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Genetic Signatures成立于2001年，由Geoffrey Grigg博士（原澳大利亞聯(lián)邦科學(xué)與工業(yè)研究組織（CSIRO）分子生物學(xué)部主任）創(chuàng)立。甲基化分析中使用廣泛的方法是亞硫酸氫鹽法，由Grigg博士在英國(guó)劍橋設(shè)想，并被減少到CSIRO實(shí)驗(yàn)室的實(shí)踐中[1]。初的方法隨后得到改進(jìn)，這些改進(jìn)導(dǎo)致了遺傳簽名MethylEasy™DNA亞硫酸氫鈉修飾產(chǎn)品系列的開(kāi)發(fā)和發(fā)布。
由于改進(jìn)的轉(zhuǎn)化方法和用于胞嘧啶甲基化檢測(cè)的應(yīng)用，發(fā)現(xiàn)了一個(gè)有趣的發(fā)現(xiàn)：通過(guò)亞硫酸氫鈉處理微生物DNA能夠?qū)⑺姆N核酸堿基還原成僅三個(gè)堿基，通過(guò)將胞嘧啶轉(zhuǎn)化為胸腺嘧啶。該技術(shù)被稱(chēng)為3base ™，是我們的EasyScreen ™病原體檢測(cè)試劑盒的基石。
此后，遺傳標(biāo)志開(kāi)發(fā)并商業(yè)化了一套基于EasyScreen ™實(shí)時(shí)PCR的產(chǎn)品，用于常規(guī)檢測(cè)傳染病。EasyScreen ™產(chǎn)品為醫(yī)院和病理實(shí)驗(yàn)室提供了分子工具，可在快速高通量的環(huán)境中篩查各種傳染性病原體。
樣品制備工作流程：
所述 EasyScreen ™樣品處理試劑盒提供直接從主檢體的核酸流線(xiàn)型制備。
該試劑盒可分離 DNA和RNA，并與所有EasyScreen ™病原體檢測(cè)試劑盒兼容 。
| 自動(dòng)化NA提取平臺(tái)兼容性 |
|---|
| 遺傳簽名GS1 |
| 生物梅里埃NucliSENS easyMAG |
| Qiagen QIAsymphony，EZ1 |
| 羅氏MagNA Pure 96 |
| Thermo KingFisher Flex |
一旦使用EasyScreen™樣品處理試劑盒 準(zhǔn)備好 樣品后，可按照 下面的實(shí)時(shí)PCR工作流程設(shè)置任何（或全部）適用的EasyScreen™ 病原體檢測(cè)分析。
例如，通過(guò)將拭子浸入樣品并接種EasyScreen TM試劑并如上所述進(jìn)行操作來(lái)制備糞便樣品。通過(guò)自動(dòng)核酸提取的提取過(guò)程產(chǎn)生足夠的洗脫液以執(zhí)行所有的細(xì)菌，病毒和原生動(dòng)物PCR。
實(shí)時(shí)PCR工作流程：
| 實(shí)時(shí)PCR平臺(tái)兼容性 |
|---|
| Bio-rad CFX（96和384孔格式） |
| 羅氏LC480（96和384孔格式） |
| Qiagen RotorGene |
| Applied Biosystems 7900HT /?? 7500 |
| Applied Biosystems QuantStudio™5 |
| Stratagene / Agilent Mx |
| 產(chǎn)品 | EasyScreen™套件 | 檢測(cè)到微生物 |
|---|---|---|
| EB001和EB001-HT | 腸道細(xì)菌檢測(cè) | （i）沙門(mén)氏菌屬 （ii）彎曲桿菌屬（Campylobacter spp。） （iii）志賀菌屬。/腸侵襲性大腸桿菌（EIEC） （iv）小腸結(jié)腸炎耶爾森菌。 （v）產(chǎn)毒的艱難梭菌和 （vi）單核細(xì)胞增生李斯特菌 |
| EP001和EP001-HT | 腸道原生動(dòng)物檢測(cè) | （i）隱孢子蟲(chóng)屬（Cryptosporidium spp。） （ii）腸道賈第蟲(chóng) （iii）脆弱東部阿米巴 （iv）溶組織內(nèi)阿米巴和 （v）人芽囊原蟲(chóng)（Blastocystis hominis） |
| EV002和EV002-HT | 腸道病毒檢測(cè) | （i）諾如病毒GI （ii）諾如病毒GII （iii）星狀病毒 （iv）輪狀病毒A （v ）沙波病毒 （vi）腸病毒 （vii）博卡 病毒（viii）腺病毒和 （ix）腺病毒（僅40 + 41） |
| CDD001 | 艱難梭菌檢測(cè) | 毒素艱難梭菌（目標(biāo)都TCDA和毒素tcdB） |
| CDD002 | 艱難梭菌反射 | 超致病性艱難梭菌包括 （i）位置117處的tcdC基因缺失，（ii）二元毒素基因（cdtA）和（iii）gyrA基因突變（氟喹諾酮耐藥性）的核糖體027和078 ， |
英文信息如下：
| Product | EasyScreen™ Kit | Microorganisms Detected |
|---|---|---|
| EB001 & EB001-HT | Enteric Bacteria Detection | (i) Salmonella spp. (ii) Campylobacter spp. (iii) Shigella spp. /Enteroinvasive E.coli (EIEC) (iv) Yersinia enterocolitica. (v) toxigenic C. difficile and (vi) Listeria monocytogenes |
| EP001 & EP001-HT | Enteric Protozoan Detection | (i) Cryptosporidium spp. (ii) Giardia intestinalis (iii) Dientamoeba fragilis (iv) Entamoeba histolytica and (v) Blastocystis hominis |
| EV002 & EV002-HT | Enteric Viral Detection | (i) Norovirus GI (ii) Norovirus GII (iii) Astrovirus (iv) Rotavirus A (v) Sapovirus (vi) Enterovirus (vii) Bocavirus (viii) Adenovirus and (ix) Adenovirus (40 + 41 only) |
| CDD001 | C. difficile Detection | Toxigenic C. difficile (targets both tcdA and tcdB) |
| CDD002 | C. difficile Reflex | Hypervirulent C. difficile incl. ribotype 027 & 078 targeting: (i) tcdC gene deletion at position 117, (ii) binary toxin gene (cdtA) and (iii) gyrA gene mutation (fluoroquinolone resistance) |
對(duì)于HT（384孔格式）試劑盒，所有試劑盒都足夠用于100RXNs或500RXNs
所有 EasyScreen™ 病原體檢測(cè)試劑盒都可用于使用EasyScreen™ 樣品處理試劑盒準(zhǔn)備的 樣品。
有關(guān)EasyScreen™ 工作流程以及與核酸提取和實(shí)時(shí)PCR平臺(tái)的兼容性的更多信息， 請(qǐng)?jiān)L問(wèn)我們的 EasyScreen™ 工作流程頁(yè)面。
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