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研究揭示檢測人體外源DNA的新技術

來源:上海撫生科技發(fā)展有限公司   2014年12月17日 12:46  

    研究人員早就懷疑一些類型的癌癥和自體免疫疾病可能是由于細菌或病毒的遺傳物質(zhì)溜進我們?nèi)梭w的DNA而引起的,但要跟蹤這些入侵DNA是一項艱巨的任務。一項公布于《自然遺傳學》上的新遺傳學技術,可能會幫助研究人員查出這些潛藏在病人基因內(nèi)的“內(nèi)奸”。

    子宮癌的研究為傳染性疾病能夠?qū)е掳┌Y這一觀點提供了的證據(jù)。人體乳頭瘤病毒(human papillomavirus ,HPV)能夠引起生殖器疣,在90%以上的子宮癌腫瘤中都有出現(xiàn)。哈佛大學波士頓醫(yī)學院的病理學家Matthew Meyerson和他的同事利用子宮癌作為檢測實例來檢測病人體內(nèi)的外源基因。

    將收集自人體子宮癌細胞的7073個活化基因序列組成的計算機文庫與人類基因組計劃測序完畢的基因組J數(shù)據(jù)庫以及其它人類和小鼠序列數(shù)據(jù)庫做了比較,所有這些基因都假定來自健康個體。文庫中有22個基因與數(shù)據(jù)庫中的序列不符。研究人員排除了其中的20個基因,剩下的zui后兩個基因序列是來自HPV-18病毒的無效環(huán)狀DNA。HPV-18是早先查明的與子宮癌有關聯(lián)的感染原。

    斯坦福大學的微生物學家David Relman認為這個方法很有前途。但他警告說;“當你偶然碰到1個轉(zhuǎn)錄不符合的HPV和子宮癌實例時,挑戰(zhàn)就來了。”他懷疑我們的DNA也許已積累了相當一部分無害的微生物小DNA片段,因而要從這些雜亂的“無害合居者”背景中發(fā)現(xiàn)病原體的蹤跡是一項艱巨的任務。

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