RACE技術(shù)實(shí)驗(yàn)原理
RACE技術(shù)是采用PCR 技術(shù)由已知的部分cDNA 順序來擴(kuò)增出完整cDNA5’和3’末端,是一種簡便而有效的方法, 又被稱為錨定 PCR (anchoredPCR)和單邊PCR(one2side PCR)。
3'RACE
利用mRNA的3'末端的poly(A)尾巴作為一個(gè)引物結(jié)合位點(diǎn),以連有SMART寡核營酸序列通用接頭引物的Oligo(dT)30MN作為鎖定引物反轉(zhuǎn)錄合成標(biāo)準(zhǔn)*鏈cDNA.然后用一個(gè)基因特異引物GSP1(gene specific primer,GSP)作為上游引物,用一個(gè)含有部分接頭序列的通用引物UPM(universal primer,UPM)作為下游引物,以cDNA*鏈為模板,進(jìn)行PCR循環(huán),把目的基因3' 末端的基因片
段擴(kuò)增出來。
5'RACE
先利用mRNA的3'末端的poly(A)尾巴作為一個(gè)引物結(jié)合位點(diǎn),以O(shè)ligo(dT)30MN作為鎖定引物在反轉(zhuǎn)錄酶MMLV作用下,反轉(zhuǎn)錄合成標(biāo)準(zhǔn)*鏈cDNA.利用該反轉(zhuǎn)錄酶具有的末端轉(zhuǎn)移酶活性,在反轉(zhuǎn)錄達(dá)到*鏈的5'末端時(shí)自動(dòng)加上3-5個(gè)(dC)殘基,退火后(dC)殘基與含有SMART寡核苷酸序列Oliogo(dG)通用接頭引物配對(duì)后,轉(zhuǎn)換為以SMART序列為模板繼續(xù)延伸而連上通用接頭(見Figure 2 )。然后用一個(gè)含有部分接頭序列的通用引物UPM(universal primer,UPM)作為上游引物,用一個(gè)基因特異引物2(GSP 2 genespecific primer,GSP)作為下游引物,以SMART*鏈cDNA為模板,進(jìn)行PCR循環(huán),把目的基因5'末端的c基因 片段擴(kuò)增出來。終,從2個(gè)有相互重疊序列的3'/ 5'-RACE產(chǎn)物中獲得全長cDNA,或者通過分析RACE產(chǎn)物的3'和5'端序列,合成相應(yīng)引物擴(kuò)增出全長cDNA。
實(shí)驗(yàn)流程:
1、總RNA提取以及cDNA反轉(zhuǎn)錄
2、根據(jù)已知序列設(shè)計(jì)引物,以cDNA模板進(jìn)行擴(kuò)增,驗(yàn)證序列正確性
3、RACE 擴(kuò)增,并測(cè)序,使用錨定PCR(AnchoredPCR)與巢式PCR(Nested PCR)相結(jié)合的方法,分別進(jìn)行3'末端和5'末端RACE并對(duì)其產(chǎn)物進(jìn)行測(cè)序
4、根據(jù)測(cè)序結(jié)果拼接目的基因全長cDNA序列
5、將RACE產(chǎn)物進(jìn)行TA克隆用于后續(xù)研究(可根據(jù)客戶要求自行選擇)
服務(wù)優(yōu)勢(shì)
采用進(jìn)口試劑,確保實(shí)驗(yàn)準(zhǔn)確性
較同類產(chǎn)品方法更快速,便捷
豐富的項(xiàng)目經(jīng)驗(yàn),超過500例的成功案例
提供全套的后續(xù)生物信息學(xué)分析服務(wù)(可根據(jù)客戶要求提供個(gè)性化分析服務(wù))
服務(wù)流程
1、確認(rèn)客戶提供的序列信息
2、評(píng)估RACE實(shí)驗(yàn)可行性
3、確認(rèn)樣本信息
4、根據(jù)客戶提供的信息設(shè)計(jì)好實(shí)驗(yàn)方案,銷售做出報(bào)價(jià)合同
4、客戶確定無誤后簽訂《沃森生物-RACE檢測(cè)服務(wù)合同》,并簽字(或蓋章)
5、支付預(yù)付款,服務(wù)正式啟動(dòng)
6、根據(jù)合同實(shí)驗(yàn)方案開展實(shí)驗(yàn)
8、實(shí)驗(yàn)結(jié)束后,發(fā)送初步實(shí)驗(yàn)報(bào)告
9、支付實(shí)驗(yàn)尾款
10、提供詳細(xì)實(shí)驗(yàn)報(bào)告,完成實(shí)驗(yàn)項(xiàng)目
材料提交說明
實(shí)驗(yàn)樣品
1、組織或者細(xì)胞:提供盡可能多的新鮮組織或細(xì)胞樣品(包括3個(gè)技術(shù)重復(fù)),組織樣品不少于200 mg,細(xì)胞至少107個(gè)
2、RNA樣品:3’ RACE:Total RNA>15μg;5’ RACE:Total RNA>25μg(注:OD260/OD280在1.9-2.1之間,完整性好)
序列信息:
1、大于200bp的已知序列(請(qǐng)注明已知序列的5’ 端及3’ 端):如果已知序列比較短,建議先進(jìn)行3’ RACE再進(jìn)行5’ RACE,以提高實(shí)驗(yàn)的成功率
2、實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)和參考文獻(xiàn):這將會(huì)幫助我們更好地理解您的實(shí)驗(yàn)背景,有利于實(shí)驗(yàn)的順利進(jìn)行
結(jié)果交付
實(shí)驗(yàn)結(jié)題報(bào)告:包括實(shí)驗(yàn)步驟,引物信息,實(shí)驗(yàn)過程 PCR產(chǎn)物照片,全長序列拼接結(jié)果;
測(cè)序原始數(shù)據(jù):測(cè)序彩色波形圖、堿基序列圖;
實(shí)驗(yàn)產(chǎn)物:引物、PCR產(chǎn)物、測(cè)序用質(zhì)粒(限產(chǎn)生克隆測(cè)序的情況)。
毓秀生物科技(上海)有限公司是一家專注于生物科技前沿技術(shù)研發(fā)和科研技術(shù)服務(wù)的公司,公司建有專業(yè)的分子生物學(xué)、細(xì)胞生物學(xué)、組織病理學(xué)實(shí)驗(yàn)室,為眾多生物醫(yī)藥企業(yè)、科研機(jī)構(gòu)、醫(yī)院及高校提供分子生物學(xué)、細(xì)胞生物學(xué)、病理形態(tài)學(xué)等方面科研服務(wù)。公司核心團(tuán)隊(duì)曾在國內(nèi)外許多優(yōu)秀學(xué)府從事過多年研發(fā)工作,秉承“為客戶創(chuàng)造價(jià)值,為員工實(shí)現(xiàn)夢(mèng)想,為社會(huì)創(chuàng)造財(cái)富"的經(jīng)營理念,堅(jiān)持以技術(shù)創(chuàng)新為先導(dǎo),以服務(wù)質(zhì)量為根本,為中國生物醫(yī)藥和科學(xué)研究提供優(yōu)質(zhì)的產(chǎn)品和技術(shù)服務(wù)。