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SNP序列查詢SOP

來源:上海宇玫博生物科技有限公司   2018年04月26日 12:02  

 

1 SNP序列查詢

    https://www.ncbi.nlm.nih.gov/snp/

 

2, 搜索目的SNP位點(diǎn):(rs114234235為例)

 

3,搜索結(jié)果

4, 點(diǎn)擊查看明細(xì)

5, SNP明細(xì)信息:

 

6, 獲取SNP上下游序列:

 

>gnl|dbSNP|rs114234235|allelePos=201|totalLen=401|taxid=9606|snpclass=1|alleles='A/C'|mol=Genomic|build=151

 GGGAGGGGGT CTCAGGGGAG GAAGGGCAGC TCTAATTGGT TTCTCAATGA AAGATAATCA

 CCTACTCCCC AGAGAGGCTG GAGATTAGCA CTCTGCCTCT CCTCTCCATC GCTTTTAGAC

 TTCTCATCCT CCCCTCGGTG CTTTTAGTCC ATTCAGCAGA AGCGGATCGA AGCAGGAGGC

 TCCCCGCGCC GCATTAGGGG

 M

 GCACTCCGCC GCGCTCGAGT ACTTAGCGCC CATTCACTCG CTCACCCGCG CTCTCCGCTG

 CCGGCTGCCG TCCCAGCCGC CGCCGCCGCC GCCGCCGCCG CCGCCGCCCG AGAAAAAGTT

 TCGCGGAGGG GCTCAGTGAA AAAATGAGCG AGCTAGAGGA AGACTTTGCC AAGATTCTCA

 TGCTCAAGGA GGAGAGGATC

 

7 SNP對應(yīng)基因中進(jìn)行比對

   rs114234235位于PRKG1基因的啟動子區(qū)域;

http://www.umibio。。cn/Luciferase

 

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