(yōu)勢
       1、信息完善：去rRNA的建庫方法，使得一個文庫可以同時進(jìn)行l(wèi)ncRNA和mRNA的分析，節(jié)省了實驗成本；
       2、準(zhǔn)確度高：鏈特異性建庫方法，使得反義lncRNA的鑒定更加準(zhǔn)確；
       3、前瞻性好：能發(fā)現(xiàn)大量未知的lncRNA信息，適合各類物種的研究；
       4、完整性：獲取完整的lncRNA轉(zhuǎn)錄信息。
 

smallRNA測序

簡介
        smallRNA是生命活動重要的調(diào)控因子，在基因表達(dá)調(diào)控、生物個體發(fā)育、代謝及疾病的發(fā)生等生理過程中起著重要的作用,包括miRNA、piRNA和siRNA，晶能生物公司可以提供各類smallRNA的測序服務(wù)。
       1、miRNA:是一種長度為21～25nt的單鏈小分子RNA。它廣泛存在于真核生物中，成熟的miRNA是由具發(fā)夾結(jié)構(gòu)單鏈RNA前體（premiRNA）經(jīng)過Dicer酶加工而成，主要通過與靶標(biāo)基因不wan全互補結(jié)合來調(diào)控靶基因的表達(dá)。miRNA在細(xì)胞發(fā)育、生物標(biāo)志物、腫瘤等多個領(lǐng)域中有廣泛的應(yīng)用。
       2、piRNA:是一類長度為26～31nt單鏈的小RNA，大部分集中在29～30nt。piRNA的表達(dá)具有組織特異性，只存在于具有全能性的動物細(xì)胞，如生殖細(xì)胞、腫瘤細(xì)胞和干細(xì)胞等。piRNA通過與Piwi亞家族蛋白結(jié)合形成piRNA復(fù)合物（piRC）來發(fā)揮生物學(xué)功能（沉默轉(zhuǎn)錄基因過程，維持生殖系和干細(xì)胞功能，調(diào)節(jié)翻譯和mRNA的穩(wěn)定性）。此外，piRNA在一些癌癥細(xì)胞中存在異常表達(dá)的現(xiàn)象，提示piRNA可能參與癌癥的發(fā)生，并可作為癌癥診斷和治療中的潛在生物標(biāo)記物。
       3、siRNA：內(nèi)源性干擾小RNA（siRNA,SmallinterferingRNA），包括ta-siRNA、ra-siRNA和nat-siRNA。ta-siRNA：天然反義轉(zhuǎn)錄小干擾RNA，由TAS基因編碼，miRNA剪切產(chǎn)生，21nt，作用機(jī)制類似于miRNA；ra-siRNA：由重復(fù)序列、轉(zhuǎn)座子、異染色質(zhì)產(chǎn)生，多為24nt；nat-siRNA：由天然反義轉(zhuǎn)錄本（序列與同區(qū)域互補鏈上基因的mRNA方向相反且發(fā)生部分重疊）產(chǎn)生。siRNA的功能主要與植物脅迫和生物發(fā)育相關(guān)。


流程圖

技術(shù)優(yōu)勢
       1、完整性好：一次實驗可以同時檢測多種smallRNA,信息來源于數(shù)據(jù)庫同步；
       2、可靠性強(qiáng)：高數(shù)據(jù)量保證不同豐度smallRNA都能準(zhǔn)確定量；
       3、前瞻性好：能發(fā)現(xiàn)未知的smallRNA信息，適合所有物種的研究。
 
 

環(huán)狀RNA測序

簡介
       環(huán)狀RNA測序是新興的轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)。過去普遍認(rèn)為細(xì)胞內(nèi)的非編碼RNA多以線型存在，近年來越來越多的研究發(fā)現(xiàn)，環(huán)狀RNA在哺乳動物細(xì)胞內(nèi)的表達(dá)量遠(yuǎn)高于普遍認(rèn)識水平。環(huán)狀RNA可以參與基因的表達(dá)調(diào)控，例如封閉miRNA的作用、調(diào)節(jié)本位基因的表達(dá)等，是長鏈非編碼RNA研究中的一個新的研究熱點。
流程圖