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Plantarray高通量植物生理表型應(yīng)用——豇豆研究

閱讀:1714      發(fā)布時(shí)間:2021-8-31
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Natural variation and gene regulatory basis for the responses of asparagus beans to soil drought

豇豆對(duì)土壤干旱響應(yīng)的自然變異及基因調(diào)控基礎(chǔ)

蘆筍豆(Vigna unguiculata ssp. sesquipedalis)是豇豆的亞洲亞種,豇豆是一種原產(chǎn)于非洲的抗旱豆類作物。為了探索蘆筍豆干旱反應(yīng)的遺傳變異,我們對(duì)中國(guó)蘆筍豆的抗旱性狀進(jìn)行了多年表型分析。表型分布表明ssp。盡管存在已知的國(guó)內(nèi)瓶頸,但sesquipedalis亞基因庫在干旱反應(yīng)中仍保持較高的自然變異。通過全基因組關(guān)聯(lián)研究 (GWAS),發(fā)現(xiàn)39個(gè)SNP位點(diǎn)與抗旱性相關(guān)。全株用水關(guān)系通過蒸滲法在四種基因型之間進(jìn)行比較。觀察到與避免脫水有關(guān)的蒸騰模式和臨界土壤水分閾值的明顯基因型差異,表明每個(gè)基因型對(duì)其自身氣候都有微妙的適應(yīng)機(jī)制。微陣列基因表達(dá)分析表明,已知的抗旱通路如ABA和磷酸鹽脂質(zhì)信號(hào)通路在不同基因型之間是保守的,而某些水通道蛋白基因和激素基因的差異調(diào)控可能對(duì)基因型差異很重要。本文結(jié)果表明,對(duì)土壤水分含量的不同敏感性是配置基因型對(duì)水分虧缺的特異性反應(yīng)的一個(gè)重要機(jī)制。所鑒定的SNP標(biāo)記為標(biāo)記輔助育種提供了有用的資源。

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圖1.四個(gè)品系的全株生長(zhǎng)速率和水分利用效率(WUE)

植物生長(zhǎng)速率和水分利用效率(WUE) 表現(xiàn)出品系之間的主要差異(圖 1A、B)。B128在良好澆水條件下生長(zhǎng)速度最快,WUE最高;然而,干旱處理導(dǎo)致該品系的生長(zhǎng)潛力損失最大(圖1C)。B47顯示出緩慢的生長(zhǎng)速度和適度的WUE,響應(yīng)干旱處理,生長(zhǎng)潛力損失較小。B118和B253表現(xiàn)出這些參數(shù)的更大穩(wěn)定性。

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圖2.整株植物對(duì)環(huán)境變化的響應(yīng),標(biāo)準(zhǔn)化為植物重量和蒸汽壓差(VPD)。

全株蒸騰作用(ET)和ET歸一化為植株大小(ET/重量);ETW)和土壤含水量(SWC)的消耗表明,植物蒸騰作用取決于大?。▓D2)。B128在WW條件下表現(xiàn)出最高的ET,單位質(zhì)量的水分損失(ETW)zui低,而B118和B47則表現(xiàn)出相反的模式。

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圖3. 午間蒸騰與土壤含水量

對(duì)于每個(gè)基因型,TW與SWC的曲線圖顯示了一個(gè)明顯的、恒定的午間蒸騰水平(Emax),直到土壤含水量達(dá)到一個(gè)臨界值(θcr),此時(shí)蒸騰速率出現(xiàn)下降(圖3A,B)。這種ETW(SWC)模式表明,只有當(dāng)SWC<θcr時(shí),土壤水分有效性才成為一個(gè)限制因素,并且在土壤水分逐漸枯竭的情況下,每一次入滲都具有保持最大蒸騰速率的*能力。B47和B128線可能對(duì)土壤水分虧缺最敏感和最不敏感,因?yàn)樗鼈儽憩F(xiàn)出最高和低的θcr值(圖3C,D)。B47 在達(dá)到 θcr 后也顯示出最高的 ET 下降率(圖 3D)表明該線達(dá)到了*的脫水避免響應(yīng)。

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