布魯克 GeoMx DSP 數(shù)字空間多組學(xué)分析系統(tǒng)

布魯克 GeoMx DSP 數(shù)字空間多組學(xué)分析系統(tǒng)以特異性解析組織異質(zhì)性在組織空間背景下精準(zhǔn)解析不同組織功能區(qū)域中不同細(xì)胞群理解組織異質(zhì)性對于研究發(fā)育生物學(xué)、疾病發(fā)生發(fā)展機(jī)制以及對治療的響應(yīng)極為重要。布魯克 GeoMx DSP 數(shù)字空間多組學(xué)分析系統(tǒng)彌補(bǔ)了組織成像和分子表達(dá)檢測（如單細(xì)胞測序等）之間的鴻溝，支持您從空間多組學(xué)角度解鎖新的生物學(xué)見解。

技術(shù)原理

布魯克 GeoMx DSP 數(shù)字空間多組學(xué)分析系統(tǒng)采用傳利技術(shù)在抗體或者RNA上偶聯(lián)DNA Oligo。每個(gè)DNA Oligo對應(yīng)一個(gè)靶標(biāo)，最高可達(dá)96個(gè)蛋白靶標(biāo)或>1000個(gè)RNA靶標(biāo)（二代測序輸出）。當(dāng)抗體或RNA與組織上的靶標(biāo)結(jié)合后，GeoMx Digital Spatial Profiler利用激光切斷DNA oligo與抗體或RNA之間的連接物，從而釋放出DNA Oligo以進(jìn)行下一步定量。

主要特點(diǎn)：

1. 多靶標(biāo):可在-張FFPE組織 上定份析高達(dá)10000多種RNA或最高96種蛋白質(zhì)

2. 原位:采用1-4種熒光抗體染色獲取組織的形態(tài)學(xué)信息

3. 多維度:既可定分析蛋白質(zhì),也可定量分析RNA

4. 高精度:可達(dá)單細(xì)胞水平

5. 精準(zhǔn)定量:采用數(shù)字化單分子計(jì)數(shù)技術(shù)，最高達(dá)106水平

6. 樣本無損:整個(gè)操作過程對樣本無損傷，利于保存珍貴樣本

7. 高通量: -天可分析多達(dá)12份組織樣本

彈性專注于您感興趣的目標(biāo)區(qū)域

科研者可以靈活的圈選策略，高效地理解組織結(jié)構(gòu)。由于不同組織的特點(diǎn)，研究人員往往在單一載玻片上可能對某一區(qū)域特別感興趣。在保留組織樣本完整性的情況下，GeoMx Digital Spatial Profiler可以允許使用者在單張載玻片上根據(jù)組織輪廓選取感興趣區(qū)域（Region Of Interest, ROI），甚至選取稀有細(xì)胞群體進(jìn)行分析。

工作原理

利用標(biāo)準(zhǔn)IHC方法，將成像試劑（熒光標(biāo)記的抗體或探針）、定量試劑（DNA條形碼標(biāo)記的抗體或探針）和組織切片進(jìn)行雜交孵育。在DSP儀器中完成組織成像、感興趣區(qū)域（ROI）圈選，接下來與感興趣區(qū)域形狀匹配的紫外光束照射該區(qū)域，使得該區(qū)域內(nèi)的DSP條形碼得以釋放并被自動(dòng)收集，進(jìn)而利用高通量測序（NGS）進(jìn)行表達(dá)定量，最終得到的是組織中不同空間區(qū)域的表達(dá)譜信息。

1. 樣本制備：任何樣本（FFPE或新鮮冷凍樣本）；任何形態(tài)學(xué)標(biāo)記物；檢測RNA和/或蛋白質(zhì)。

2. 樣本檢測：利用GeoMx DSP對RNA和蛋白質(zhì)進(jìn)行自動(dòng)化組織成像和分子檢測。

3. 表達(dá)定量：利用NGS進(jìn)行表達(dá)定量。

4. 數(shù)據(jù)分析：預(yù)置的數(shù)據(jù)處理流程，交互式數(shù)據(jù)分析界面。