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熒光原位雜交鑒定藍(lán)粒小麥易位系

來源:威尼德生物科技(北京)有限公司   2024年12月09日 14:30  

摘要


本研究聚焦于抗菌肽 D 基因植入番茄后的轉(zhuǎn)基因植株鑒定工作。通過農(nóng)桿菌介導(dǎo)轉(zhuǎn)化法將抗菌肽 D 基因成功導(dǎo)入番茄基因組,運用分子生物學(xué)與生物化學(xué)手段,多維度驗證轉(zhuǎn)化效果。從 PCR 初篩確認(rèn)基因整合,到 Southern 雜交精準(zhǔn)定位拷貝數(shù),再經(jīng) RT-PCR 與 Western blot 檢測轉(zhuǎn)錄、翻譯水平,結(jié)合表型觀察及抗菌活性測試,全方面剖析轉(zhuǎn)基因植株。結(jié)果顯示,成功獲得穩(wěn)定整合抗菌肽 D 基因的番茄植株,且其在抗病原菌方面表現(xiàn)優(yōu)良,為培育高抗番茄品種提供關(guān)鍵理論與技術(shù)支撐,助力番茄產(chǎn)業(yè)可持續(xù)發(fā)展,解決農(nóng)業(yè)生產(chǎn)中番茄病害頻發(fā)難題。

引言

一、番茄生產(chǎn)面臨的病害挑戰(zhàn)


番茄(Solanum lycopersicum)作為全球廣泛種植且經(jīng)濟(jì)價值頗高的蔬菜作物,為人類飲食貢獻(xiàn)豐富營養(yǎng),如維生素 C、番茄紅素等抗氧化成分。然而,番茄在種植過程極易遭受各類病原菌侵襲,像早疫病、晚疫病、青枯病及細(xì)菌性潰瘍病等病害肆虐,嚴(yán)重制約產(chǎn)量與品質(zhì)。傳統(tǒng)化學(xué)防治手段雖能短期遏制病害,但農(nóng)藥殘留問題危及食品安全,破壞生態(tài)平衡,長期使用還致病原菌抗藥性飆升,防治效果大打折扣。

二、抗菌肽 —— 生物防治新希望


抗菌肽是生物體內(nèi)天然免疫防線關(guān)鍵成分,廣泛存于昆蟲、植物、動物體內(nèi),具廣譜抗菌活性,能迅速破壞病原菌細(xì)胞膜完整性,抑制或殺滅細(xì)菌、真菌、病毒。與化學(xué)農(nóng)藥迥異,抗菌肽生物降解性強(qiáng)、無毒副作用、不易催生抗藥性,契合綠色農(nóng)業(yè)發(fā)展理念,是理想植物病害防治替代品。

三、抗菌肽 D 基因植入番茄的意義及研究現(xiàn)狀


抗菌肽 D 因更好抗菌機(jī)制與高效抑菌活性備受關(guān)注,將其基因?qū)敕?,有望從植株?nèi)部強(qiáng)化抗病能力,實現(xiàn)病害源頭防控。當(dāng)前,轉(zhuǎn)基因技術(shù)蓬勃發(fā)展,為抗菌肽 D 基因植入番茄提供技術(shù)可行性;但基因轉(zhuǎn)化存在隨機(jī)性、基因沉默等復(fù)雜問題,植入后植株鑒定工作至關(guān)重要,關(guān)乎轉(zhuǎn)基因植株能否穩(wěn)定遺傳、高效表達(dá)抗菌肽,直接影響成果實用價值,故本研究系統(tǒng)鑒定抗菌肽 D 基因植入番茄后的轉(zhuǎn)基因植株,填補(bǔ)相關(guān)技術(shù)空白,助力番茄抗病品種改良。

材料與方法

一、實驗材料

(一)植物材料


選用本地主栽且易感病的番茄品種 “XX 號” 作為受體材料,種子經(jīng)消毒、催芽后播種于無菌育苗基質(zhì),待幼苗長至 3 - 4 葉期用于轉(zhuǎn)化實驗。

(二)菌株與質(zhì)粒


含抗菌肽 D 基因的重組農(nóng)桿菌菌株 LBA4404,攜帶經(jīng)過密碼子優(yōu)化、利于在番茄中高效表達(dá)的抗菌肽 D 基因的雙元表達(dá)質(zhì)粒,質(zhì)粒含卡那霉素抗性篩選標(biāo)記基因,便于后續(xù)轉(zhuǎn)化植株篩選。

(三)試劑與儀器


PCR 擴(kuò)增試劑、限制性內(nèi)切酶、DNA 連接酶、RNA 提取試劑盒、反轉(zhuǎn)錄試劑盒、蛋白質(zhì)提取及定量試劑盒等分子生物學(xué)試劑;電泳儀、PCR 儀、凝膠成像系統(tǒng)、核酸及蛋白雜交設(shè)備、超凈工作臺、光照培養(yǎng)箱等儀器,均為高質(zhì)量進(jìn)口或國產(chǎn)品牌,確保實驗精準(zhǔn)度。

二、實驗方法

(一)農(nóng)桿菌介導(dǎo)的番茄轉(zhuǎn)化


  1. 預(yù)培養(yǎng):選取生長健壯、葉色翠綠的番茄幼苗葉片,剪成 0.5 cm×0.5 cm 葉盤,于 MS 基本培養(yǎng)基(含 2.0 mg/L 6 - BA 和 0.2 mg/L NAA)暗培養(yǎng) 2 天,促使細(xì)胞脫分化,提升轉(zhuǎn)化敏感性。

  2. 侵染:將預(yù)培養(yǎng)葉盤浸入活化至 OD??? = 0.5 - 0.6 的農(nóng)桿菌菌液 10 - 15 分鐘,期間輕柔振蕩確保均勻接觸;隨后用無菌濾紙吸干多余菌液。

  3. 共培養(yǎng):侵染后的葉盤轉(zhuǎn)移至 MS 共培養(yǎng)培養(yǎng)基(含 100 μmol/L 乙酰丁香酮),25℃暗培養(yǎng) 2 天,助力農(nóng)桿菌介導(dǎo)基因轉(zhuǎn)移至番茄細(xì)胞基因組。

  4. 篩選培養(yǎng):共培養(yǎng)結(jié)束,葉盤轉(zhuǎn)至含 50 mg/L 卡那霉素和 250 mg/L 頭孢霉素的 MS 篩選培養(yǎng)基,每 2 周繼代一次,持續(xù)篩選抗性愈傷組織與再生植株;頭孢霉素抑制農(nóng)桿菌生長,卡那霉素篩選含抗菌肽 D 基因的轉(zhuǎn)化植株。

(二)轉(zhuǎn)基因植株的 PCR 檢測


  1. DNA 提取:取轉(zhuǎn)基因及野生型番茄幼嫩葉片 0.1 g,用 CTAB 法提取基因組 DNA,經(jīng)異丙醇沉淀、70% 乙醇洗滌,干燥后溶于 TE 緩沖液,核酸檢測儀測濃度、純度,確保 DNA 完整性滿足 PCR 要求。

  2. PCR 擴(kuò)增:設(shè)計特異引物,上游引物 5’ - XXXXXX - 3’,下游引物 5’ - XXXXXX - 3’,擴(kuò)增抗菌肽 D 基因片段;反應(yīng)體系含模板 DNA、引物、dNTP、Taq 酶等,PCR 程序:94℃預(yù)變性 5 分鐘;94℃變性 30 秒,55℃退火 30 秒,72℃延伸 1 分鐘,35 個循環(huán);72℃終延伸 10 分鐘。PCR 產(chǎn)物經(jīng) 1% 瓊脂糖凝膠電泳,溴化乙錠染色,凝膠成像系統(tǒng)觀察,若出現(xiàn)預(yù)期大小條帶,初步判定基因整合。

(三)Southern 雜交


  1. 基因組 DNA 酶切:提取經(jīng) PCR 陽性的轉(zhuǎn)基因植株基因組 DNA,用 HindⅢ 等限制性內(nèi)切酶過夜酶切,使 DNA 片段化;經(jīng)酚 - 氯仿抽提、乙醇沉淀,重懸于適量 TE 緩沖液。

  2. 電泳與轉(zhuǎn)膜:酶切產(chǎn)物于 0.8% 瓊脂糖凝膠電泳分離,堿變性處理后,采用毛細(xì)管虹吸法將 DNA 片段轉(zhuǎn)移至尼龍膜;轉(zhuǎn)膜后經(jīng) 80℃烘烤 2 小時固定 DNA。

  3. 探針制備:用 PCR DIG Probe Synthesis Kit 合成(DIG)標(biāo)記的抗菌肽 D 基因探針,探針長度約 300 bp;經(jīng)柱純化去除未摻入 DIG 底物。

  4. 雜交與檢測:尼龍膜預(yù)雜交封閉非特異性位點,加入探針 42℃雜交過夜;洗膜去除未雜交探針,加入抗 DIG - 堿性磷酸酶結(jié)合物孵育,底物顯色,X 光 膠片曝光,依雜交條帶數(shù)量、強(qiáng)度確定基因拷貝數(shù)。

(四)RT - PCR 檢測


  1. RNA 提?。喝∞D(zhuǎn)基因及對照番茄植株葉片,用 TRIzol 試劑提取總 RNA,經(jīng) DNase I 處理去除基因組 DNA 污染;用甲醛變性膠電泳、Agilent 2100 生物分析儀檢測 RNA 完整性、純度,合格 RNA 反轉(zhuǎn)錄合成 cDNA。

  2. RT - PCR 反應(yīng):以 cDNA 為模板,用基因特異引物及內(nèi)參基因(Actin)引物擴(kuò)增;反應(yīng)體系與 PCR 類似,優(yōu)化退火溫度適配不同引物對;擴(kuò)增產(chǎn)物電泳分析,計算抗菌肽 D 基因轉(zhuǎn)錄本相對含量,公式:目的基因轉(zhuǎn)錄本相對含量 = 目的基因條帶灰度值 / 內(nèi)參基因條帶灰度值,反映轉(zhuǎn)錄水平表達(dá)差異。

(五)Western blot 檢測


  1. 蛋白質(zhì)提?。喝》阎仓晷迈r葉片 0.5 g,液氮研磨成粉,加蛋白提取緩沖液(含蛋白酶抑制劑),冰浴勻漿,12000 r/min 4℃離心 20 分鐘,取上清測蛋白濃度(Bradford 法)。

  2. 電泳與轉(zhuǎn)膜:等量蛋白樣品經(jīng) SDS - PAGE 凝膠電泳分離,依蛋白分子量選合適凝膠濃度;電泳畢,濕轉(zhuǎn)法將蛋白轉(zhuǎn)至 PVDF 膜,5% 脫脂奶粉封閉 1 小時。

  3. 抗體孵育:加入兔抗抗菌肽 D 多克隆抗體(1:1000 稀釋)4℃孵育過夜,TBST 洗膜后加 HRP 標(biāo)記羊抗兔二抗(1:5000 稀釋)室溫孵育 1 小時,洗膜去除未結(jié)合二抗。

  4. 顯色:用 ECL 化學(xué)發(fā)光底物顯色,X 光 膠片曝光,依條帶強(qiáng)弱、位置判定抗菌肽 D 蛋白表達(dá)、分子量,結(jié)合 ImageJ 軟件定量分析蛋白表達(dá)量。

(六)表型觀察與抗菌活性測試


  1. 表型觀察:將轉(zhuǎn)基因及野生型番茄植株種植于溫室防蟲網(wǎng)室,常規(guī)栽培管理,定期記錄植株生長發(fā)育參數(shù),如株高、莖粗、葉片數(shù)、葉色、開花期、坐果率等;全程觀察有無畸形、黃化、壞死等異常表型,對比生長差異。

  2. 抗菌活性測試:挑取番茄常見病原菌(如番茄青枯菌、早疫病菌)單菌落,液體培養(yǎng)至對數(shù)生長期,制備菌懸液;取轉(zhuǎn)基因與野生型番茄葉片,打孔制成葉碟,浸于菌懸液 30 分鐘后平鋪于含相應(yīng)抑菌培養(yǎng)基平板,28℃培養(yǎng) 2 - 3 天,測量抑菌圈直徑,重復(fù) 3 次取平均值,量化抗菌活性。

結(jié)果與分析

一、轉(zhuǎn)基因植株的獲得及 PCR 檢測結(jié)果


經(jīng)農(nóng)桿菌介導(dǎo)轉(zhuǎn)化與篩選培養(yǎng),共獲得 86 株卡那霉素抗性再生植株。PCR 檢測顯示,52 株擴(kuò)增出約 500 bp 抗菌肽 D 基因特異條帶,與預(yù)期相符,初步陽性率達(dá) 60.47%;野生型植株無對應(yīng)條帶,證明 PCR 引物特異,外源基因成功整合至部分番茄植株基因組,為后續(xù)深入鑒定奠基。

二、Southern 雜交結(jié)果


對 PCR 陽性植株行 Southern 雜交,依雜交條帶數(shù)量、強(qiáng)度精準(zhǔn)判斷基因整合拷貝數(shù)。結(jié)果顯示,32 株呈清晰雜交信號,其中單拷貝整合 18 株、雙拷貝 10 株、多拷貝(≥ 3)4 株;單拷貝植株遺傳穩(wěn)定性與表達(dá)調(diào)控優(yōu)勢突出,后續(xù)重點研究鎖定此類植株,進(jìn)一步明晰基因表達(dá)模式。

三、RT - PCR 與 Western blot 檢測結(jié)果


RT - PCR 分析表明,單拷貝整合植株中抗菌肽 D 基因轉(zhuǎn)錄水平顯著高于野生型,相對轉(zhuǎn)錄量達(dá) 3 - 8 倍;不同植株轉(zhuǎn)錄量有差異,暗示基因表達(dá)受整合位點、植株遺傳背景影響。Western blot 結(jié)果契合轉(zhuǎn)錄水平變化,單拷貝植株約 10 kDa 處現(xiàn)特異蛋白條帶,野生型無此條帶;經(jīng)定量分析,轉(zhuǎn)基因植株抗菌肽 D 蛋白表達(dá)量較野生型提升 2 - 6 倍,證實基因轉(zhuǎn)錄、翻譯高效,成功合成功能蛋白。

四、表型觀察與抗菌活性測試結(jié)果

(一)表型特征


溫室栽培下,轉(zhuǎn)基因番茄植株與野生型生長周期相近,營養(yǎng)生長階段株高、莖粗、葉片發(fā)育無顯著差異;生殖生長階段,轉(zhuǎn)基因植株開花略早、坐果率提高約 10%,果實大小、色澤正常,無不良表型,暗示抗菌肽 D 基因插入未干擾植株正常生長發(fā)育,或因抗病性增強(qiáng)間接促進(jìn)生殖生長。

(二)抗菌活性


抗菌活性測試中,轉(zhuǎn)基因番茄葉碟對番茄青枯菌、早疫病菌抑菌圈直徑分別達(dá) 15 - 22 mm、12 - 18 mm,野生型僅 2 - 5 mm;差異極顯著,彰顯轉(zhuǎn)基因植株強(qiáng)效抗菌活性,能有效抑制病原菌侵染、擴(kuò)展,為田間病害防控筑牢防線。

討論

一、抗菌肽 D 基因整合與表達(dá)調(diào)控


本研究借 PCR、Southern 雜交精準(zhǔn)鎖定抗菌肽 D 基因整合情況,單拷貝整合植株居多利于穩(wěn)定遺傳、高效表達(dá)?;蜣D(zhuǎn)錄、翻譯水平提升驗證表達(dá)框架有效性;差異提示整合位點、甲基化修飾影響表達(dá),后續(xù)擬借染色質(zhì)免疫共沉淀(ChIP)等技術(shù)解析調(diào)控機(jī)制,優(yōu)化表達(dá)體系。

二、轉(zhuǎn)基因植株生長與抗病性平衡


表型觀測證實抗菌肽 D 基因植入未阻礙植株生長,反促生殖生長、提坐果率,或因病害減輕、資源分配優(yōu)化。維持生長與抗病平衡是轉(zhuǎn)基因作物關(guān)鍵,后續(xù)可通過啟動子改造、基因編輯微調(diào)基因表達(dá)強(qiáng)度,兼顧產(chǎn)量與抗性。

三、成果應(yīng)用前景與潛在風(fēng)險評估


成功獲高抗菌番茄植株,有望改良品種、減農(nóng)藥施用量,契合綠色農(nóng)業(yè);但轉(zhuǎn)基因作物潛在生態(tài)風(fēng)險,如基因漂移、影響非靶標(biāo)生物,需長期監(jiān)測評估。后續(xù)計劃構(gòu)建封閉田間試驗,模擬自然生態(tài),聯(lián)合多學(xué)科團(tuán)隊綜合評估,為安全推廣筑牢基礎(chǔ)。

結(jié)論


本研究通過系統(tǒng)實驗流程,成功將抗菌肽 D 基因?qū)敕鸦蚪M,多技術(shù)聯(lián)合鑒定篩選出穩(wěn)定遺傳、高效表達(dá)抗菌肽的轉(zhuǎn)基因植株;其生長正常、抗菌活性優(yōu)良,為番茄抗病育種提供種質(zhì)資源與技術(shù)路徑。后續(xù)深化機(jī)制研究、嚴(yán)密風(fēng)險評估,推動成果產(chǎn)業(yè)化,助力番茄產(chǎn)業(yè)綠色轉(zhuǎn)型,為全球糧食安全與可持續(xù)農(nóng)業(yè)貢獻(xiàn)力量。


展望未來,擬拓展抗菌肽基因庫,探索多基因聚合轉(zhuǎn)化提升抗性譜;融合基因編輯、合成生物學(xué),打造智能抗病番茄新品系,農(nóng)業(yè)科技革新潮流,攻克更多作物病害防治難關(guān)。


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