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甲基化檢測(cè)

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更新時(shí)間:2024-09-12 15:47:30瀏覽次數(shù):1070次

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甲基化檢測(cè):生物的遺傳信息主要貯存在 DNA 中,而 DNA 由 AGCT 四種堿基、核糖、磷酸基團(tuán)等組成。堿基上可以發(fā)生化學(xué)修飾,最常見的形式是胞嘧啶C的第5位碳原子的甲基化,形成 5-甲基胞嘧啶(5mC)。

        DNA甲基化檢測(cè)是一種用于測(cè)定DNA序列中特定位置上的胞嘧啶是否被添加甲基基團(tuán)的實(shí)驗(yàn)方法。這一過程在生物學(xué)研究中尤為重要,因?yàn)镈NA甲基化與基

因表達(dá)調(diào)控、早期胚胎發(fā)育、基因組印記、X染色體失活等重要生物學(xué)過程密切相關(guān),并且可以作為腫瘤生物標(biāo)志物。以下是幾個(gè)主要方面:


1. 檢測(cè)目的:DNA甲基化可以調(diào)控基因表達(dá),因此通過檢測(cè)DNA甲基化可以為解釋基因表達(dá)的調(diào)控提供線索。由于DNA甲基化參與一系列重要的生物學(xué)過程,

                     如早期胚胎發(fā)育、基因組印記、X染色體失活等,因此檢測(cè)DNA甲基化有助于闡明這些生命過程背后的秘密。研究還表明,DNA甲基化可以作為

                     腫瘤的生物標(biāo)志物,對(duì)腫瘤的發(fā)生、發(fā)展及預(yù)后具有預(yù)測(cè)意義。

2. 檢測(cè)方法:根據(jù)檢測(cè)目標(biāo)的不同,檢測(cè)方法可以分為特異位點(diǎn)的甲基化的檢測(cè)和全基因組的甲基化分析。

   特異位點(diǎn)的甲基化的檢測(cè)

     MS-PCR:這種方法經(jīng)濟(jì)實(shí)用,無需特殊儀器,應(yīng)用廣泛。它通過設(shè)計(jì)兩對(duì)引物來檢測(cè)特定CpG位點(diǎn)是否存在甲基化。

     亞硫酸氫鹽處理+測(cè)序:被認(rèn)為是DNA甲基化分析的金標(biāo)準(zhǔn),可靠性高,但過程繁瑣、昂貴。

     COBRA:相對(duì)簡單,可快速定量幾個(gè)已知CpG位點(diǎn)的甲基化,但只能獲得特殊酶切位點(diǎn)的甲基化情況。

     MethyLight:利用TaqMan探針和PCR引物區(qū)分甲基化和未甲基化的DNA,高通量且高敏感性。

     HRM:通過熔解曲線分析發(fā)現(xiàn)甲基化與未甲基化DNA的序列差異,簡便、快捷、精確。

     焦磷酸測(cè)序:能夠快速檢測(cè)甲基化的頻率,進(jìn)行定性及定量檢測(cè),適合不同通量需求的儀器選擇。

   全基因組的甲基化分析

     芯片技術(shù):如Illumina的Infinium HumanMethylation450 BeadChip芯片,以單堿基分辨率覆蓋超過45萬個(gè)甲基化位點(diǎn),適用于大規(guī)模平行分析。

3. 應(yīng)用場景:廣泛應(yīng)用于科學(xué)研究和臨床診斷。例如,腫瘤細(xì)胞內(nèi)全基因組的低甲基化程度與疾病進(jìn)展、腫瘤大小和惡性程度有密切關(guān)系,因此可

                    用于腫瘤的預(yù)測(cè)和診斷。此外,通過對(duì)血清及其他體液中的腫瘤細(xì)胞DNA甲基化進(jìn)行檢測(cè),輔助診斷腫瘤及判斷預(yù)后,如肺癌患者痰及乳腺癌患者的

                    乳頭抽吸物。

                    


       綜上所述,DNA甲基化檢測(cè)不僅在基礎(chǔ)生物學(xué)研究中扮演著重要角色,同時(shí)也為臨床診斷提供了有價(jià)值的生物標(biāo)志物。選擇合適的檢測(cè)方法需要根據(jù)研究目標(biāo)

和經(jīng)濟(jì)條件綜合考慮,從而盡可能地發(fā)揮其價(jià)值。


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