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DS在多肽藥物領(lǐng)域的解決方案 基于胰島素肽的設(shè)計(jì)和篩選

來(lái)源:北京創(chuàng)騰科技有限公司   2019年10月29日 15:49  

實(shí)施效果

來(lái)源:計(jì)算模擬平臺(tái)

通過(guò) Discovery Studio 軟件設(shè)計(jì)指導(dǎo)了變構(gòu)肽配體(Altered peptide ligands,APLs)用于治療I型糖尿病。

 

方案詳情

case3_fig1.png

 

I型糖尿病在人類(lèi)和非肥胖糖尿病小鼠中均是一種自身免疫系統(tǒng)缺陷的疾病,有研究表明其主要由于 CD8+ T 細(xì)胞介導(dǎo)的β細(xì)胞損傷,使之不能正常分泌胰島素。變構(gòu)肽配體(Altered peptide ligands,APLs)可以有效抑制抗原-特異性T細(xì)胞失效,凋亡或轉(zhuǎn)移。因此開(kāi)發(fā)有效的 APLs 用于I型糖尿病的治療很有必要。本文通過(guò)分子模擬技術(shù)對(duì)變構(gòu)肽配體進(jìn)行了設(shè)計(jì)和優(yōu)化。

文章作者基于已知的變構(gòu)肽配體與受體的復(fù)合物結(jié)構(gòu),首先通過(guò) Discovery Studio突變了復(fù)合物結(jié)構(gòu)中的關(guān)鍵氨基酸殘基,確定了變構(gòu)肽的關(guān)鍵改造位置,并設(shè)計(jì)了8個(gè)變構(gòu)肽配體。然后結(jié)合DS_Loop refinement 和分子動(dòng)力學(xué)程序 Standard Dynamics Cascade 對(duì)8個(gè)變構(gòu)肽配體的復(fù)合物進(jìn)行了結(jié)構(gòu)模擬和優(yōu)化,并基于MM-PBSA 方法預(yù)測(cè)了它們與受體之間的結(jié)合能,根據(jù)預(yù)測(cè)結(jié)果(表1)選擇其中四個(gè)肽進(jìn)行了合成和生物活性測(cè)試,其中變構(gòu)肽 H6F 活性較好。針對(duì) H6F 進(jìn)行了后續(xù)的試驗(yàn)研究,試驗(yàn)結(jié)果表明變構(gòu)肽配體 H6F 有希望成為一個(gè)治療I類(lèi)糖尿病的藥物。

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