RubiconGenomics ThruPLEX Plasma測(cè)序試劑盒

ThruPLEX® Plasma-seq Kit

Illumina® NGS library preparation for cell-free DNA

用于無細(xì)胞DNA的Illumina NGS制備

RubiconGenomics ThruPLEX Plasma測(cè)序試劑盒

1. 為無細(xì)胞DNA設(shè)計(jì)---新配制的修復(fù)和連接試劑。

2. 高性能的NGS文庫(kù)---文庫(kù)多樣性，樣本輸入量少，有更寬的和可重復(fù)的GC覆蓋范圍。

3. 適應(yīng)的樣本輸入量--<1-30mg的無細(xì)胞的DNA.

快速便捷的操作---在單個(gè)管或孔中，三步完成，2個(gè)小時(shí)，無需純化或者樣本轉(zhuǎn)移步驟。

美國(guó)Rubicon Genomics R30050   PicoPLEX:trademark: WGA kit    50 rxn  現(xiàn)貨供應(yīng)
美國(guó)Rubicon Genomics R400523 ThruPLEX DNA-seq 6S Kit 12 rxn  現(xiàn)貨供應(yīng)
美國(guó)Rubicon Genomics R400490 ThruPLEX Plasma-seq 12S Kit 12 rxn  現(xiàn)貨供應(yīng)

紅榮微再（上海）生物工程技術(shù)有限公司將一如既往的為您提供高品質(zhì)的：IPS/ES干細(xì)胞、試管嬰兒、再生醫(yī)學(xué)、細(xì)胞治療、組織器官再生、生物樣本處理、細(xì)胞培養(yǎng)等產(chǎn)品。

多樣性zui高，zui少的未映射的無細(xì)胞DNA讀取

優(yōu)秀的靶向序列捕獲Peformance

重現(xiàn)性好，無偏GC覆蓋

卡羅林斯卡研究所CRUK評(píng)估

ThruPLEX等離子-SEQ套件單管工作流程

多樣性zui高，zui少的未映射的無細(xì)胞DNA讀取

具有很高的多樣性和低數(shù)量的重復(fù)和未映射ThruPLEX等離子-SEQ套件產(chǎn)生質(zhì)量庫(kù)讀取。無細(xì)胞DNA從3血漿樣品中提取，并在如由Qubit®測(cè)定中所示的量制備的庫(kù)。 mononucleosomal的DNA各樣品中作為由Bioanalyzer®測(cè)量的量對(duì)應(yīng)于0.09納克，0.62納克，和15.44毫微克。匯集庫(kù)進(jìn)行測(cè)序上的IlluminaNextSeq®500與17M 25M到一個(gè)配對(duì)末端運(yùn)行每個(gè)庫(kù)讀取，復(fù)制計(jì)算率后的數(shù)據(jù)降采樣，以17米每庫(kù)讀取。

優(yōu)秀的靶向序列捕獲Peformance

ThruPLEX等離子體SEQ套件文庫(kù)以高效率捕獲并與激酶組用于突變檢測(cè)的深覆蓋所產(chǎn)生的數(shù)據(jù)。在5毫微克，6.5納克，一式三份10毫微克的操作量從3血漿樣品制備的庫(kù)，和有針對(duì)性的測(cè)序使用與ClearSeq人類DNA激酶組小組SureSelectXT2豐富的樣品進(jìn)行了上Illumina的MiSeq。平均而言，5M分別讀取每個(gè)庫(kù)生成的。選擇的基地被成功抓獲那名中或毒餌250 bp的內(nèi)基地

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美國(guó)Rubicon Genomics R400523 ThruPLEX DNA-seq 6S Kit 12 rxn  現(xiàn)貨供應(yīng)
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重現(xiàn)性好，無偏GC覆蓋

ThruPLEX等離子-SEQ套件在整個(gè)人類基因組提供了zui可重復(fù)的和公正的GC覆蓋。 ThruPLEX庫(kù)顯示zui小變異橫跨9個(gè)人的血漿樣本進(jìn)行測(cè)試。文庫(kù)從1毫升血漿樣品的分離和測(cè)序上的Illumina NextSeq 500四個(gè)單獨(dú)的血漿樣品無細(xì)胞的DNA制備的用于構(gòu)建NEBNext超庫(kù)。

卡羅林斯卡研究所CRUK評(píng)估

Illumina公司NGS庫(kù)用5納克使用ThruPLEX等離子體SEQ套件收集的血漿樣品中分離的無細(xì)胞的DNA的制備。低通WGS是在HiSeq進(jìn)行大約12.5M每個(gè)庫(kù)的讀取。 （Karolinska研究所，瑞典的數(shù)據(jù)提供）。

ThruPLEX等離子-SEQ套件單管工作流程

ThruPLEX等離子-SEQ套件單管工作流程

1至30毫微克無細(xì)胞DNA的開始，ThruPLEX等離子-SEQ套件創(chuàng)建了3個(gè)簡(jiǎn)單的步驟索引庫(kù)：末端修復(fù)，接頭連接，以及高保真庫(kù)放大。不需要凈化或樣品轉(zhuǎn)移步驟。流線型的工作流程在2個(gè)小時(shí)的單管或表現(xiàn)良好，防止樣品的損失，提高陽(yáng)性樣品鑒定。

ThruPLEX等離子-SEQ套件技術(shù)

ThruPLEX等離子-SEQ套件技術(shù)

ThruPLEX等離子體SEQ套件技術(shù)是為無細(xì)胞的DNA進(jìn)行了優(yōu)化的3步反應(yīng)。無細(xì)胞的DNA（1ng至30毫微克）首先在一高效率的處理修復(fù)。背景是使用無單鏈尾雙鏈適配器減小。平端連接具有高效率的發(fā)生。阻止5'端減少適配器適配器連接。背景由結(jié)扎后破壞未使用的適配器進(jìn)一步降低。高保真擴(kuò)增完成反應(yīng)，生成索引Illumina的圖書館。

Ordering Information

CAT. NO. R400490 ThruPLEX Plasma-seq 12S  Kit (12 reactions, 12 single indexes)

CAT. NO. R400491 ThruPLEX Plasma-seq 48S Kit (48 reactions, 48 single indexes)

CAT. NO. R400492 ThruPLEX Plasma-seq 96D Kit (96 reactions, 96 dual indexes)

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美國(guó)Rubicon Genomics R400523 ThruPLEX DNA-seq 6S Kit 12 rxn  現(xiàn)貨供應(yīng)
美國(guó)Rubicon Genomics R400490 ThruPLEX Plasma-seq 12S Kit 12 rxn  現(xiàn)貨供應(yīng)

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設(shè)計(jì)用于無細(xì)胞的DNA：新制定維修和連接試劑具有優(yōu)化的協(xié)議

高性能NGS庫(kù)：具有廣泛和可重復(fù)的GC覆蓋高度多樣性

可變采樣輸入：<1毫微克至30毫微克無細(xì)胞的DNA

快速簡(jiǎn)單的工作流程：在單管3步，或同時(shí)在2個(gè)小時(shí)，沒有凈化或樣品轉(zhuǎn)移步驟

研究應(yīng)用：從庫(kù)樣本，其中結(jié)果需要高靈敏度，包括液體活檢，葉綠體DNA，并有針對(duì)性測(cè)序

自動(dòng)化友好：Beckman®FXP工作站

在恒溫冷凍保證了9個(gè)月，在-20℃。

儲(chǔ)存于-20℃。

常見問題解答

1.什么類型的樣品和投入可以用等離子ThruPLEX-SEQ使用？

ThruPLEX等離子體SEQ套件被設(shè)計(jì)為從血漿中分離的無細(xì)胞的DNA產(chǎn)生的Illumina NGS DNA文庫(kù)。所述ThruPLEX等離子體SEQ化學(xué)被改寫，以產(chǎn)生多樣庫(kù)具有廣泛的GC覆蓋，從無細(xì)胞的DNA的1至30毫微克*提供重現(xiàn)的測(cè)序結(jié)果。

應(yīng)用程序的輸入樣本類型推薦的輸入量

從等離子和液體活檢DNA測(cè)序;葉綠體DNA分析，從血漿中1納克孤立的目標(biāo)序列無細(xì)胞DNA - 30納克*

*庫(kù)已經(jīng)從輸入產(chǎn)生量低于1納克和超過30納克。

以獲取進(jìn)一步的信息。

2.什么是ThruPLEX的DNA序列套件和新ThruPLEX等離子體序列包之間的主要技術(shù)差異？

ThruPLEX等離子體SEQ套件已經(jīng)用于從血漿中分離無細(xì)胞的DNA進(jìn)行了優(yōu)化。

剪切或無細(xì)胞的DNA片段化是沒有必要與ThruPLEX等離子體以次套件。

的協(xié)議是不同的（見下文）。

3.什么是ThruPLEX等離子體序列和ThruPLEX的DNA序列之間的協(xié)議差異？

模板制備步驟：卷和保溫溫度

庫(kù)合成步驟：卷和孵化溫度

庫(kù)擴(kuò)增步驟：卷和擴(kuò)增循環(huán)數(shù)

4.可從血漿ThruPLEX-SEQ試劑與ThruPLEX的DNA序列試劑互換？

不，ThruPLEX等離子-SEQ套件內(nèi)容不與其他人Rubicon基因組學(xué)產(chǎn)品互換。

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5.什么索引類型或條形碼，你有可用？

ThruPLEX等離子體SEQ 12S和48S套件中提供的管分配Illumina的兼容8NT單個(gè)索引或96孔板中。這些指數(shù)序列是由威康信托基金會(huì)桑格研究所在英國(guó)劍橋的發(fā)展。關(guān)于桑格指數(shù)序列的信息可以在自然的方法可以找到7，111-118（2010）。

ThruPLEX等離子體SEQ 96D套件設(shè)置有Illumina公司TruSeq HT i5和在96孔板分配i7雙索引。在i5指標(biāo)有Illumina的D501 D508到序列，和I7指標(biāo)有D701到D712序列。

有關(guān)索引的詳細(xì)信息，請(qǐng)參閱附錄1的等離子ThruPLEX-SEQ套件說明手冊(cè)中的

6.你對(duì)隔離血漿中游離DNA有什么建議？

ThruPLEX等離子序列與游離DNA進(jìn)行了優(yōu)化使用循環(huán)QIAamp®核酸試劑盒（Qiagen，目錄55114號(hào)）編制。

Tris和EDTA的在包含輸入DNA中的緩沖器中的濃度必須不超過10毫和0.1mM分別。避免含磷酸鹽緩沖液。

7.什么樣的收集管我應(yīng)該用從受試者抽血？

在盧比肯基因組學(xué)科研人員使用與K2 EDTA真空管靜脈管采集的血液（Becton Dickinson公司，貨號(hào)36643）。

9.從尿或其他生物液體隔離式CAN細(xì)胞游離DNA與ThruPLEX等離子-SEQ套件使用？

ThruPLEX等離子體以次用從人血漿中分離無細(xì)胞的DNA進(jìn)行了優(yōu)化;然而，該試劑盒可以與來自其他生物流體降解的DNA的工作。從其它樣品來源無細(xì)胞的DNA必須首先用DNA提取/純化試劑盒提取。由于這些來源的游離DNA正常降解/零散，不成附加是不必要的。每個(gè)反應(yīng)輸入無細(xì)胞DNA的量必須不超過10微升。

10.與任何靶向序列捕獲系統(tǒng)兼容ThruPLEX等離子-SEQ套件？

是的，ThruPLEX等離子-SEQ套件與各大外顯子組和靶向富集產(chǎn)品，包括安捷倫SureSelect®，羅氏NimbleGen®SeqCap®EZ和自定義面板兼容。 

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