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一、試劑驅(qū)動(dòng)系統(tǒng)：采用氣體及電磁閥驅(qū)動(dòng)液體試劑時(shí)，需首先將管路系統(tǒng)電磁閥前段，含試劑瓶組中壓力加壓到規(guī)定氣壓，通過合成管理軟件或手動(dòng)打開電磁閥(一般打開時(shí)間為數(shù)ms)，即可驅(qū)動(dòng)液體試劑到所需的合成柱中。
二、試劑和堿基瓶組：每種儀器一般都多設(shè)置1-2個(gè)試劑瓶位，用于特殊產(chǎn)物的合成。堿基瓶組一般最少為4個(gè)標(biāo)準(zhǔn)堿基(A/C/G/T),同時(shí)搭配2-多個(gè)特殊堿基瓶位，用于熒光標(biāo)記等合成。
三、壓力管路及輸送管路：每個(gè)瓶子都有一個(gè)氬氣壓力管道及輸送管道進(jìn)入瓶蓋插塞，對(duì)于亞磷酰胺，1—8號(hào)瓶其壓力管道也作為排氣管。氬氣管要保持在液體水平以上，而輸送管卻伸到瓶的底部。當(dāng)閥門正確設(shè)置打開時(shí)，儲(chǔ)液瓶上部空間由氬氣加壓，液體被推進(jìn)輸送管，流到其目的地。
四、輸送電磁閥：當(dāng)有多個(gè)活化柱時(shí)，對(duì)流速的細(xì)微變化，以自動(dòng)調(diào)節(jié)每個(gè)柱子的輸送次數(shù)來補(bǔ)償。每一個(gè)5—端口柱閥塊將流出物導(dǎo)入廢液口、DMT收集口，或DNA收集瓶，它也控制用于除去或沖洗柱內(nèi)和柱閥塊內(nèi)的試劑的氬氣。
五、輔助真空：每次電磁閥打開時(shí)，抽氣泵為每個(gè)閥塊提供了輔助真空，輔助真空在隔膜的螺線管一側(cè)形成，使隔膜形成一圓頂空隙。
六、路節(jié)流閥：試劑通過底部的luer接頭，流到柱子，如果沒擰上下面的一個(gè)luer接頭，應(yīng)會(huì)在一個(gè)圓柱形的玻璃流路節(jié)流閥上發(fā)現(xiàn)。試劑通過流路節(jié)流閥中一個(gè)很小的通道流到柱子。小量的試劑可以在流路節(jié)流閥中結(jié)晶，長(zhǎng)期這樣會(huì)造成流路阻塞。
七、電導(dǎo)池：電導(dǎo)流動(dòng)池是為了測(cè)定在每個(gè)DNA合成循環(huán)內(nèi)釋放的DMT陽離子的總電導(dǎo)而設(shè)計(jì)的。流動(dòng)池是由一空隙隔開的兩個(gè)電極組成，在空隙之間應(yīng)用一小電壓。DMT陽離子流過電導(dǎo)池時(shí)起電導(dǎo)作用。
八、控制器：軟件儲(chǔ)存在一個(gè)可取出的存儲(chǔ)卡中，這個(gè)存儲(chǔ)卡插在儀器的背面。合成信息顯示在液晶顯示屏上，通過選擇鍵板上的鍵可與儀器交流。軟件是“菜單驅(qū)動(dòng)”，通過按適當(dāng)?shù)逆I，可選擇一項(xiàng)，給予指令。為了完成自動(dòng)合成，軟件應(yīng)用一個(gè)包含一系列步驟的循環(huán)來完成全部化學(xué)反應(yīng)。
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