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聚合編號
膠束的另一個(gè)物理性質(zhì)是聚集數(shù);
存在于膠束內(nèi)的洗滌劑單體的數(shù)量(1,25,30)
用于生化應(yīng)用的大多數(shù)洗滌劑都具有聚集性
50到100之間的數(shù)字(8)有些膽汁是例外
酸衍生物,如CHAPS、CHAPSO和Big CHAP,具有
約10種洗滌劑的總數(shù)
聚集數(shù)往往形成更多的球形膠束,而
聚集數(shù)較大的洗滌劑往往形成橢圓體
膠束通常,聚集數(shù)隨著長度的增加而增加
碳?xì)浠衔镦湹脑黾泳奂瘮?shù)往往
隨著親水基團(tuán)的大小增加而減小
向洗滌劑中添加碳?xì)浠衔锖蜆O性化合物
溶液(1)提高離子威懾物溶液的溫度-
試劑也會(huì)導(dǎo)致聚集數(shù)量的增加Aggrega-
離子數(shù)可以通過多種方法確定,包括
光散射(43)、小角度中子散射(44)和熒光
染料結(jié)合(45)
了解洗滌劑CMC和聚集數(shù),一個(gè)
可以確定幾個(gè)重要的參數(shù),包括concen-
溶液中膠束的過濾和聚集分子
膠束的重量在理想的無蛋白質(zhì)條件下,濃度-
膠束的離子可以計(jì)算如下:
[膠束]=[總洗滌劑]-[CMC]/AN(iii)
其中CMC是臨界膠束濃度,并且
AN是膠束聚集數(shù)
無蛋白質(zhì)膠束的聚集分子量(AMW)可以
計(jì)算如下:
AMW=AN X單體分子量(iv)
其中AN是膠束聚集數(shù)
典型的膠束聚集體分子量范圍為20-100kD
6 8 0 0 .2 5 2 .1 2 8 0
應(yīng)該注意的是,聚集體分子的測定
蛋白質(zhì)-洗滌劑復(fù)合物的重量更為復(fù)雜
本出版物后面的內(nèi)容參見“聚合分子量
蛋白質(zhì)/洗滌劑復(fù)合物",第7頁
清洗劑去除
CMC在確定應(yīng)采用哪種方法時(shí)也很重要
用于去除多余或不需要的洗滌劑洗滌劑可能會(huì)-
fere與某些應(yīng)用程序配合使用,并且在重新配置時(shí)必須刪除-
組成脂質(zhì)體(46,47)具有高CMC的洗滌劑很容易
通過透析去除;洗滌劑溶液可以稀釋到低于
CMC,使膠束分解成單體,可以很容易地
隨著時(shí)間的推移通過透析管(7)通常,洗滌劑溶液-
在大量過量(即200倍)的洗滌劑的作用下對離子進(jìn)行透析-
幾天的免費(fèi)緩沖液,幾次更換無洗滌劑緩沖液
在這段時(shí)間內(nèi),CMC低的洗滌劑通常通過
對疏水性珠粒的吸附(48)洗滌劑結(jié)合珠??梢?/p>
然后通過過濾或離心去除洗滌劑可以
也可以通過各種類型的柱色譜凝膠去除
過濾可用于將洗滌劑膠束與蛋白質(zhì)分離-
基于尺寸差異的洗滌劑復(fù)合物和游離蛋白
組酸也可以去除或更換洗滌劑-
標(biāo)記的蛋白質(zhì)與鎳樹脂結(jié)合(7)
洗滌劑和生物膜
生物膜是磷脂分子的雙層;這個(gè)
雙層的總體結(jié)構(gòu)如下圖所示(圖5)
脂質(zhì)雙層的結(jié)構(gòu)
圖5
脂質(zhì)?;湹奈膊砍虮舜耍óa(chǎn)生
非極性疏水核),而極性磷酸酯頭
基團(tuán)與周圍的主體水相接觸。因此,雙層
分為兩個(gè)不同的區(qū)域:疏水核心和
親水性頭部區(qū)域每個(gè)“隔間"都有特的
不同地影響駐留在
雙層雙層的疏水核心,由磷組成-
磷脂?;?,約30?厚,并提供
疏水區(qū)溶劑化的低介電環(huán)境
整體膜蛋白的(49,50)這個(gè)區(qū)域通常相當(dāng)
生物相關(guān)溫度下的流體;雙層流動(dòng)性通常
蛋白質(zhì)功能和蛋白質(zhì)橫向擴(kuò)散所必需的
親水性頭群區(qū)域通常是極性的并且?guī)щ?/p>
該區(qū)域通過哥倫布力與膜蛋白相互作用
其穩(wěn)定額外的膜環(huán)并與極性
α-螺旋末端(49,50)
生物膜相對于脂質(zhì)和
蛋白質(zhì)例如,脂質(zhì)的組成不同
紅細(xì)胞膜的小葉有助于
這些細(xì)胞,允許它們通過脈管系統(tǒng)(外部
小葉:76%磷脂酰堿(PC)、82%鞘磷脂(SP),
20%磷脂酰乙醇胺(PE)、0%磷脂酰絲酸(PS);
內(nèi)葉:24%PC,18%SP,80%PE,100%PS百分比為o
總脂質(zhì)含量)(51)此外,蛋白質(zhì)可能優(yōu)先
位于膜的內(nèi)部或外部小葉上,以及
在優(yōu)選的方向上,當(dāng)
決定如何好地提取膜蛋白以及提取什么
條件(即洗滌劑和/或脂質(zhì))適合重構(gòu)
用于生物化學(xué)研究
從膜中提取蛋白質(zhì)
為了研究膜蛋白,必須首先從
膜,并保持在可溶性、天然、功能性的形式
在提取過程中,有人提出洗滌劑
單體首先分配到雙層中
洗滌劑與洗滌劑的協(xié)同作用破壞了雙層的穩(wěn)定性
產(chǎn)生混合的脂質(zhì)洗滌劑片段(圖6A)終,
進(jìn)一步添加洗滌劑會(huì)導(dǎo)致雙層溶解和蛋白質(zhì)
增溶作用(圖6B)(8,52)
膜的溶解性
圖6A
圖6B
膜蛋白可以有幾個(gè)“程度"
從膜中提取用于進(jìn)一步研究蛋白質(zhì)可以
以這樣的方式純化,使得一些天然脂質(zhì)保持與
蛋白質(zhì)這可以通過使用不
有效的脂質(zhì)增溶劑,并通過小化
柱色譜期間的洗滌劑暴露或者,
蛋白質(zhì)可以通過使用
嚴(yán)格的清潔劑這在以下應(yīng)用中可能很重要
需要均勻的蛋白質(zhì)制劑然后可以使用脂質(zhì)
如果蛋白質(zhì)活性需要,添加回這些制劑中
和/或穩(wěn)定性
應(yīng)該注意的是,研究
特殊的膜微結(jié)構(gòu)域,稱為脂筏,存在
一個(gè)特的問題脂筏富含鞘脂,甘酸-
氧化磷脂和膽醇(53-55)這些結(jié)構(gòu)域,也稱為
抗洗滌劑膜(DRM)已被證明
在細(xì)胞信號傳導(dǎo)和蛋白質(zhì)分選中發(fā)揮關(guān)鍵作用歷上,DRM
通過其對冷溶解的抵抗力進(jìn)行了檢測
Triton X-100然而,已經(jīng)表明
其中的DRM取決于其
例如,Schuck等人表明
與DRMs相關(guān)的蛋白質(zhì)和脂質(zhì)的類型變化很大-
當(dāng)使用不同的清潔劑來隔離膜時(shí)
域(53)因此,在選擇
從天然膜中分離蛋白質(zhì)的合適洗滌劑
使用溶解的膜蛋白
一些更常見的洗滌劑已被證明是
在膜蛋白功能和結(jié)構(gòu)研究中有用的是
烷基糖苷(56-58)例如,短鏈烷基麥芽糖苷和
葡萄糖苷已成功地用于膜的結(jié)晶
蛋白質(zhì)(59-63),而長鏈糖苷(即十二烷基麥芽糖-
side、十四烷基麥芽糖苷和十六烷基麥芽糖苷)
顯示穩(wěn)定偶聯(lián)的G蛋白的各種寡聚狀態(tài)
受體(GPCR),視紫紅質(zhì)(64)十二烷基麥芽糖苷,例如,具有
被用于結(jié)晶膜蛋白細(xì)胞素c oxi-
來自球形紅桿菌(65)的酶,以研究
4-跨膜螺旋蛋白DsbB
大腸桿菌(66),并研究光誘導(dǎo)的mam結(jié)構(gòu)變化-
用19F NMR測定馬里視紫紅質(zhì)(67)
在膜中使用越來越多的其他清潔劑
蛋白質(zhì)生物化學(xué)是溶血磷脂、Fos堿等-
試劑和短鏈磷脂(圖7)
磷脂類洗滌劑
OOPO
O
O
N
哦
O
溶血磷脂酰堿
P OO
O
O
N
Fos堿12
二己酰磷脂酰堿
圖7
溶血磷脂與天然磷脂相似,其中
膜蛋白被嵌入;它們有磷脂樣
然而,頭群的疏水尾部只含有一個(gè)
酰基鏈,它們形成水溶性聚集體事實(shí)上,有些
GPCR在提取到溶血磷脂中后仍保持功能-
細(xì)胞(68-70)溶血磷脂也被用于核磁共振結(jié)構(gòu)
膜蛋白的研究以及在純化
囊性纖維化跨膜電導(dǎo)調(diào)節(jié)劑(CFTR)(71,72)As
前面提到過,Fos堿清潔劑已經(jīng)成功-
短鏈NMR在膜蛋白研究中的成功應(yīng)用(14-16)
磷脂如二己酰磷脂酰堿(DHPC),
已被用于溶解和重建整體膜
蛋白質(zhì)這些化合物在溶液中形成水溶性膠束
并已被證明能維持天然蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)和功能-
當(dāng)用于膜蛋白純化方案時(shí)(73,75)對于
例如,大腸桿菌外膜蛋白X的NMR結(jié)構(gòu)
(OmpX)在DHPC膠束中測定(76)
膜蛋白也可以重組成洗滌劑脂質(zhì)
混合膠束這可能是具代表性的雙層-
模擬系統(tǒng)例如,細(xì)菌視紫紅質(zhì)已經(jīng)被重新折疊
進(jìn)入幾種不同的洗滌劑脂質(zhì)系統(tǒng),包括CHAPS/DMPC
和CHAPSO/SDS/DMPC膠束(77,78
實(shí)際考慮
使用時(shí)需要考慮幾個(gè)實(shí)際問題
洗滌劑和膜蛋白首先,必須確定
特定ap所需的洗滌劑純度和均勻度-
例如當(dāng)純化和/或結(jié)晶蛋白質(zhì)時(shí),
人們可以選擇既純又無污染的洗滌劑-
氯化醇、酰胺或合成的其他副產(chǎn)物)和
同質(zhì)的(即由單一物種組成)許多工業(yè)
等級洗滌劑,包括Triton和Tween,可能是純的,但
聚氧乙烯鏈組成的不均勻性
這些洗滌劑可能不太適合用于結(jié)晶篩,但是
可能足以提取蛋白質(zhì)
其次,當(dāng)測定增溶劑的分子量時(shí)
膜蛋白,必須考慮聚集分子
洗滌劑蛋白復(fù)合物的重量(圖8)如果可以
假設(shè)每個(gè)膠束有一個(gè)蛋白質(zhì)分子,如果
蛋白質(zhì)比膠束小,則
復(fù)合物等于蛋白質(zhì)分子量加上膠束
聚集重量然而,較大的膜蛋白將傾向于
與比存在于
單獨(dú)的游離膠束在這種情況下,洗滌劑的濃度必須
足以全覆蓋反式-
膜結(jié)構(gòu)域
蛋白質(zhì)/洗滌劑復(fù)合物的聚合分子量
圖8
同樣,重要的是要注意,當(dāng)一個(gè)人集中注意力時(shí)
洗滌劑溶解蛋白質(zhì)的溶液,空的濃度
膠束也可能隨著其分子量的增加而增加
比集中器膜的分子量截?cái)嘀?span>Sev-
有幾種方法可以測定so中洗滌劑的濃度-
溶液包括比色測定法(79)、薄層色譜法(80),
折射率測量(81),
和分析超速離心(82,83)其中一些方法是
可用于測定solu中游離洗滌劑的濃度-
tion(79-81)其他可用于測定蛋白質(zhì)的量-
結(jié)合洗滌劑(79,80,83)或蛋白質(zhì)-洗滌劑復(fù)合物的大?。?span>81,83)
非洗滌劑表面活性劑和其他新型洗滌劑
如前所述,膜蛋白可能不穩(wěn)定
或被某些洗滌劑變性,包括離子洗滌劑和
短鏈非離子洗滌劑半氟化表面活性劑(圖
9A)和兩性(圖9B)是兩種非常不同的非洗滌劑
用于膜蛋白研究的表面活性劑
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