GST pull-down
利用重組技術(shù)將探針蛋白與GST(Glutathione S transferase)融合,融合蛋白通過GST與固相化在載體上的GTH(Glutathione)親和結(jié)合,已廣泛應(yīng)用于分子生物學(xué)(1)證實(shí)兩種蛋白可能有相互作用(2)尋找能與已知蛋白發(fā)生相互作用的未知蛋白。
GST pull-down實(shí)驗方法原理
利用重組技術(shù)將探針蛋白與GST(Glutathione S transferase)融合,融合蛋白通過GST與固相化在載體上的GTH(Glutathione)親和結(jié)合。因此,當(dāng)與融合蛋白有相互作用的蛋白通過層析柱時或與此固相復(fù)合物混合時就可被吸附而分離。
GST-pulldown主要包括以下三個部分:①利用基因重組技術(shù)構(gòu)建帶有GST標(biāo)簽的原核表達(dá)載體;②通過原核表達(dá)系統(tǒng)表達(dá)帶有GST標(biāo)簽的融合蛋白;③利用GST親和純化柱進(jìn)行蛋白純化獲得高純度的融合蛋白,再利用GST親和純化柱進(jìn)行蛋白間的相互作用檢測。
實(shí)驗操作程序:
材料及試劑
探針蛋白與GST融合的原核蛋白,裂解的細(xì)胞蛋白,或者組織蛋白提取物
細(xì)胞蛋白裂解液,洗脫液:PBS及PBS+1%Triton-100
(以下流程僅供研究已知原核蛋白A和真核過表達(dá)蛋白B相互作用)
1:原核融合蛋白A的獲得
1.1:將編碼蛋白A與GST的重組質(zhì)?;D(zhuǎn)BL21(DE3)菌株
1.2:挑取單個克隆到含有5mlLB(+100ug/mlAmp)的10ml試管里,37℃培養(yǎng)過夜
1.3:將培養(yǎng)菌液轉(zhuǎn)移到含有500ml LB(+100ug/mlAmp)的1L錐形瓶中,37℃,225rpm培養(yǎng)至OD600≈1.0-1.5左右,加入適當(dāng)濃度的IPTG,在適當(dāng)溫度下培養(yǎng)適當(dāng)時間(誘導(dǎo)條件需要根據(jù)不同的蛋白做調(diào)整),6000g,10分鐘,4℃離心收集細(xì)菌,去盡上清,將菌體至于-20℃放置O/N
1.4:室溫凍融菌體,馬上置于冰上,每500ml培養(yǎng)液加入10-20ml細(xì)菌裂解液(PBS+1%Triton-100+PMSF),吹打混勻
1.5:冰上超聲破碎,開2秒,停9秒,總40-60分鐘。至裂解液充分清涼
1.6:11000rpm,15分鐘,4℃離心分離上清, -80℃保存?zhèn)溆?/span>
2:真核融合蛋白B的獲得
2.1:將編碼B蛋白的堿基序列克隆到編碼標(biāo)簽蛋白(如HA,或者myc)的真核表達(dá)載體上,進(jìn)行細(xì)胞轉(zhuǎn)染
3:48小時后,取適量融合蛋白GST-A 于冰上凍融
4:取50-70ulGST-Beads(Immobilized Glutathione)到EP管中,用800ul PBS+1%Triton-100潤洗一次,將凍融融合蛋白GST-A與之混勻,4℃層析柜旋轉(zhuǎn)結(jié)合1小時。
5:PBS+1%Triton-100洗3次,PBS洗3次。留取20ul( PBS+Beads)作Offer。
6:同時,裂解真核融合蛋白B,去盡培養(yǎng)基,用PBS(RT)洗一次,加入300ul裂解液(以6well為例,PBS+1%Triton-100+ Cocktaier),4℃放置30分鐘。
7:吹打收集至1.5mlEP管,超聲破碎。13000rpm,15分鐘,4℃離心取上清。
8:BCA蛋白定量(optional)留取20ul做Offer,其余樣品加入到已純化蛋白的EP管中,用PBS補(bǔ)足液體到600ul左右,以便蛋白之間能充分結(jié)合!4℃旋轉(zhuǎn)結(jié)合O/N9:PBS+1%Triton-100洗3次,PBS洗3次。
10:40ul 5×loading buffer溶解beads上的蛋白,煮沸3分鐘,高速離心,Run –SDS PAGE做Western Blot檢測。用HA或者myc Blot
注意事項:
內(nèi)源性蛋白的干擾使得實(shí)驗出現(xiàn)的假陽性結(jié)果較多:
(1)高純度的GST融合蛋白能夠減少實(shí)驗的假陽性。由于高純度的融合蛋白能減少實(shí)驗結(jié)果的假陽性,因此獲得高純度的融合蛋白對于GST-pull down 實(shí)驗結(jié)果 分析具有重要的作用。同時,為了能夠盡可能的保證融合蛋白原有的生物學(xué)活性,一般在獲取融合蛋白時傾向于可溶性融合蛋白,因此獲得高純度的可溶性蛋白很關(guān)鍵。
(2)對于可溶性蛋白的獲得條件主要有①載體的選擇。②可溶性蛋白表達(dá)條件的選擇,③誘導(dǎo)溫度,④誘導(dǎo)時間,⑤誘導(dǎo)物的濃度,能夠不被細(xì)胞代謝而且具有穩(wěn)定的濃度。
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