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DS 抗體領(lǐng)域——人/鼠PD-1交叉反應(yīng)抗體的發(fā)現(xiàn)和結(jié)合機(jī)制的研究

來源:計算模擬平臺   2019年10月29日 15:35  

實施效果

來源:計算模擬平臺

通過Discovery Studio軟件預(yù)測了人/鼠PD-1交叉反應(yīng)抗體的結(jié)合模式,并輔助以實驗驗證,從而精細(xì)解釋了具有人/鼠交叉反應(yīng)抗體的交叉反應(yīng)性機(jī)制,為后續(xù)PD-1抗體研發(fā)做出指導(dǎo)。

 

方案詳情

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程序性死亡受體1(PD-1)是一種重要的免疫抑制受體分子,以PD-1為靶點的免疫調(diào)節(jié)在抗腫瘤、抗感染、抗自身免疫性疾病及器官yi植存活等方面均有重要的意義。PD-1抗體是當(dāng)前備受矚目,廣為關(guān)注的一類腫瘤療法??紤]到PD-1抗體在治療各種癌癥中的重要性和廣泛應(yīng)用,文章作者希望開發(fā)同人/鼠PD-1有交叉反應(yīng)的抗體以加速PD-1抗體的臨床前研究。目前批準(zhǔn)用于臨床或正在研發(fā)中的PD-1抗體都只靶向人hPD-1,而并不顯示與鼠mPD-1有交叉反應(yīng)。因此,本文開發(fā)并報道了一種具有人/鼠PD-1交叉反應(yīng)的功能性抗體,并將該抗體的表位與僅同hPD-1結(jié)合的抗體表位進(jìn)行了比較。

 

文章作者首先用hPD-1和mPD-1免疫大鼠,通過篩選大量的大鼠雜交瘤克隆發(fā)現(xiàn)了既能靶向hPD-1又能靶向mPD-1的抗體R9和只靶向hPD-1的抗體R11。為了快速識別兩個抗體的表位,本研究采用了丙氨酸掃描,并基于ELISA和表面等離子共振技術(shù)。同時結(jié)合分子模擬的方法,采用Discovery Studio(DS)中MODELER程序構(gòu)建出了R11和R9抗體結(jié)構(gòu)模型,并在此基礎(chǔ)上使用DS_ZDOCK/RDOCK蛋白-蛋白對接/優(yōu)化程序,將這兩個抗體與hPD-1進(jìn)行了對接,預(yù)測了兩種抗體不同的結(jié)合模式,研究了他們的結(jié)合表位,從而精細(xì)解釋了具有人/鼠交叉反應(yīng)抗體的交叉反應(yīng)性機(jī)制。

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