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蛋白質(zhì)印跡故障排除指南

來源:上海拜力生物科技有限公司   2023年05月12日 11:14  

蛋白質(zhì)印跡故障排除指南

Western Blot 是當(dāng)今細(xì)胞和分子的常規(guī)方法之一 生物實(shí)驗(yàn)室。但是,分析蛋白質(zhì)印跡結(jié)果可能會(huì)導(dǎo)致用戶的問題,因?yàn)楂@得的數(shù)據(jù)可能沒有定論。為了幫助您的下一次檢測(cè),我們將常見問題和解決方案放在一起 在一個(gè)指南中。

原因之一可能是抗體選擇錯(cuò)誤。嘗試我們的網(wǎng)上商店,找到合適的一抗和二抗。如果您有任何其他問題,請(qǐng)咨詢我們的。

閱讀本故障排除指南,成為蛋白質(zhì)免疫印跡專家:

  • 在蛋白質(zhì)印跡中使用二抗的一般技巧

  • 無信號(hào)/低靈敏度

  • 高背景

  • 不特定的波段或點(diǎn)

無信號(hào)/低靈敏度

問題

未檢測(cè)到分析物。

原因/補(bǔ)救措施

  • 檢查使用的蛋白質(zhì)量:布拉德福德測(cè)試;
    支鏈氨基酸法

  • 增加蛋白質(zhì)濃度

  • 如果可能,使用抗原表達(dá)水平高的陽性對(duì)照

  • 使用新鮮的裂解緩沖液

  • 向樣品緩沖液中加入蛋白酶抑制劑

  • 將樣品儲(chǔ)存在冰上 (4°C)

分析物在電泳過程中用完凝膠

  • 使用蛋白質(zhì)分子量標(biāo)準(zhǔn)確保目標(biāo)蛋白質(zhì)(kDa)仍在凝膠內(nèi)。

  • 縮短電泳時(shí)間

無需從凝膠轉(zhuǎn)移到膜

  • 檢查蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)移是否成功:麗春紅S染色

  • 使用上樣對(duì)照(管家)來確保蛋白質(zhì)的轉(zhuǎn)移相等。

  • 延長(zhǎng)傳輸時(shí)間

錯(cuò)誤的印跡膜

聚偏氟乙烯

  • 需要用甲醇活化

  • 高結(jié)合能力(170 雙 200 μg/cm2)

  • 與硝酸纖維素膜相比,更多背景

  • 適用于剝離緩沖液和重新探測(cè)。

硝基細(xì)胞使用

  • 結(jié)合能力低(80 雙 100 μg/cm2)

  • 更少的背景

為您的樣品選擇合適的孔徑:

  • 0.1, 0.2 或 0.45μm.(0.45μm孔徑適用于大多數(shù)蛋白質(zhì)(≥20kDa))

轉(zhuǎn)移條件

  • 轉(zhuǎn)印前去除凝膠和印跡膜之間的任何氣泡。

  • 減少傳輸時(shí)間和/或電流(“過度傳輸”)。

阻止持續(xù)時(shí)間

縮短阻塞持續(xù)時(shí)間

  • 室溫下1h

封閉劑的選擇

抗原掩膜

  • 使用較低的濃度

  • 使用其他緩沖區(qū)

我們建議使用來自同一物種的5%正常血清作為二抗或不含IgG的BSA。

強(qiáng)力洗滌

  • 減少洗滌步驟的次數(shù)和/或持續(xù)時(shí)間

  • 3x 5 分鐘(室溫)

  • 降低洗滌劑的濃度

  • 0.1-0.5% 吐溫 20

一抗錯(cuò)誤

確保您選擇的抗體適用于蛋白質(zhì)免疫印跡(數(shù)據(jù)表)

孵育時(shí)間(一抗)

延長(zhǎng)孵育時(shí)間

  • 4°C 過夜

抗體濃度低

  • 檢查使用的抗體濃度。

  • 驗(yàn)證相關(guān)性

  • 從數(shù)據(jù)表中所述的較高濃度開始。然后逐步降低注意力。

二抗錯(cuò)誤

檢查二抗是否與所選的一抗結(jié)合(數(shù)據(jù)表)

辣根過氧化物酶(HRP)活性受到抑制

  • 不要在緩沖液中使用疊氮Hua鈉。因?yàn)樗种艸RP(辣根過氧化物酶)偶聯(lián)活性。

  • 不要使用甘油與ACS等級(jí)低于99,5%。因?yàn)樗种艸RP(辣根過氧化物酶)偶聯(lián)活性。

  • 避免反復(fù)冷凍和解凍抗體溶液。

  • 準(zhǔn)備小等分試樣

抗體儲(chǔ)存技巧

ECL試劑已過期

使用新鮮的ECL試劑

ECL試劑污染

使用新鮮的ECL試劑

曝光時(shí)間

  • 根據(jù)抗原表達(dá)水平的不同,暴露時(shí)間可能會(huì)有所不同

  • 通過小步驟增加暴露時(shí)間

高背景

問題

原因/補(bǔ)救措施

高抗原表達(dá)水平

降低蛋白質(zhì)濃度

封閉劑的選擇

  • 如果需要檢測(cè)磷酸化蛋白質(zhì),請(qǐng)勿使用奶粉。

  • 一抗可能與酪蛋白發(fā)生交叉反應(yīng)

  • 如果使用鏈霉親和素/親和素偶聯(lián)物,請(qǐng)勿使用奶粉。

  • 牛奶含有內(nèi)源性生物素

  • BSA和奶粉不適用于檢測(cè)山羊、牛或綿羊的二抗。

  • 二抗可能與來自BSA或奶粉的牛免疫球蛋白發(fā)生交叉反應(yīng)

我們建議使用來自同一物種的5%正常血清作為二抗或不含IgG的BSA。

孵育時(shí)間(封閉試劑)

延長(zhǎng)孵育時(shí)間

  • 室溫下1h

一抗?jié)舛儒e(cuò)誤

  • 降低一抗?jié)舛?/p>

  • 滴定

二抗?jié)舛儒e(cuò)誤

  • 降低二抗?jié)舛?/p>

  • 滴定

洗滌

曝光時(shí)間

  • 增加洗滌步驟的數(shù)量和/或持續(xù)時(shí)間

  • 3 x 5分鐘 – 5 x 5分鐘

  • 將吐溫 20 添加到洗滌緩沖液中

  • (0.1-0.5%)

  • 使用振動(dòng)篩

根據(jù)抗原表達(dá)水平的不同,暴露時(shí)間可能會(huì)有所不同

轉(zhuǎn)印膜

  • 處理膜時(shí)使用鑷子

  • 膜不應(yīng)變干

檢測(cè)試劑

降低底物濃度

不特定的條帶或點(diǎn)

問題

原因/補(bǔ)救措施

蛋白質(zhì)被 降解

  • 使用新鮮的裂解物

  • 將樣品儲(chǔ)存在冰上 (4°C)

  • 將蛋白酶抑制劑添加到樣品緩沖液中

樣品條件

  • 檢測(cè)到錯(cuò)誤的亞型

  • 翻譯后修飾

  • 分子量變化,可能導(dǎo)致雙條帶

  • 如果可能,使用陽性對(duì)照

  • 如果可能,使用陰性對(duì)照

  • 樣品和/或緩沖液的細(xì)菌污染

  • 準(zhǔn)備新鮮樣品或緩沖液

  • 使用去離子水

轉(zhuǎn)印膜

  • 轉(zhuǎn)印前去除凝膠和印跡膜之間的任何氣泡。

  • 在封閉之前快速清洗膜,以去除任何殘留的凝膠或SDS。

一抗

  • 驗(yàn)證一抗的特異性結(jié)合

  • 在對(duì)照實(shí)驗(yàn)中使用不含一抗的二抗。

  • 優(yōu)化抗體濃度(滴定)。

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