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WB疑難雜癥——膜蛋白

閱讀:375      發(fā)布時(shí)間:2024-9-30
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什么是膜蛋白?

 

膜蛋白是細(xì)胞膜的重要組成部分,負(fù)責(zé)許多關(guān)鍵的生物學(xué)功能如物質(zhì)運(yùn)輸、信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)和細(xì)胞間識(shí)別等,人類(lèi)基因組中編碼的膜蛋白約占總蛋白質(zhì)組的25%左右。它們可以根據(jù)其與膜的結(jié)合方式和功能特點(diǎn)被分為不同的類(lèi)別。以下是膜蛋白的一些主要類(lèi)型和功能:

 

 

1、膜蛋白分類(lèi)

 

外在膜蛋白:這些蛋白分布在細(xì)胞膜的內(nèi)外表面,約占膜蛋白的20%-30%,主要在內(nèi)表面。它們通過(guò)離子鍵、氫鍵與膜脂分子的極性頭部相結(jié)合,或通過(guò)與內(nèi)在蛋白的相互作用,間接與膜結(jié)合,大多是親水性蛋白,主要的類(lèi)型有酶類(lèi)、受體蛋白、細(xì)胞骨架相關(guān)蛋白、免疫相關(guān)蛋白、細(xì)胞間連接蛋白等。

內(nèi)在膜蛋白這些蛋白約占膜蛋白的70%~80%,是雙親媒性分子,可以不同程度地嵌入脂雙層分子中。有些貫穿整個(gè)脂雙層,兩端暴露于膜的內(nèi)外表面,這種類(lèi)型的膜蛋白也稱(chēng)為跨膜蛋白,包括跨膜離子通道蛋白、G蛋白偶聯(lián)受體(GPCR)、跨膜轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白、跨膜受體酪氨酸激酶(RTKs)等。

脂錨定膜蛋白:這類(lèi)蛋白通過(guò)與之共價(jià)相連的脂分子插入膜的脂雙分子中,從而錨定在細(xì)胞質(zhì)膜上。

 

2、研究膜蛋白有什么意義?

 

疾病治療:膜蛋白在許多生理過(guò)程中起著至關(guān)重要的作用,包括細(xì)胞信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)、物質(zhì)運(yùn)輸和細(xì)胞識(shí)別等。許多疾病,如囊性纖維化、糖尿病、心血管疾病和神經(jīng)退行性疾病,都與膜蛋白的功能異常有關(guān)。研究膜蛋白有助于理解這些疾病的發(fā)病機(jī)制,并為開(kāi)發(fā)新的治療方法提供靶點(diǎn)。

藥物開(kāi)發(fā):大約60%的藥物作用于膜蛋白,如G蛋白偶聯(lián)受體(GPCRs)、離子通道和轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白。通過(guò)研究這些膜蛋白的結(jié)構(gòu)和功能,科學(xué)家可以設(shè)計(jì)出更有效的藥物來(lái)調(diào)節(jié)它們的活性,從而治療相關(guān)疾病。

生物醫(yī)學(xué)研究:膜蛋白在細(xì)胞間的通訊、細(xì)胞對(duì)外界信號(hào)的響應(yīng)以及細(xì)胞的免疫功能中扮演關(guān)鍵角色。這些研究有助于我們理解細(xì)胞如何感知和適應(yīng)環(huán)境變化,以及如何在細(xì)胞層面上調(diào)控生物過(guò)程。

生物膜結(jié)構(gòu)的理解:細(xì)胞膜的結(jié)構(gòu)和動(dòng)態(tài)性質(zhì)對(duì)于細(xì)胞的生存至關(guān)重要。研究膜蛋白如何與膜脂質(zhì)相互作用,可以幫助我們更好地理解生物膜的物理性質(zhì)和生物物理學(xué)。

生物技術(shù)應(yīng)用:膜蛋白的研究可以促進(jìn)生物技術(shù)的發(fā)展,例如在生物傳感器、藥物篩選和納米技術(shù)等領(lǐng)域。了解膜蛋白的特性可以幫助設(shè)計(jì)出更有效的生物技術(shù)工具。

細(xì)胞生物學(xué)的基礎(chǔ)研究:膜蛋白是細(xì)胞膜的主要組成部分,研究它們有助于我們理解細(xì)胞膜的生物合成、維持和修復(fù)等基本細(xì)胞過(guò)程。

農(nóng)業(yè)和畜牧業(yè):在農(nóng)業(yè)和畜牧業(yè)中,膜蛋白的研究有助于改良作物和家畜的性狀,例如通過(guò)基因工程改變植物的膜蛋白來(lái)提高其對(duì)疾病的抵抗力或改善其營(yíng)養(yǎng)價(jià)值。

環(huán)境科學(xué):在環(huán)境科學(xué)領(lǐng)域,膜蛋白的研究有助于理解微生物如何與環(huán)境相互作用,例如在生物修復(fù)和污染物的代謝過(guò)程中。

 

3、如何知道自己研究的蛋白是不是膜蛋白?

 

可以通過(guò)uniprot進(jìn)行亞細(xì)胞定位預(yù)測(cè),方法很簡(jiǎn)單,只需要輸入蛋白名稱(chēng),選擇相應(yīng)的物種,進(jìn)入詳情頁(yè)面。

 

 

選擇亞細(xì)胞定位即可了解該蛋白在細(xì)胞中的分布情況。

 

 

當(dāng)然,也可以通過(guò)YLoc、Cell-PLoc等工具進(jìn)行相互驗(yàn)證。

 

4、膜蛋白WB難在哪?

 

膜蛋白有很多屬于大分子量蛋白,比起小分子量蛋白,提取和轉(zhuǎn)膜更加困難。

提取困難:膜蛋白與膜結(jié)合緊密,不易從膜上洗滌下來(lái),特別是跨膜蛋白,具有:

1)結(jié)構(gòu)復(fù)雜:跨膜蛋白擁有多重跨膜結(jié)構(gòu)域,通過(guò)疏水作用緊密地嵌入到細(xì)胞膜中,這使得它們?cè)谒械娜芙舛确浅5?,不易被提取?/span>

2)表達(dá)量低:膜蛋白在樣品中的表達(dá)量通常不高,如果不富集,在總蛋白中占比較低,用總蛋白檢測(cè)時(shí),可能無(wú)法檢測(cè)到。

3)易形成多聚體:膜蛋白由于其跨膜區(qū)域的疏水性,加熱時(shí)疏水相互作用可能會(huì)增強(qiáng),導(dǎo)致膜蛋白分子間相互聚集,形成聚合物。

4)分子量大:部分膜蛋白分子量較大,大分子量蛋白WB,電泳,轉(zhuǎn)膜等條件需要摸索,較為困難。

 

面對(duì)膜蛋白我們應(yīng)該如何處理?

 

1、了解自己研究蛋白的特性

可以通過(guò)uniprot、topcons、The Human Protein Atlas等工具,結(jié)合文獻(xiàn)檢索,了解研究蛋白的在組織及各種細(xì)胞中的表達(dá)量、是否屬于跨膜蛋白等,表達(dá)量較高且不屬于跨膜蛋白的,蛋白相對(duì)好提取,可以用總蛋白提取方式,對(duì)于跨膜蛋白或者表達(dá)量相對(duì)較少,不好提取的蛋白,可以先進(jìn)行膜蛋白富集(abs9346-50T)。

 

abs9346-50T 細(xì)胞漿、細(xì)胞核及細(xì)胞膜蛋白抽提試劑盒

 

2、蛋白變性

為了避免膜蛋白熱變性收到溫度影響產(chǎn)生多聚體,影響實(shí)驗(yàn)結(jié)果,建議建議根據(jù)蛋白具體屬性在50-70℃左右進(jìn)行熱變性或者采用37℃。

 

3、電泳

 

分離膠的選擇

 

根據(jù)蛋白分子量大小選擇凝膠濃度,需要同時(shí)分離分子量跨度較大的多種蛋白,也可以選擇梯度膠,大分子蛋白最好使用 Tris-Acetate體系進(jìn)行電泳,absin的Tris-Acetate預(yù)制膠能夠有效分離40-500kDa的大蛋白分子,采用玻璃膠板,有效減少蛋白非特異性吸附,使蛋白條帶更為尖銳,清晰。電泳時(shí),可采用120-150V的高電壓,在冰水浴中進(jìn)行,盡量使Marker拉開(kāi)足夠大的距離,通常需要4小時(shí)左右。

 

4、轉(zhuǎn)膜

 

轉(zhuǎn)印膜的選擇

 

濕轉(zhuǎn)法轉(zhuǎn)膜時(shí)間長(zhǎng),300mA電流條件下,150-180KDa的蛋白需要3-3.5h,180-250KDa需要4-5h,大于250KDa需要5.5-6h,濕轉(zhuǎn)法通常效果比較好,比較推薦。半干轉(zhuǎn),40V恒壓,轉(zhuǎn)膜60-90min,小于400KDa的蛋白一般都能轉(zhuǎn)到PVDF膜上。恒流法轉(zhuǎn),電流大小設(shè)置為PVDF膜的面積,時(shí)間1小時(shí)左右,半干轉(zhuǎn)節(jié)約時(shí)間。

其他問(wèn)題可根據(jù)實(shí)際實(shí)驗(yàn)調(diào)整。

 

推薦產(chǎn)品


貨號(hào)

產(chǎn)品名稱(chēng)

規(guī)格

abs9346

細(xì)胞漿、細(xì)胞核及細(xì)胞膜蛋白抽提試劑盒

50T

abs9624-abs9627

Glass gel預(yù)制膠 Tris-Acetate

10片/盒

abs9733

Tris-Acetate-SDS 電泳緩沖液(粉末)

1包

abs9734

大分子蛋白上樣緩沖液(4×)

1mL×5





Absin產(chǎn)品線(xiàn):

爆款產(chǎn)品:試劑盒(mIHC、IHC、凋亡、ELISA、ChIP、Co-IP、TR-FRET、生化檢測(cè)、殘留檢測(cè)、多因子檢測(cè));細(xì)胞培養(yǎng)(類(lèi)器官試劑盒+基質(zhì)膠,胎牛血清+培養(yǎng)添加劑+細(xì)胞因子)、分化試劑盒;分子(mRNA合成服務(wù)+提取試劑盒);化合物大包裝;輔助試劑、耗材/儀器、定制服務(wù)(抗體/多肽/蛋白/標(biāo)記/檢測(cè))...

特色產(chǎn)品:雞胚提取物CEE、B27、N2、霍亂毒素B亞單位CTB、牛腦垂體提取物BPE、百日咳毒素PTX、重組人胰島素Insulin、人源低密度脂蛋白LDL...


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