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QuantSeq 3'mRNA-Seq文庫(kù)制備試劑盒，用于Illumina

在QuantSeq文庫(kù)制備過(guò)程中節(jié)省成本并簡(jiǎn)化了球蛋白mRNA的消耗

全基因組基因表達(dá)分析

具有成本效益的微陣列和標(biāo)準(zhǔn)RNA-Seq替代品

總RNA輸入低100 pg

適用于低質(zhì)量和FFPE樣品

在Bluebee的免費(fèi)數(shù)據(jù)分析管道®基因組學(xué)分析平臺(tái)

單讀數(shù)測(cè)序，多達(dá)9,216個(gè)樣品/泳道

提供雙重索引和唯yi分子標(biāo)識(shí)符（UMI）

QuantSeq 3'mRNA-Seq文庫(kù)制備試劑盒，用于Illumina

QuantSeq FWD試劑盒是一種文庫(kù)制備方案，旨在生成與聚腺苷酸化RNA的3'末端接近的Illumina兼容文庫(kù)。

QuantSeq FWD在第二條鏈合成引物中包含Illumina Read 1接頭序列，因此朝poly（A）尾部生成NGS讀數(shù)，直接反映了mRNA序列（請(qǐng)參見(jiàn)工作流程）。此版本是基因表達(dá)分析的推薦標(biāo)準(zhǔn)。Lexogen進(jìn)一步提供了具有可選雙索引（i5和i7索引）的高通量版本，允許在一個(gè)通道中多路復(fù)用多達(dá)9,216個(gè)樣本。

 

低投入低質(zhì)量樣品分析

總RNA的所需輸入量低100pg。QuantSeq適合從低質(zhì)量的RNA（包括FFPE樣品）可重復(fù)生成文庫(kù)。相同樣品的兩種不同RNA品質(zhì)（FFPE和新鮮冷凍冷凍塊）的比較

QuantSeq文庫(kù)制備過(guò)程中耗盡球蛋白mRNA

新！ 用于QuantSeq的Globin塊模塊可從全血中僅50 ng的總RNA中生成缺失珠蛋白的，易于測(cè)序的3'mRNA-Seq文庫(kù)。無(wú)需其他協(xié)議步驟。該模塊中的RS-Globin Block解決方案僅取代了QuantSeq試劑盒中的標(biāo)準(zhǔn)RNA去除解決方案。使用Globin Block進(jìn)行QuantSeq，可將映射到球蛋白mRNA的讀圖從50％到80％降低到5％（圖4），并且基因檢測(cè)顯著增加（圖5）。

*對(duì)于附圖：輸入RNA（50 ng或250 ng）的提取方法如下：1個(gè) SPLIT RNA提取試劑盒，2個(gè)其他試劑盒（包括紅細(xì)胞裂解液）或3個(gè)其他試劑盒沒(méi)有紅細(xì)胞裂解液

 

快速周轉(zhuǎn)

QuantSeq的簡(jiǎn)單工作流程允許僅在4.5小時(shí)內(nèi)（包括不到2小時(shí)的動(dòng)手時(shí)間）生成即可測(cè)序的NGS庫(kù)。

基因表達(dá)定量的直接計(jì)數(shù)

每個(gè)轉(zhuǎn)錄本僅產(chǎn)生一個(gè)片段；因此，不需要長(zhǎng)度標(biāo)準(zhǔn)化。這樣可以更準(zhǔn)確地確定基因表達(dá)值，并使QuantSeq成為基因表達(dá)研究中微陣列和常規(guī)RNA-Seq的佳替代品。

 

簡(jiǎn)單的生物信息學(xué)分析

通過(guò)跳過(guò)結(jié)檢測(cè)，可以簡(jiǎn)化讀取映射。在轉(zhuǎn)錄物的3'末端幾乎沒(méi)有連接處產(chǎn)生讀數(shù)。因此可以加速數(shù)據(jù)處理。

 

QuantSeq數(shù)據(jù)分析管道還集成在Bluebee基因組學(xué)分析平臺(tái)上，即使沒(méi)有生物信息學(xué)背景，任何用戶也可以使用。訪問(wèn)代碼包含在QuantSeq套件中?？梢栽诰W(wǎng)上商店購(gòu)買(mǎi)其他代碼。*：直到2019年12月31日，免費(fèi)提供高達(dá)1.5 GB輸入的附加代碼。

 

高鏈特異性

QuantSeq保持> 99.9％的異常鏈特異性，并允許將讀數(shù)映射到基因組上的相應(yīng)鏈，從而能夠發(fā)現(xiàn)和定量反義轉(zhuǎn)錄本和重疊基因。

 

節(jié)省成本的復(fù)用

QuantSeq庫(kù)旨在用于高度復(fù)用。單個(gè)索引套件（目錄號(hào)015）中多包括96個(gè)i7索引。還可以使用Lexogen i5 6 nt雙索引附加組件（目錄號(hào)047或015.384）引入其他i5索引。一起使用，Lexogen的96 i7和96 i5 6 nt索引可為測(cè)序提供多達(dá)9,216種不同的索引組合。

 

新！QuantSeq 3'mRNA-Seq文庫(kù)制備物現(xiàn)在也可提供多達(dá)384種預(yù)混合的*雙索引（目錄號(hào)113、114、115）。Lexogen的新型12 nt UDI具有出色的糾錯(cuò)功能，可大程度地輸出測(cè)序數(shù)據(jù)，也可作為獨(dú)立的附加套件（目錄號(hào)107 – 111）與其他文庫(kù)制備工具一起使用。

 

這種高水平的多路復(fù)用可以節(jié)省成本，因?yàn)镼uantSeq中的長(zhǎng)度限制可以節(jié)省測(cè)序空間。QuantSeq還設(shè)計(jì)用于產(chǎn)生短測(cè)序讀段（SR50，SR100）的插入片段大小。

 

北京華新康信生物科技有限公司專注于生命科學(xué)領(lǐng)域，由豐富從業(yè)經(jīng)驗(yàn)的技術(shù)團(tuán)隊(duì)和管理團(tuán)隊(duì)組建而成，主營(yíng)生物化學(xué)試劑，儀器，實(shí)驗(yàn)耗材等。

1廣泛的產(chǎn)品輻射領(lǐng)域，試劑，耗材，儀器等。

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