目錄:上海烜雅生物科技有限公司>>核酸檢測試劑盒>>熒光PCR法>> 50T芽孢桿菌通用探針法熒光PCR試劑盒
供貨周期 | 現(xiàn)貨 | 規(guī)格 | 50T/盒 |
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貨號 | XY-D-0891 | 應(yīng)用領(lǐng)域 | 化工,生物產(chǎn)業(yè) |
主要用途 | 科研 | 英文名稱 | Bacillusspp. Probe qPCR Kit |
保存條件 | -20℃保存 | 有效期 | 24個月 |
產(chǎn)品簡介:
芽孢桿菌(Bacillus)屬于芽孢桿菌科芽孢桿菌屬,為革蘭氏陽性菌。細胞呈直 桿狀,常以成對或鏈狀排列,具圓端或方端。芽孢桿菌對外界有害因子抵抗力強、分 布廣,存在于土壤、水、空氣以及動物腸道等處,在工農(nóng)業(yè)及醫(yī)藥生產(chǎn)中均有廣泛應(yīng) 用,因此快速檢測芽孢桿菌具有重要意義。為此本公司以探針法 qPCR 技術(shù)為基礎(chǔ)開發(fā)了芽孢桿菌的檢測試劑盒。
產(chǎn)品特點:
1.即開即用,用戶只需要提供樣品 DNA 模板。
2.引物和探針經(jīng)過優(yōu)化,靈敏度高,最-低檢測限可達 100 拷貝/反應(yīng)。
3.提供陽性對照,便于區(qū)分假陰性樣品。
4.特異性高,引物是根據(jù)芽孢桿菌基因組 DNA 高度保守區(qū)設(shè)計,可以檢測本屬的主要物種,不會跟其它生物的 DNA 發(fā)生交叉反應(yīng)。
5.既可用于定性檢測,又可用于定量檢測。用于定量檢測時,線性范圍至少 5 個數(shù)量級。
6.本產(chǎn)品足夠 50 次 20 μL 體系的探針法熒光定量 PCR 反應(yīng)。
7.芽孢桿菌通用探針法熒光PCR試劑盒只能用于科研。
產(chǎn)品參數(shù):
產(chǎn)品規(guī)格
50T/盒,可滿足一定規(guī)模的檢測需求。
檢測方法
實時熒光PCR,具有快速、準(zhǔn)確、靈敏等優(yōu)點。
試劑盒成分
2×Probe qPCR MasterMix、熒光 PCR 專用模板稀釋液、超純水、芽孢桿菌通用 qPCR 引物-探針干粉、芽孢桿菌通用 qPCR 陽性對照(1E7 拷貝/μL)、使用手冊。
自備試劑
樣品 DNA,超純水,核酸純化試劑盒。
保存和運輸
低溫運輸,-20℃保存,保存期限為 24 個月。
使用方法:
一、稀釋標(biāo)準(zhǔn)曲線樣品(以 1E1-1E6 拷貝/μL 這 6 個 10 倍稀釋度為例)。
由于標(biāo)準(zhǔn)品濃度非常高,因此下列稀釋操作一定要在獨立的區(qū)域進行,千萬不能 污染樣品或本試劑盒的其他成分。本產(chǎn)品不提供活體樣品做陽性對照,只提供 DNA 片段作為陽性對照。
1.標(biāo)記 6 個離心管,分別為 6、5、4、3、2、1。
2.用帶芯槍頭分別加入45 μL 熒光PCR 專用模板稀釋液,最好用帶芯槍頭(下同)。
3.在 6 號管中加入 5 μL 1E7 拷貝/μL 的陽性對照(試劑盒提供),充分震蕩混勻 1分鐘,得到 1E6 拷貝/μL 的標(biāo)準(zhǔn)曲線樣品。放冰上待用。
4.換槍頭,在 5 號管中加入 5 μL 1E6 拷貝/μL 的陽性對照(上步稀釋所得),充分震蕩混勻 1 分鐘,得到 1E5 拷貝/μL 的標(biāo)準(zhǔn)曲線樣品。放冰上待用。
5.換槍頭,在 4 號管中加入 5 μL 1E5 拷貝/μL 的陽性對照(上步所得),充分震蕩混勻 1 分鐘,得到 1E4 拷貝/μL 的標(biāo)準(zhǔn)曲線樣品。放冰上待用。
6.依次重復(fù)上面的操作得到 6 個稀釋度的標(biāo)準(zhǔn)曲線樣品。放冰上待用。
二、樣品 DNA 的制備
7.如果有 N 個樣品,最好設(shè)置 N+2 個提取,多出的一個是 PC(樣品制備陽性對
照),一個是 NC(樣品制備陰性對照)??梢杂?10 μL 上步所得 4 號稀釋液再加上一定量的水使總體積跟每次制備要求的體積一樣,以此作為 PC。另外用水作為 NC。
8.用自選方法純化樣品的 DNA,本試劑盒跟市場上大多數(shù)樣品 DNA- 提取試劑盒兼容。也可以選購本公司的核酸-提取試劑。
三、qPCR 反應(yīng)(20 μL 體系,在樣品制備室進行)
9.如果做定量分析并且只做 1 次重復(fù),則標(biāo)記 N+9 個 PCR 管,其中 N+2 個用于上步得到的 N+2 個樣品,1 個用于 PCR 陰性對照(用水做模板),6 個用于標(biāo)準(zhǔn)曲線。如果做定性分析并且只做 1 次重復(fù),則標(biāo)記 N+4 個 PCR 管,其中 N+2 個用于上步得到的 N+2 個樣品,1 個用于 PCR 陰性對照(用水做模板),1 個用于 PCR 陽性對照(直接用第 6 步第 4 號管的陽性對照稀釋液做模板)。下面只以定量分析為例描述操作步驟。
10.在標(biāo)記管中按下表加入各成分(本表只列出一次重復(fù)。樣品管和陰性對照設(shè)
置完畢后才設(shè)置陽性對照,并且陽性對照樣品要等所有管子蓋上蓋子儲存好后最 后加):
成分樣品管
N+3 個PCR 陰性
對照管標(biāo)曲樣品管
(1-6)
2×Probe qPCR MasterMix各 10 μL10 μL各 10 μL
芽孢桿菌通用 qPCR 引物-探針混合液各 3 μL3 μL各 3 μL
待測樣本 DNA 模板7 μL不加不加
超純水不加7 μL不加
第 6 步所得標(biāo)準(zhǔn)曲線樣品稀釋液(1-6 號)
不加
不加各 7 μL(1 號樣到 1 號管,2 號樣到 2 號管…)
四、數(shù)據(jù)處理
12.如果擴增陽性對照或制備陽性對照結(jié)果為陰性,則整個擴增或制備實驗無效,不 需要分析數(shù)據(jù),需要重做擴增或制備或跟廠家聯(lián)系。如果擴增陰性對照或制備陰 性對照結(jié)果為陽性,說明環(huán)境污染,則整個擴增或制備實驗無效,不需要分析數(shù) 據(jù),需要跟廠家聯(lián)系,購買新的引物和探針。
13.如果陰性對照和陽性對照正常,則實驗有效,可以進入后續(xù)分析。
14.如果把本試劑盒用于定量檢測,則以陽性對照濃度的 log 值為橫軸,以 Ct 值為縱軸,繪制標(biāo)準(zhǔn)曲線。再以待測樣品的 Ct 值從標(biāo)準(zhǔn)曲線上推算出樣品 DNA 濃度的 log 值,再推算出其濃度。
15.如果把本試劑盒用于定性檢測,只判斷陽性或陰性,則陰性對照必須無 Ct 或 Ct 大于或等于 40。陽性對照必須有熒光對數(shù)增長,有典型擴增曲線,Ct 值應(yīng)該小于 40,否則實驗無效。如果實驗有效,則分析待測樣品,如果無 Ct 或 Ct 大于或等于 40,則為陰性。如果 Ct 小于 40 則為陽性。
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