Droplet-Sequencing

高通量單細(xì)胞單分子液滴分選與封裝系統(tǒng)

可實(shí)現(xiàn)DNA或細(xì)胞封裝和高吞吐量分選。 這使得能夠十分迅速的篩選大型復(fù)雜的基因庫(kù)。

該系統(tǒng)是一種多功能和用戶友好型皮升級(jí)液滴發(fā)生器，觸摸屏化操作，*自動(dòng)化液滴生成。用于準(zhǔn)備DNA，細(xì)胞和其他生物材料樣品，然后用于下游的高分辨率分析。 可以安全、快速地將單個(gè)分子、DNA文字片段、單個(gè)細(xì)胞或單個(gè)細(xì)胞器與生化反應(yīng)試劑一起封裝在高度穩(wěn)定的雙乳狀或單乳狀液滴中。這些液滴能在PCR、渦旋、孵育和長(zhǎng)期儲(chǔ)存過(guò)程中保持穩(wěn)定。

封裝液體藥物的系統(tǒng)

采用*專有微流體技術(shù)，跨越基因和細(xì)胞研究的下一個(gè)前沿。它的*設(shè)計(jì)能幫助研究人員對(duì)人類、

動(dòng)物、植物和微生物的細(xì)胞和基因組獲得高分辨率的信息。

可以在用戶友好型的工作流程中生成和分類雙乳液滴，不需要任何使用過(guò)熒光細(xì)胞分類器的經(jīng)驗(yàn)。

工作流程從將100 kb的DNA的文字片段、小單細(xì)胞或其他生物材料捕捉在高度穩(wěn)定的液滴中開(kāi)始，以用于諸如PCR和酶活性評(píng)價(jià)等測(cè)試當(dāng)中。

然后，根據(jù)內(nèi)含物的熒光對(duì)液滴進(jìn)行分類，分離得到只含有感興趣內(nèi)容物的液滴，用于下游高分辨率分析，如:

基于微流體，在一個(gè)簡(jiǎn)單的工作過(guò)程中將數(shù)百萬(wàn)個(gè)分子分成液滴，從而能夠高質(zhì)量地靶向富集大片段(3E100 kb)，

d用于后續(xù)測(cè)序 ，允許從幾毫微克的脫氧核糖核酸開(kāi)始靶向富集長(zhǎng)脫氧核糖核酸分子。該系統(tǒng)是基于分離數(shù)百萬(wàn)個(gè)液滴中的長(zhǎng)DNA文字片

段，其中含有感興趣目標(biāo)序列的液滴被熒光標(biāo)記，并使用流式細(xì)胞術(shù)進(jìn)行分類。該系統(tǒng)程序的終產(chǎn)品是可以通過(guò)測(cè)序研究的長(zhǎng)脫氧核糖核酸分子的富集群體。是研究復(fù)雜基因組區(qū)域的有效富集技術(shù)。

為什么要選擇該系統(tǒng)：

它提供了從大基因文庫(kù)中準(zhǔn)備基因材料的手段以用于高分辨率的篩查分析。

幫助回答一系列的基因組學(xué)和分子生物學(xué)問(wèn)題。

支持合成生物學(xué)的工作流程，如酶進(jìn)化及其路徑工程。
具有用戶友好型接口，具有將微液體技術(shù)接入各實(shí)驗(yàn)室的能力

Droplet-Sequencing    階段劃分液滴系統(tǒng)

典型應(yīng)用：

與適當(dāng)?shù)囊旱畏蛛x、測(cè)序和分析技術(shù)相結(jié)合，該系統(tǒng)可應(yīng)用于以下等幾個(gè)方面：

●長(zhǎng)或短讀測(cè)序

●基因編輯分析

●無(wú)偏全基因組擴(kuò)增

●酶活性評(píng)價(jià)

近年來(lái)，液滴的質(zhì)譜分析技術(shù)、基于液滴的梯度技術(shù)、雙重液滴技術(shù)及基于液滴的基因篩選等取得了較大進(jìn)展，使液滴微流控在單細(xì)胞分析、酶動(dòng)力學(xué)、蛋白質(zhì)合成及高通量篩選等研究領(lǐng)域的潛力逐漸顯現(xiàn)出來(lái)。

實(shí)現(xiàn)單分子或單細(xì)胞分辨率

確保您為單分子或單細(xì)胞分析捕獲了正確的材料。該系統(tǒng)通過(guò)將生命的構(gòu)建模塊封裝在微微升雙乳液或單乳液液滴中，支持高分辨率的基因組學(xué)、宏基因組學(xué)和分子生物學(xué)工作流程。這種*的方法使以前未知的基因組區(qū)域可用于長(zhǎng)讀和短讀測(cè)序，提高了全基因組擴(kuò)增的分辨率，支持單細(xì)胞酶活性的評(píng)估等等。

1、基因組學(xué)應(yīng)用

提高基因組學(xué)和宏基因組學(xué)研究的分辨率。使用我們系統(tǒng)以及測(cè)序建議和生物信息學(xué)工具來(lái)執(zhí)行一系列基因組學(xué)工作流程該系統(tǒng)在人類、其他動(dòng)物、植物和微生物DNA的長(zhǎng)讀和短讀測(cè)序工作流程中證明了其性能。

聚光燈:植物基因組學(xué)

克服對(duì)植物龐大而復(fù)雜的基因組進(jìn)行測(cè)序的挑戰(zhàn)。該系統(tǒng)在支持各種植物基因組學(xué)工作方面表現(xiàn)出色，包括:

• 特征不明顯的基因簇分析

• 由于參考基因組和植物品種之間的低對(duì)應(yīng)性導(dǎo)致的間隙閉合

• 植物基因組結(jié)構(gòu)重排的解析

• 生物合成基因簇的檢查

2、基于細(xì)胞的應(yīng)用

新應(yīng)用

流動(dòng)聚焦幾何形狀的一個(gè)特征在于在微流體液滴形成期間可以觀察到兩相不混溶流體的變化，從而可以獲得各種微流體液滴的大小，并且可以看到存在沒(méi)有液滴形成的區(qū)域[8]。與T型結(jié)形狀不同，流動(dòng)聚焦幾何形狀產(chǎn)生的液滴沒(méi)有簡(jiǎn)單的模型根據(jù)控制參數(shù)來(lái)預(yù)測(cè)微流體液滴的尺寸。另一方面，微流體液滴的產(chǎn)生頻率通常相對(duì)較高，在kHz量級(jí)。然而，將jetting打破形成液滴通常會(huì)涉及到形成第二微流體液滴，其尺寸遠(yuǎn)低于主液滴尺寸，這種情況下產(chǎn)生的微液滴非常的不穩(wěn)定，液滴尺寸難以控制。

與傳統(tǒng)qpcr技術(shù)相比，數(shù)字pcr技術(shù)具有*的靈敏度、特異性和性，但截止目前而言，數(shù)字pcr仍然是一種全新的檢測(cè)方法，是一種全新的技術(shù)思路和手段。數(shù)字pcr技術(shù)相關(guān)的儀器、耗材、試劑和方法的開(kāi)發(fā)與創(chuàng)新，將具有無(wú)有止境的空間。但目前數(shù)字pcr技術(shù)的應(yīng)用成本相對(duì)較高，耗材使用不方便，導(dǎo)致數(shù)字pcr設(shè)備推廣速度較慢。數(shù)字pcr試劑體系封閉，導(dǎo)致基于該體系的試劑開(kāi)發(fā)和優(yōu)化嚴(yán)重受到制約。尤其是目前商品化的數(shù)字pcr試劑均存在一些問(wèn)題，如芯片式數(shù)字pcr的試劑不適用于微滴式數(shù)字pcr設(shè)備，只適用于科研實(shí)驗(yàn)室進(jìn)行低通量數(shù)字pcr實(shí)驗(yàn)，不適合臨床檢測(cè)體系的開(kāi)發(fā)，也不適合用于基因突變檢測(cè)試劑盒的開(kāi)發(fā)；又如微滴式數(shù)字pcr儀目前只有bio-rad和raindance兩家，其中bio-rad的試劑采用封閉式系統(tǒng)(封閉的pcrmix體系及配套封閉的dropletoil體系，不允許用戶更改配方以獲得相應(yīng)的kit)，而raindance則采用開(kāi)放式系統(tǒng)(兼容的qpcrmix和第三方采購(gòu)的dropletoil)，但qpcrmix并不針對(duì)數(shù)字pcr進(jìn)行優(yōu)化，會(huì)導(dǎo)致“rain"效應(yīng)，即二維散點(diǎn)彌散，尤其是在raindance的微滴數(shù)達(dá)到千萬(wàn)的級(jí)別的情況下，rain效應(yīng)將嚴(yán)重干擾數(shù)據(jù)的正常分析。