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擴(kuò)增整個(gè)基因組液滴制備

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產(chǎn)品型號(hào)DNAdrop

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更新時(shí)間:2022-03-10 15:34:24瀏覽次數(shù):173次

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擴(kuò)增整個(gè)基因組液滴制備
采用*專有微流體技術(shù),跨越基因和細(xì)胞研究的下一個(gè)前沿。它的*設(shè)計(jì)能幫助研究人員對(duì)人類、
動(dòng)物、植物和微生物的細(xì)胞和基因組獲得高分辨率的信息。
可以在用戶友好型的工作流程中生成和分類雙乳液滴,不需要任何使用過熒光細(xì)胞分類器的經(jīng)驗(yàn)。

                           擴(kuò)增整個(gè)基因組液滴制備


高通量單細(xì)胞單分子液滴分選與封裝系統(tǒng)


可實(shí)現(xiàn)DNA或細(xì)胞封裝和高吞吐量分選。 這使得能夠以特別快的速度篩選大型復(fù)雜的基因庫。



       

該系統(tǒng)是一種多功能和用戶友好型皮升級(jí)液滴發(fā)生器,觸摸屏化操作,*自動(dòng)化液滴生成。用于準(zhǔn)備DNA,細(xì)胞和其他生物材料樣品,然后用于下游的高分辨率分析。 可以安全、快速地將單個(gè)分子、DNA文字片段、單個(gè)細(xì)胞或單個(gè)細(xì)胞器與生化反應(yīng)試劑一起封裝在高度穩(wěn)定的雙乳狀或單乳狀液滴中。這些液滴能在PCR、渦旋、孵育和長(zhǎng)期儲(chǔ)存過程中保持穩(wěn)定。

封裝液體藥物的系統(tǒng)

采用*專有微流體技術(shù),跨越基因和細(xì)胞研究的下一個(gè)前沿。它的*設(shè)計(jì)能幫助研究人員對(duì)人類、

動(dòng)物、植物和微生物的細(xì)胞和基因組獲得高分辨率的信息。


可以在用戶友好型的工作流程中生成和分類雙乳液滴,不需要任何使用過熒光細(xì)胞分類器的經(jīng)驗(yàn)。

工作流程從將100 kb的DNA的文字片段、小單細(xì)胞或其他生物材料捕捉在高度穩(wěn)定的液滴中開始,以用于諸如PCR和酶活性評(píng)價(jià)等測(cè)試當(dāng)中。

然后,根據(jù)內(nèi)含物的熒光對(duì)液滴進(jìn)行分類,分離得到只含有感興趣內(nèi)容物的液滴,用于下游高分辨率分析,如:


●驗(yàn)證CRISPR基因編輯沒有隱藏意外重組的PCR偏差。

●識(shí)別重排,如融合和倒置。

●*。

●識(shí)別病毒和轉(zhuǎn)基因整合位點(diǎn)。

●在單細(xì)胞水平評(píng)估酶活性。

●進(jìn)行高通量GFP篩選。綠色熒光蛋白(green fluorescent protein,GFP)是一種常用

的報(bào)告基因

提供該系統(tǒng)所需的全系列試劑,用于包裹封裝DNA、RNA、細(xì)胞器或小細(xì)胞。生成高度穩(wěn)定的微納雙乳化液滴,

這些數(shù)以百萬計(jì)的液滴分別封裝分子,細(xì)胞器,或小細(xì)胞(高達(dá)6µm直徑)。每一個(gè)液滴都相當(dāng)于一個(gè)反應(yīng)室在其內(nèi)進(jìn)行單個(gè)分子或單個(gè)細(xì)胞分辨率水平的分析。

液滴是什么樣子

基于微流體,在一個(gè)簡(jiǎn)單的工作過程中將數(shù)百萬個(gè)分子分成液滴,從而能夠高質(zhì)量地靶向富集大片段(3E100 kb),

d用于后續(xù)測(cè)序 ,允許從幾毫微克的脫氧核糖核酸開始靶向富集長(zhǎng)脫氧核糖核酸分子。該系統(tǒng)是基于分離數(shù)百萬個(gè)液滴中的長(zhǎng)DNA文字片

段,其中含有感興趣目標(biāo)序列的液滴被熒光標(biāo)記,并使用流式細(xì)胞術(shù)進(jìn)行分類。該系統(tǒng)程序的終產(chǎn)品是可以通過測(cè)序研究的長(zhǎng)脫氧核糖核酸分子的富集群體。是研究復(fù)雜基因組區(qū)域的有效富集技術(shù)。


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為什么要選擇該系統(tǒng):

它提供了從大基因文庫中準(zhǔn)備基因材料的手段以用于高分辨率的篩查分析。

幫助回答一系列的基因組學(xué)和分子生物學(xué)問題。

支持合成生物學(xué)的工作流程,如酶進(jìn)化及其路徑工程。
具有用戶友好型接口,具有將微液體技術(shù)接入各實(shí)驗(yàn)室的能力


擴(kuò)增整個(gè)基因組液滴制備  雙乳化液滴生成系統(tǒng)

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DDPCR的原理是在PCR擴(kuò)增前對(duì)樣品進(jìn)行微滴化處理,即將含有核酸分子的反應(yīng)體系分成成千上萬個(gè)納升級(jí)的微滴,其中每個(gè)微滴或不含待檢核酸靶分子,或者含有一個(gè)至數(shù)個(gè)待檢核酸靶分子。經(jīng)PCR擴(kuò)增后,逐個(gè)對(duì)每個(gè)微滴進(jìn)行檢測(cè),有熒光信號(hào)的微滴判讀為1,沒有熒光信號(hào)的微滴判讀為0,根據(jù)泊松分布原理及陽性微滴的個(gè)數(shù)與比例即可得出靶分子的起始拷貝數(shù)或濃度。

典型應(yīng)用:

與適當(dāng)?shù)囊旱畏蛛x、測(cè)序和分析技術(shù)相結(jié)合,該系統(tǒng)可應(yīng)用于以下等幾個(gè)方面:

●長(zhǎng)或短讀測(cè)序

●基因編輯分析

●無偏全基因組擴(kuò)增

●酶活性評(píng)價(jià)

實(shí)現(xiàn)單分子或單細(xì)胞分辨率

確保您為單分子或單細(xì)胞分析捕獲了正確的材料。該系統(tǒng)通過將生命的構(gòu)建模塊封裝在微微升雙乳液或單乳液液滴中,支持高分辨率的基因組學(xué)、宏基因組學(xué)和分子生物學(xué)工作流程。這種*的方法使以前未知的基因組區(qū)域可用于長(zhǎng)讀和短讀測(cè)序,提高了全基因組擴(kuò)增的分辨率,支持單細(xì)胞酶活性的評(píng)估等等。

1、基因組學(xué)應(yīng)用

提高基因組學(xué)和宏基因組學(xué)研究的分辨率。使用我們系統(tǒng)以及測(cè)序建議和生物信息學(xué)工具來執(zhí)行一系列基因組學(xué)工作流程該系統(tǒng)在人類、其他動(dòng)物、植物和微生物DNA的長(zhǎng)讀和短讀測(cè)序工作流程中證明了其性能。

聚光燈:植物基因組學(xué)

克服對(duì)植物龐大而復(fù)雜的基因組進(jìn)行測(cè)序的挑戰(zhàn)。該系統(tǒng)在支持各種植物基因組學(xué)工作方面表現(xiàn)出色,包括:

  • 特征不明顯的基因簇分析

  • 由于參考基因組和植物品種之間的低對(duì)應(yīng)性導(dǎo)致的間隙閉合

  • 植物基因組結(jié)構(gòu)重排的解析

  • 生物合成基因簇的檢查

2、基于細(xì)胞的應(yīng)用

使用該系統(tǒng)封裝單個(gè)小細(xì)胞,包括微生物和藻類,以及生物活性分子。我們高度穩(wěn)定的雙乳化液滴提供了一種方法,可以孵育單個(gè)活細(xì)胞進(jìn)行分析,并對(duì)它們進(jìn)行分類,以在基于細(xì)胞的工作流程中獲得高分辨率。Xdrop在封裝細(xì)胞核方面也有良好的表現(xiàn),其他細(xì)胞器的工作流程正在測(cè)試中。

新應(yīng)用

對(duì)于CNV研究,大量的微滴提供了足夠的度,能準(zhǔn)確測(cè)定拷貝數(shù)狀態(tài)。利用QX100微滴式數(shù)字PCR系統(tǒng)來篩查HapMap樣品的CNV,拷貝數(shù)狀態(tài)可*分辨。






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