繼上文《一文了解tNGS》之后,今天我們講講它的“兄弟”——mNGS吧~
一、?mNGS簡(jiǎn)介
?mNGS(Metagenomic Next Generation Sequencing)?是一種無(wú)需培養(yǎng)即可快速鑒定感染病原體的新技術(shù),即宏基因組學(xué)二代測(cè)序技術(shù),正在改變病原微生物檢測(cè)的現(xiàn)狀。它通過(guò)無(wú)需培養(yǎng)樣本的方式,實(shí)現(xiàn)高通量、快速鑒定感染病原體,顯著提高了檢測(cè)的敏感性和特異性。其原理、優(yōu)點(diǎn)和應(yīng)用場(chǎng)景如下。
二、?mNGS原理
mNGS通過(guò)對(duì)臨床樣本的DNA或RNA進(jìn)行高通量測(cè)序,無(wú)差別、無(wú)選擇性地對(duì)樣本中的核酸進(jìn)行測(cè)序,然后與已知微生物數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行比對(duì)分析,從而判斷樣本中包含的病原微生物種類。這種方法不依賴于傳統(tǒng)的微生物培養(yǎng),也不需要進(jìn)行特異性擴(kuò)增,能夠快速、客觀地檢測(cè)臨床樣本中的病原微生物?。
三、?mNGS優(yōu)點(diǎn)
1. ?無(wú)偏倚、全覆蓋?:mNGS能夠?qū)z測(cè)樣本中的所有生物基因組進(jìn)行無(wú)偏倚測(cè)序,適用于常規(guī)手段無(wú)法檢測(cè)到的病原微生物?。
2. ?高效性?:mNGS能夠在短時(shí)間內(nèi)完成大量樣本的測(cè)序和分析,大大提高了檢測(cè)效率?。
3. ?無(wú)需培養(yǎng)?:直接對(duì)臨床樣本進(jìn)行核酸測(cè)序,避免了傳統(tǒng)培養(yǎng)方法的時(shí)間和資源消耗?。
4. ?信息量大?:mNGS不僅能檢測(cè)已知病原體,還能發(fā)現(xiàn)新的病原體,對(duì)于新型病毒的迅速鑒定具有重要價(jià)值?。
5. ?多病原體檢測(cè)?:mNGS能夠同時(shí)檢測(cè)多種病原體,適用于多病原體引起的疾病?。
四、mNGS應(yīng)用場(chǎng)景
1. ?復(fù)雜感染?:在經(jīng)驗(yàn)治療失敗、復(fù)雜感染、不明原因的危重癥、免疫缺陷等特殊患者人群中,mNGS是一種高效的病原體篩查方法?。
2. ?新發(fā)突發(fā)傳染病?:mNGS能夠迅速鑒定新型病毒,為疫情防控提供重要支持?。
3. ?混合感染?:mNGS能夠檢測(cè)混合感染,幫助醫(yī)生更準(zhǔn)確地制定治療方案?。
4. ?藥物選擇?:mNGS能夠指導(dǎo)抗菌藥物的精準(zhǔn)選擇,提高治療效果?。
五、mNGS歷史背景和發(fā)展趨勢(shì)
mNGS技術(shù)在臨床上的應(yīng)用時(shí)間并不長(zhǎng),但發(fā)展迅速。第一例報(bào)道是在2014年的《New England Journal of Medicine》,隨后在國(guó)內(nèi)的臨床應(yīng)用也逐漸增多。隨著技術(shù)的不斷進(jìn)步和成本的降低,mNGS有望在更多領(lǐng)域得到應(yīng)用。
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