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上海信裕生物科技有限公司
中級(jí)會(huì)員 | 第11年

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免疫PCR試驗(yàn)方法

時(shí)間:2016/4/1閱讀:1416
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免疫PCR試驗(yàn)方法

(一)材料與方法
1. 生物素標(biāo)記特異性抗體的制備  免疫球蛋白(如IgG、IgM)的Fc片段上有糖基存在,因而可用能與糖基結(jié)合的Biotin-hydrazide作生物素標(biāo)記。
(1) 將純化的抗體(IgM或IgG, 0.1~1.0ml)在標(biāo)記緩沖液(0.1Mol/L NaAc,pH值5.5, 0.1Mol/L NaCl)中4℃透析。
(2)吸取0.5ml至微量離心管中,加過(guò)碘酸鈉溶液至終濃度為10mMol/L,置冰浴上于暗處孵育30min,使抗體分子上的糖基氧化。
(3)將氧化的抗體過(guò)PBS平衡的Sephadex G25 PD-10預(yù)裝柱,使之與過(guò)碘酸鈉分開。收集蛋白峰。
(4)向抗體管中加入Biotin-LC-hydrazide(Pierce)至終濃度5mMol/L,置混搖器上室溫孵育1h。
(5)用含0.02%NaN3的PBS平衡Sephadex G25預(yù)裝柱,將生物素標(biāo)記的抗體分子過(guò)柱與游離的生物素分開。收集蛋白峰,保存-20℃。    
2. 生物素標(biāo)記DNA片段的制備  作為將與抗體偶聯(lián)的報(bào)告DNA片段,應(yīng)確保在待測(cè)抗原來(lái)源的機(jī)體DNA中無(wú)同源序列,如可選用大腸桿菌的序列作為報(bào)告DNA去檢測(cè)人源的標(biāo)本。DNA片段大小為300~500bp,生物素標(biāo)記可采用PCR方法,根據(jù)報(bào)告DNA的核苷酸序列合成一對(duì)引物,其中一個(gè)引物的5’端堿基上帶有生物素標(biāo)記。
在0.5mlPCR管中按表將下列試劑混合。
表PCR系統(tǒng)組成

試   劑  

添加量

終濃度

10×PCR緩沖液

10.0ul

1×

2.5mM  4dNTP混合物

8.0ul

0.2mM

50uM生物素標(biāo)記的上游引物

1.0ul

0.5uM

50uM生物素標(biāo)記的下游引物

1.0ul

0.5uM

15mM模板DNA

1.0ul

1.0ug

Taq  DNA聚合酶

1.0ul

5U

加水至 100uL 
混勻后上面覆蓋液體石蠟。
95℃加熱5min,然后在PCR儀上按下列程序擴(kuò)增:94℃ 1min;55℃ 1min;72℃ 1min; 40個(gè)循環(huán)。zui后72℃延伸10min。
加等量酚-氯仿抽提,然后加10ul 3Mol/L Kac,250uL無(wú)水乙醇,置-70℃30min。
離心沉淀DNA片段,用70%乙醇洗一次。
將沉淀DNA干燥后溶于TE緩沖液中,保存在-20℃。
3. 制備抗體-親和素-DNA復(fù)合物  將生物素標(biāo)記的抗體與親和素按等分子濃度混合于含有1mg/mlBSA的PBS中,室溫孵育30min,再加入兩倍分子濃度的生物素標(biāo)記的DNA片段,繼續(xù)孵育30min,zui后加入10倍分子濃度的生物素,將親和素分子上的結(jié)合部位飽和。zui后過(guò)凝膠過(guò)濾柱將復(fù)合物與未結(jié)合的單體分開,加入BSA達(dá)1mg/ml,分裝后凍存于-20℃。
4.  免疫PCR
(1) 按常規(guī)ELISA方法,用飽和緩沖液稀釋抗原,加到96孔塑料板或0.5mlPCR管中,4℃。
(2) 用PBS洗三次,然后每孔加200ul封閉液(PBS含10mg/ml BSA,1mg/ml魚精DNA),室溫孵育30min。
(3) 用TETBS(其配方:20mMol/L EDTA,0.02%NaN3)洗三次。
(4) 將抗體-親和素-DNA復(fù)合物稀釋于含有1mg/mlBSA和0.1mg/ml魚精DNA的TETBS中,每孔加50ul,室溫孵育1h。
(5) 用TETBS洗5次,然后將塑料板或管倒置在吸水紙上拍打以控干水分。
(6) 每管中加50ulPCR反應(yīng)液,含有表成分:

試   劑  

添加量

終濃度

10×PCR緩沖液

5.0μl

1×

2.5mM  4dNTP混合物

4.0μl

0.2mM

50uM生物素標(biāo)記的上游引物

0.5μl

0.5uM

50uM生物素標(biāo)記的下游引物

0.5μl

0.5uM

15mM 模板DNA

0.5μl

1.5ug

Taq  DNA聚合酶

0.5μl

2.5U

加水至50μL 
混勻后上面覆蓋液體石蠟。
95℃加熱5min,然后在PCR儀上按下列程序擴(kuò)增35個(gè)循環(huán):94℃ 1min;55℃ 1min; 72℃ 1min。zui后72℃延伸10min。
每管取5ul作瓊脂糖或聚丙烯酰胺凝膠電泳,溴化乙錠染色后觀察結(jié)果,如在PCR時(shí)加入了放射性核素標(biāo)記,則可用X光片顯影。
亦可在凝膠電泳后做Southern-blot,用特異性探針雜交,進(jìn)一步提高其特異性和敏感性。 

(二)注意事項(xiàng)
   本實(shí)驗(yàn)的關(guān)鍵步驟是獲得適當(dāng)?shù)目贵w-DNA復(fù)合物。用鏈親和素將生物素標(biāo)記的抗體與生物素標(biāo)記的DNA偶聯(lián)的方法,因每個(gè)鏈親和素分子可與四個(gè)生物素分子結(jié)合,因此要優(yōu)化反應(yīng)條件,以使得每個(gè)鏈親和素分子既能結(jié)合上抗體分子,又能結(jié)合上DNA片段。
  此外,還可用化學(xué)方法將DNA片段與抗體分子共價(jià)偶聯(lián),即將抗體分子和5’端氨基酸修飾的DNA片段分別用不同的雙功能偶聯(lián)劑激活,然后通過(guò)自發(fā)的反應(yīng)偶聯(lián)到一起,比如,用N-Succinimidyl-S-acetyl thioacetate(SATA)活化氨基修飾的DNA片段,用Sulfo-Succinimidyl4-(maleimidomethyl) Cyclohexane-1-Carboxylate(Sulfo-SMCC)修飾抗體分子,然后將二者在一小管中混合,通過(guò)加入鹽酸胲(Hydroxylamine hydrochloride)使二者偶聯(lián)在一起。
免疫PCR具有高敏感性。因此,抗體和標(biāo)記DNA的任何非特異性結(jié)合均可導(dǎo)致嚴(yán)重的本底問(wèn)題。因而在加入抗體和標(biāo)記DNA后必須盡可能*地清洗。即使有些特異性結(jié)合的抗體或標(biāo)記DNA被洗掉了,亦可在zui后通過(guò)增加PCR的循環(huán)次數(shù)得到彌補(bǔ)。此外,應(yīng)用有效的封閉劑對(duì)防止非特異性結(jié)合也是非常重要的??捎妹撝谭酆团Q灏椎鞍鬃龅鞍追忾]劑,用魚精DNA做核酸封閉劑。防止本底信號(hào)的另一個(gè)重要因素是控制污染,這也是所有敏感的檢測(cè)系統(tǒng)存在的問(wèn)題。即使每一步試驗(yàn)都做得非常認(rèn)真,重復(fù)使用同樣的引物和標(biāo)記DNA均會(huì)產(chǎn)生假陽(yáng)性信號(hào)。  
  免疫PCR的一個(gè)優(yōu)點(diǎn)是標(biāo)記DNA序列*是人為選定。因此標(biāo)記DNA及其引物可經(jīng)常變換,以避免由于污染造成的假陽(yáng)性信號(hào)。
免疫PCR可以檢測(cè)到常規(guī)免疫學(xué)方法無(wú)法檢測(cè)的樣品。因此,應(yīng)用免疫PCR可在微觀水平(單細(xì)胞)檢測(cè)抗原,定量PCR產(chǎn)物可以估計(jì)某一標(biāo)本中的抗原數(shù)量,在臨床診斷中可在疾病早期抗原量很低時(shí)檢測(cè)到微量的抗原。

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