本文介紹一下用勻漿器研磨法提取貼壁細(xì)胞核蛋白的具體操作。
一、前期準(zhǔn)備
1、臺盼藍(lán)染液:
取臺盼藍(lán)粉劑,將其溶解在10mL的雙蒸水當(dāng)中配制成質(zhì)量體積比為4%(4%w/v)的臺盼藍(lán)母液。在使用時,利用PBS緩沖液將母液稀釋10倍,使其濃度達(dá)到0.4%,之后再與細(xì)胞懸液混合均勻。
2、BufferA:
包含10mmol/L的HEPES(在4℃下pH值為7.9)、1.5mmol/L的氯化鎂、10 mmol/L的KCL、0.5mmol/L的二硫蘇糖醇(DTT)。若擔(dān)心漿蛋白降解會對核蛋白產(chǎn)生影響,可以添加1mmol/L的PMSF。
3、BufferB:
含有20mmol/L的HEPES(pH值為7.9)、體積分?jǐn)?shù)為25%的甘油、0.42mol/L的氯化鈉、1.5mmol/L的氯化鎂、0.2mmol/L的乙二胺四乙酸(EDTA)、0.5mmol/L的PMSF、0.5mmol/L的二硫蘇糖醇(DTT)。
二、具體步驟
1、使用胰酶將貼壁細(xì)胞消化下來,把這些細(xì)胞收集到1.5mL EP管中。4℃以300g的離心力離心5min。離心完成后,用PBS緩沖液對細(xì)胞進(jìn)行洗滌(2次)。
2、棄上清,加入體積為細(xì)胞沉淀5倍的預(yù)冷Buffer A(每20μL的細(xì)胞沉淀加入100μL的Buffer A),之后輕輕吹打,使細(xì)胞在Buffer A中重新懸浮。
3、將上述細(xì)胞懸浮液在冰上放置10min,隨后再次在4℃條件下,以300g的離心力離心5min。離心結(jié)束后,加入體積為其25倍的預(yù)冷Buffer A,并通過吹打操作讓細(xì)胞重新懸浮。
4、把經(jīng)過上述處理后的細(xì)胞懸液轉(zhuǎn)移勻漿器中,準(zhǔn)備進(jìn)行勻漿操作。
5、在勻漿過程中,取出少量的細(xì)胞懸液,與等體積的0.4%臺盼藍(lán)染液混合均勻,接著在顯微鏡下觀察細(xì)胞的破膜情況。如果觀察到大部分細(xì)胞都被染成了藍(lán)色,就停止勻漿操作;要是大部分細(xì)胞未被染成藍(lán)色,則繼續(xù)進(jìn)行勻漿。
6、當(dāng)大部分細(xì)胞的細(xì)胞膜被破壞后,將細(xì)胞懸液轉(zhuǎn)移至Eppendorf管中,然后在4℃環(huán)境下,以25000g的離心力離心20min。
7、離心結(jié)束后,現(xiàn)在上清液中包含的是細(xì)胞裂解物中的胞漿成分,沉淀部分則是核蛋白。
8、收集離心后的沉淀,向其中加入與沉淀等體積的預(yù)冷Buffer B,然后輕輕地吹打,使沉淀呈現(xiàn)懸浮狀態(tài)。接著將懸浮液轉(zhuǎn)移到干凈的組織勻漿器中,以均勻的力度進(jìn)行30次勻漿操作。
9、把經(jīng)過勻漿的懸浮液轉(zhuǎn)移到Eppendorf管中,放在冰上的低速搖床上振蕩45min。
10、在4℃條件下,以25000g的離心力離心30min,收集得到的上清液即為細(xì)胞核蛋白
11、提取核蛋白后,可使用一些核蛋白(如H3蛋白、Lamin蛋白)作為對照蛋白,進(jìn)行WB驗證。
注:全部步驟均需于冰上操作。
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