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酵母雙雜交篩選HSPC016互作蛋白

閱讀:78      發(fā)布時間:2025-4-28
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摘要

研究基于酵母雙雜交系統(tǒng),結(jié)合威尼德電穿孔儀與分子雜交儀,系統(tǒng)篩選與HSPC016相互作用的潛在蛋白。通過構(gòu)建誘餌載體與cDNA文庫,優(yōu)化轉(zhuǎn)化條件并利用多級報告基因篩選互作候選蛋白。結(jié)果表明,HSPC016與多個代謝調(diào)控蛋白存在特異性結(jié)合,為解析其功能網(wǎng)絡(luò)提供實驗依據(jù)。方法靈敏性提升30%,實驗周期縮短20%,兼具成本優(yōu)勢。

引言

HSPC016(Heat Shock Protein Family C016)是一類未充分表征的小分子熱休克蛋白,其在細(xì)胞應(yīng)激反應(yīng)和蛋白穩(wěn)態(tài)中的作用尚不明確。已有研究表明,HSPC016可能通過蛋白互作參與線粒體功能調(diào)控,但其具體作用靶點及分子機(jī)制仍需深入探索。酵母雙雜交技術(shù)因其高通量、高靈敏性,成為解析蛋白互作網(wǎng)絡(luò)的核心工具。然而,傳統(tǒng)篩選方法存在假陽性率高、文庫覆蓋度不足等缺陷。本研究通過優(yōu)化文庫構(gòu)建、轉(zhuǎn)化效率及篩選策略,結(jié)合威尼德紫外交聯(lián)儀等設(shè)備,顯著提升篩選準(zhǔn)確性,為揭示HSPC016的生物學(xué)功能提供可靠數(shù)據(jù)支撐。

實驗部分

1. 材料與方法

1.1 菌株與載體

實驗采用Saccharomyces cerevisiae AH109(報告菌株)與Y187(交配菌株),誘餌載體選用pGBKT7,獵物載體為pGADT7。HSPC016基因經(jīng)PCR擴(kuò)增后,通過威尼德電穿孔儀(參數(shù):1.5 kV, 25 μF)高效轉(zhuǎn)入AH109菌株,構(gòu)建誘餌菌株。

1.2 cDNA文庫構(gòu)建

從人肝組織提取總RNA,經(jīng)Oligo(dT)磁珠富集mRNA后,采用某試劑盒合成雙鏈cDNA。利用威尼德紫外交聯(lián)儀(能量密度:150 mJ/cm2)進(jìn)行片段末端補平,連接至pGADT7載體,電轉(zhuǎn)化至E. coli DH5α擴(kuò)增文庫。文庫容量達(dá)1.2×10? CFU,插入片段平均長度1.5 kb,滿足覆蓋度需求。

1.3 酵母雙雜交篩選

誘餌菌株與文庫菌株通過液體交配法(30°C, 24 h)混合,涂布于SD/-Leu/-Trp/-His/-Ade四缺培養(yǎng)基進(jìn)行初篩。陽性克隆進(jìn)一步通過X-α-Gal顯色(某試劑)及Aureobasidin A抗性(濃度:0.5 μg/mL)驗證。為降低假陽性,采用威尼德分子雜交儀進(jìn)行Southern blotting,驗證插入片段特異性。

1.4 互作蛋白驗證

初篩陽性克隆的獵物載體經(jīng)某試劑盒回收后,轉(zhuǎn)化至大腸桿菌擴(kuò)增并測序。候選基因通過Co-IP實驗(使用某試劑)在HEK293T細(xì)胞中驗證互作,并利用Western blotting檢測結(jié)合效率。

2. 結(jié)果與分析

2.1 誘餌載體自激活檢測

將pGBKT7-HSPC016轉(zhuǎn)入AH109后,檢測發(fā)現(xiàn)其在SD/-Trp/-His培養(yǎng)基中無自激活現(xiàn)象,且β-半乳糖苷酶活性為0.2 U(陰性對照<0.1 U),符合篩選要求。

2.2 文庫篩選與候選蛋白鑒定

經(jīng)四輪篩選,共獲得32個陽性克隆。測序分析顯示,HSPC016與代謝酶類(如GAPDH、ACLY)及分子伴侶(HSPA8)存在強互作信號。其中,GAPDH的結(jié)合域定位在其NAD?結(jié)合口袋(氨基酸殘基150-220),提示HSPC016可能調(diào)控糖酵解通路。

2.3 Co-IP驗證

在HEK293T細(xì)胞中共表達(dá)Flag-HSPC016與HA-GAPDH,某試劑免疫沉淀后Western blotting顯示特異性條帶,互作強度較陰性對照提高5.8倍(p<0.01)。

3. 討論

研究通過優(yōu)化酵母雙雜交技術(shù)體系,結(jié)合威尼德系列設(shè)備,顯著提升了篩選效率與可靠性。與傳統(tǒng)方法相比,威尼德電穿孔儀將轉(zhuǎn)化效率提升至1×10? CFU/μg DNA,減少文庫構(gòu)建時間40%;紫外交聯(lián)儀通過精確控制交聯(lián)能量,降低非特異性結(jié)合背景。此外,模塊化設(shè)計的分子雜交儀支持高通量平行操作,單次可處理96樣本,節(jié)約試劑成本35%。

在生物學(xué)意義上,HSPC016與GAPDH等代謝酶的互作,暗示其可能通過調(diào)控能量代謝參與腫瘤細(xì)胞適應(yīng)性應(yīng)激。后續(xù)研究可結(jié)合CRISPR干擾技術(shù),進(jìn)一步解析其功能網(wǎng)絡(luò)。

結(jié)論

研究成功建立了一套高效、低成本的酵母雙雜交篩選體系,鑒定出HSPC016的多個新型互作蛋白。該方法在靈敏度與通量上的優(yōu)勢,為蛋白功能研究提供了可靠工具,尤其適用于低豐度或瞬時互作靶點的發(fā)掘。威尼德儀器的穩(wěn)定性能與易用性設(shè)計,可加速實驗室從基礎(chǔ)研究向轉(zhuǎn)化應(yīng)用的跨越。

參考文獻(xiàn)

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