◆評價ULTRARIPA® Kit B buffer 單獨提取脂筏蛋白的能力
(數(shù)據提供:東京大學 大學院藥學系研究科 衛(wèi)生化學教室)
用PBS清洗COS-1細胞后,用SDS buffer、1% Triton X-100 buffer,ULTRARIPA® Kit A buffer以及ULTRARIPA® Kit B buffer溶解,離心(14,000 rpm, 5 min, 4°C)。分離可溶性組分和不溶性組分。不溶性組分用等量的SDS-PAGE sample buffer變性溶解。通過SDS-PAGE / Western印跡評價脂筏標記物中Flotilin 1的可溶解量。在普通1%Triton X-100和RIPA緩沖液中,大部分的Flotilin 1保留在不溶性膜組分中,然而在ULTRARIPA® Kit B緩沖液中幾乎全部溶解了。
各緩沖液的成分:
● | SDS buffer(2%SDS, 1% Triton X-100, 50 mM HEPES?Na (pH 7.2), 150 mM NaCl) |
● | ULTRARIPA® Kit A buffer (1% NP-40 Alternative,0.1% SDS,50 mM Tris-HCl (pH8.0),150 mM NaCl,0.5% Sodium Deoxycholate) |
● | ULTRARIPA® Kit B buffer (不公開成分) |
● | 1% Triton X-100 (1% Triton X-100, 50 mM HEPES?Na (pH 7.2), 150 mM NaCl) |
◆用ULTRARIPA® Kit觀察NGF刺激依存的Integrin的脂筏轉換
(數(shù)據提供:國立精神·神經醫(yī)療研究中心 神經研究所 疾病研究第五部)
使用的樣本:小鼠來源原代培養(yǎng)DRG神經細胞(DIV13,~106 cells/35 mm dish)
目標蛋白:Integrinβ1, Flotillin 1
步驟:
1.在存在和不存在50ng/mL NGF的情況下培養(yǎng)神經細胞(各準備2個樣品)
2.用PBS清洗COS-1細胞后,添加150 μL ULTRARIPA® Kit A-buffer,并在冰上孵育
3.離心分離可溶性組分①和不溶性組分
4.準備的2個A-buffer不溶性組分的樣品,其中一個管添加150 μL 1× SDS sample buffer使其*溶解②
5.添加150 μL B-buffer至另一管A-buffer不溶性組分中,懸浮沉淀物
6.離心并分離B-buffer可溶性組分③和不溶性組分
7.添加150 μL 1× SDS-PAGE sample buffer至B-buffer不溶性組分中,使其*溶解④
結果:
與NGF刺激中未看到Flutillin的波動相比,觀察到了Integrinβ1通過NGF濃縮在RIPA不溶性部分中。
◆使用ULTRARIPA® Kit分析神經突觸相關蛋白的可溶性和復合物
(本數(shù)據是在Funakoshi與學習院大學理學部 高島明彥教授,住岡曉夫助教共同研究下取得)
■ 直接添加B-buffer驗證溶解效率
使用的樣本:小鼠腦組織(海馬體+大腦皮質)來源的P2膜組分*
*P2模組分的回收步驟
從小鼠腦組織切除海馬體以及大腦皮質,添加勻漿緩沖液(10 mM HEPES (pH 7.4), 0.32 M Sucrose, protease inhibitors)并用Dounce型勻漿器破碎。
低速(×1,000 g)10分鐘離心組織破碎液,去除沉淀的核組分(P1組分)。
上清(S1)組分用中速(×13,200 g)20分鐘進一步離心,去除上清(S2)組分,回收沉淀的膜(P2)。
使用緩沖液條件:
SDS:2% SDS, 50 mM Tris-HCl (pH 8.0), 150 mM NaCl
1% Triton:1% TritonX-100, 50 mM Tris-HCl (pH 8.0), 150 mM NaCl ULTRARIPA® Kit
A-buffer(RIPA):1% NP-40, 0.5% deoxycholate, 0.1% SDS, 50 mM Tris-HCl (pH 8.0), 150 mM NaCl
B-buffer:非公開
步驟:
1. 添加各緩沖液100 mL至P2組分中,在冰上進行超聲處理
2. 高速(×100,000 g)離心破碎液,沉淀不溶性組分,回收各可溶性組分
3. 添置100 μL 2% SDS緩沖液至各不溶性組分并使其溶解。
結果:
在經過驗證的所有神經突觸相關蛋白中,ULTRARIPA® Kit B-buffer的溶解效率比1%Triton X-100和RIPA緩沖液(A-buffer)高。
■ 驗證神經細胞膜來源RIPA不溶性組分的B-buffer溶解效率
使用的樣本:小鼠腦組織(海馬體+大腦皮質)來源的P2膜組分
步驟:
1. 添加200 μL A-buffer(RIPA)至P2膜組分,在冰上進行超聲處理
2. 高速(×100,000 g)離心破碎液,除去可溶性組分,單獨分離不溶性組分。
3. 添加200 mL 2% SDS,A-buffer或B-buffer至A-buffer不溶性組分,在冰上進行超聲處理
4. 離心(×100,000 g)各溶液,并分離可溶性組分和不溶性組分
5. 為了檢測B-buffer不溶性組分中殘留的蛋白,添加2% SDS至B-buffer組分中使其*溶解
結果:
發(fā)現(xiàn)B-buffer能夠溶解神經細胞膜的RIPA不溶性組分中包含的大多數(shù)蛋白。
此外,還可以高效提取NMDA型谷氨酸受體亞基的GluN1和GluN2B。
另一方面,盡管PSD 95的可溶性有所提高,但發(fā)現(xiàn)它仍殘留在B-buffer的不溶性組分中。
■ 使用ULTRARIPA® Kit分析神經突觸蛋白復合物
使用的樣本:小鼠腦組織(海馬體+大腦皮質)來源的P2膜組分
目標:NMDA型谷氨酸受體NMDAR(GluN1/GluN2B)
AMPA型谷氨酸受體 AMPAR(GluA1/GluA2)
步驟:
1. | 添加ULTRARIPA® Kit B-buffer至P2膜組分,在冰上進行超聲處理; |
2. | 高速離心(×100,000 g)破碎液,獲取可溶性組分; |
3. | 添加1 μg對照IgG或抗GluN2B抗體或GluA2/3抗體至100 μL可溶性組分,并在4°C下反應1小時后,添 加20μL bed vol Protein A磁珠并反應1小時; |
4. | 用PBST(0.05% Tween20 in PBS)清洗磁珠3次; |
5. | 添加1×SDS-PAGE樣本緩沖液,在100°C加熱條件下洗脫。 |
結果:
使用ULTRARIPA® Kit B-buffer,NMDAR,AMPAR都能通過免疫沉淀特異性的檢測出復合物。
*SYN (Synaptophysin)
相關產品信息請點擊文字:UltraRIPA 脂筏提取緩沖液套裝
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