《The epitranscriptional factor PCIF1 orchestrates CD8+ T cell ferroptosis and activation to control
antitumor immunity》是 2025 年發(fā)表在《Nature Immunology》上的一篇文章, PCIF1是一種表觀轉(zhuǎn)錄因子,
通過(guò)調(diào)控RNA的m6Am修飾,在CD8+T細(xì)胞的抗腫瘤免疫反應(yīng)中發(fā)揮關(guān)鍵作用。研究發(fā)現(xiàn),PCIF1在CD8+T細(xì)胞
中具有抑制性作用,其缺失能夠增強(qiáng)T細(xì)胞的抗腫瘤活性,從而提高免疫治療的效果。
一、 研究背景
近年來(lái),T細(xì)胞免疫療法作為一種新興的細(xì)胞免疫療法,在癌癥治療領(lǐng)域取得了顯著的突破,為患者帶來(lái)了
新的希望。然而,目前的治療效果在持久性方面仍存在一定的局限性,需要深入探究其內(nèi)在分子機(jī)制以進(jìn)一
步優(yōu)化治療方案。研究發(fā)現(xiàn),通過(guò)靶向關(guān)鍵的轉(zhuǎn)錄或表觀轉(zhuǎn)錄因子,可以顯著增強(qiáng)T細(xì)胞的抗腫瘤功能,從而
提升免疫治療的整體效果。
表觀轉(zhuǎn)錄組學(xué)作為當(dāng)前生物學(xué)領(lǐng)域的一個(gè)新興分支,主要聚焦于RNA修飾及其在基因表達(dá)調(diào)控中的重要作用。
其中,m6Am(N6,2'-O-二甲基腺苷)作為一種重要的RNA修飾,是真核生物mRNA帽端的修飾之一。在生物學(xué)
過(guò)程中,m6Am修飾在基因表達(dá)調(diào)控中扮演著關(guān)鍵角色,它可以影響mRNA的穩(wěn)定性、翻譯效率以及剪接等過(guò)
程,從而精細(xì)地調(diào)控基因表達(dá)。
在該篇文章中,研究人員發(fā)現(xiàn)m6Am修飾通過(guò) PCIF1 這一甲基轉(zhuǎn)移酶來(lái)實(shí)現(xiàn),PCIF1 催化 m6Am沉積在 mRNA
的 5' 端,從而調(diào)控基因表達(dá)。研究發(fā)現(xiàn),Pcif1 缺失會(huì)導(dǎo)致 m6Am 修飾的靶基因(如鐵死亡抑制基因
Fth1、Slc3a2 和 T 細(xì)胞激活基因 Cd69)表達(dá)增加,進(jìn)而賦予 CD8+ T細(xì)胞對(duì)鐵死亡的抗性和增強(qiáng)其激活能力,
最終增強(qiáng)抗腫瘤免疫反應(yīng)。
二、 研究結(jié)果
1) 提高 Pcif1 基因缺失小鼠的腫瘤免疫力
為探究PCIF1在體內(nèi)調(diào)控抗腫瘤免疫的生理作用,研究人員構(gòu)建了全身性Pcif1敲除小鼠(Pcif1 KO),通過(guò)將
Pcif1fl/fl小鼠與CAG-Cre轉(zhuǎn)基因小鼠雜交,刪除Pcif1基因15個(gè)編碼外顯子中的10個(gè)(外顯子5-14),在C57BL/6
背景下生成Pcif1 KO小鼠。分子檢測(cè)證實(shí)其脾臟、肺、心臟和肝臟中Pcif1蛋白wan全缺失,且該敲除小鼠在8周齡
時(shí)體重、肝功能、血常規(guī)及T細(xì)胞亞群組成與野生型(WT)小鼠均無(wú)顯著差異,表現(xiàn)出正常生存能力和繁殖能
力。進(jìn)一步通過(guò)LLC、B16-F10和MC38同基因腫瘤模型發(fā)現(xiàn),Pcif1 KO小鼠的腫瘤生長(zhǎng)速度顯著減緩,生存期顯
著延長(zhǎng),表明Pcif1缺失可抑制多種腫瘤模型的生長(zhǎng)并延長(zhǎng)宿主存活時(shí)間。
2) Pcif1 KO 可通過(guò) CD8+ Teff細(xì)胞提高抗腫瘤免疫力
為探究PCIF1在抗腫瘤免疫中的作用,研究人員構(gòu)建了全身性Pcif1 KO和T細(xì)胞特異性敲除小鼠(Pcif1 cKO)。
通過(guò)scRNA-seq和流式細(xì)胞術(shù)分析發(fā)現(xiàn),Pcif1缺失顯著增加TME中CD8+ T細(xì)胞比例及效應(yīng)細(xì)胞因子IFNγ、
TNF、Gzmb分泌,并促進(jìn)PD-1+Tcf-1+干性、CD44+CD8+記憶性T細(xì)胞亞群、CD69+CD103+CD8+組織駐留記憶
T細(xì)胞的富集,同時(shí)減少耗竭型PD-1+Tim3+CD8+T細(xì)胞。選擇性耗竭實(shí)驗(yàn)證實(shí),CD8+T細(xì)胞是Pcif1 KO小鼠腫瘤生
長(zhǎng)抑制的關(guān)鍵因素。T細(xì)胞特異性敲除模型進(jìn)一步驗(yàn)證,Pcif1缺失通過(guò)增強(qiáng)T細(xì)胞抗腫瘤免疫應(yīng)答,顯著抑制LLC
腫瘤和B16-F10黑色素瘤的生長(zhǎng)并延長(zhǎng)生存期。這些發(fā)現(xiàn)為以下觀點(diǎn)提供了證據(jù):TME 中腫瘤浸潤(rùn) CD8+Teff
細(xì)胞的增加有助于增強(qiáng) Pcif1 cKO 小鼠的抗腫瘤免疫反應(yīng)。
3) PCIF1 通過(guò) m6Am修飾調(diào)節(jié) CD8+T 細(xì)胞活化
研究發(fā)現(xiàn),Pcif1 缺失通過(guò)增強(qiáng) TCR信號(hào)通路活性顯著提升 CD8+T 細(xì)胞的體外激活水平及細(xì)胞毒性功能,
Pcif1 KO小鼠 CD8+T 細(xì)胞在抗CD3/CD28 抗體刺激后,活化標(biāo)志物 CD69 的表達(dá)量及效應(yīng)因子 IFNγ、TNF、
Gzmb 的分泌水平均顯著高于WT細(xì)胞,且 TCR 通路關(guān)鍵分子 LCK 和 LAT 的磷酸化水平顯著增強(qiáng)。進(jìn)一步
機(jī)制研究表明,Pcif1 的 m?Am甲基轉(zhuǎn)移酶活性是其抑制 CD8+T 細(xì)胞激活的關(guān)鍵,催化失活突變體(Asn552Ala)
無(wú)法逆轉(zhuǎn) Pcif1 敲除導(dǎo)致的 CD8+ T細(xì)胞過(guò)度活化,而野生型 Pcif1 的異位表達(dá)可有效恢復(fù)細(xì)胞因子分泌及 mRNA
表達(dá)水平,這些結(jié)果表明,PCIF1 主要通過(guò)其 m6Am甲基轉(zhuǎn)移酶活性抑制 CD8+T 細(xì)胞的活化。

4) 鑒定 CD8+T 細(xì)胞中的 Pcif1 下游靶標(biāo)
研究揭示了PCIF1通過(guò)其m?Am甲基轉(zhuǎn)移酶活性調(diào)控CD8+T細(xì)胞激活與鐵死亡的機(jī)制。代謝標(biāo)記與
TMT-MS分析顯示,Pcif1敲除CD8+T細(xì)胞整體蛋白翻譯未顯著變化,但有312個(gè)差異表達(dá)蛋白,涉
及鐵死亡和T細(xì)胞毒性通路。m?Am測(cè)序確認(rèn)Pcif1敲除使m?Am水平下降,影響特定靶點(diǎn)如Fth1、
Slc3a2和Cd69的蛋白表達(dá),但mRNA水平不變,表明翻譯調(diào)控。PRM、WB和RIP實(shí)驗(yàn)進(jìn)一步證實(shí)
Pcif1通過(guò)m?Am修飾抑制這些蛋白的翻譯。盡管CTBP2在其他情境下參與m?Am調(diào)控,但在CD8+T
細(xì)胞中非必需。IP-MS分析發(fā)現(xiàn)Pcif1與蛋白質(zhì)翻譯和mRNA加工相關(guān)因子相互作用。功能實(shí)驗(yàn)表明,
Pcif1缺失使CD8+ T細(xì)胞鐵含量降低、GSH和胱氨酸水平升高,增強(qiáng)對(duì)鐵死亡誘導(dǎo)劑的抵抗力,主要
通過(guò)上調(diào)Fth1和Slc3a2等基因的蛋白表達(dá)實(shí)現(xiàn)。綜上研究結(jié)果表明,Pcif1缺失主要通過(guò)增強(qiáng)Fth1和
Slc3a2等鐵死亡調(diào)控基因的表達(dá)來(lái)減少CD8+T細(xì)胞的鐵死亡。

5) Pcif1 缺乏可增強(qiáng) PD-1 阻斷和 CAR-T 細(xì)胞療法的效果
研究發(fā)現(xiàn),T細(xì)胞中Pcif1的缺失通過(guò)抑制鐵死亡并增強(qiáng)CD8+ T細(xì)胞的激活,顯著提升了抗腫瘤免疫應(yīng)答。
在小鼠模型中,Pcif1條件性敲除小鼠的腫瘤對(duì)抗PD-1免疫治療的敏感性顯著增強(qiáng),表現(xiàn)為腫瘤生長(zhǎng)抑制、
生存期延長(zhǎng)及腫瘤浸潤(rùn)CD8+T細(xì)胞增多。進(jìn)一步研究表明,Pcif1缺失通過(guò)m?Am甲基轉(zhuǎn)移酶活性調(diào)控Fth1、
Slc3a2等基因的翻譯,減少鐵死亡并增強(qiáng)T細(xì)胞效應(yīng)功能。在CAR-T細(xì)胞治療中,Pcif1敲除的CD8+CAR-T
細(xì)胞(尤其是靶向CD19的CAR-T)在LLC-hCD19、MC38-hCD19等腫瘤模型中表現(xiàn)出更強(qiáng)的抑瘤活性,
其機(jī)制與鐵死亡抑制及效應(yīng)因子IFNγ、TNF、Gzmb分泌增加相關(guān)。挽救實(shí)驗(yàn)證實(shí),下調(diào)Fth1或Slc3a2可逆轉(zhuǎn)
Pcif1敲除CAR-T細(xì)胞的鐵死亡特征并減弱其抗腫瘤效果,表明Pcif1通過(guò)調(diào)控鐵死亡通路增強(qiáng)CD8+T細(xì)胞功能。
6) T 細(xì)胞中PCIF1 的低表達(dá)可增強(qiáng)對(duì) ICI 和 CAR-T 療法的敏感性
研究人員發(fā)現(xiàn),黑色素瘤患者腫瘤浸潤(rùn)CD8+T細(xì)胞中PCIF1低表達(dá)提示對(duì)ICI治療反應(yīng)更佳;B細(xì)胞
惡性腫瘤患者治療前T細(xì)胞PCIF1低表達(dá)者接受抗CD19 CAR-T治療后生存期顯著延長(zhǎng);口腔鱗狀細(xì)胞
癌患者中,抗PD-1治療應(yīng)答者的淋巴細(xì)胞浸潤(rùn)區(qū)PCIF1表達(dá)顯著低于無(wú)應(yīng)答者,且其腫瘤微環(huán)境中
CD8+T細(xì)胞和GzmB陽(yáng)性細(xì)胞顯著增多。PCIF1通過(guò)調(diào)控腫瘤微環(huán)境中浸潤(rùn)性細(xì)胞毒性CD8+T細(xì)胞數(shù)量
影響免疫治療效果。

三、 結(jié)論
該項(xiàng)研究揭示了PCIF1通過(guò)m6Am修飾調(diào)控CD8+T細(xì)胞活化和鐵死亡的分子機(jī)制,并證明了PCIF1敲除能夠
顯著增強(qiáng)抗腫瘤免疫反應(yīng)和免疫療法的效果。這一發(fā)現(xiàn)不僅為理解表觀轉(zhuǎn)錄組在免疫調(diào)控中的作用提供了
新視角,還為開(kāi)發(fā)新型癌癥免疫療法提供了重要的理論依據(jù)和潛在靶點(diǎn)。未來(lái)的研究將進(jìn)一步探索PCIF1
的臨床應(yīng)用價(jià)值,推動(dòng)免疫療法在癌癥治療中的突破。
參考文獻(xiàn)
Xiang, B., Zhang, M., Li, K. et al. The epitranscriptional factor PCIF1 orchestrates CD8 T cell ferroptosis and activation to control antitumor
immunity. Nat Immunol 26, 252–264 (2025).