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ASFV非洲豬瘟病毒抗原檢測試紙條

廣州健侖生物科技有限公司

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1、HUMAnN2
哈佛大學(xué)公共衛(wèi)生學(xué)院的Eric Franzosa為宏基因組數(shù)據(jù)分析開發(fā)了HUMAnN2。*代HUMAnN主要是根據(jù)宏基因組或者宏轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)，分析微生物通路在群體中是否存在。也就是說，給HUMAnN提供微生物群落的DNA或RNA序列，它就會(huì)告訴你這個(gè)群體能夠執(zhí)行什么樣的分子功能。HUMAnN2在HUMAnN的基礎(chǔ)上進(jìn)行了拓展，將微生物與特定活性關(guān)聯(lián)起來。
2、MetaPath
MetaPath也是一個(gè)用于宏基因組數(shù)據(jù)分析的重要工具。該工具由馬里蘭大學(xué)的副教授Mihai Pop開發(fā)，可以根據(jù)宏基因組數(shù)據(jù)分析特定群體在不同條件下的代謝變化。舉例來說，Pop的研究團(tuán)隊(duì)對(duì)胖人和瘦人進(jìn)行微生物組研究，通過MetaPath鑒定了脂肪酸生物合成通路的差異。
3、MEGAN5
MEGAN5也用于MetaGenome ANalyzer，初是在2007年開發(fā)出來，用于識(shí)別長毛猛犸象骨中DNA測序研究的微生物污染。MEGAN5是發(fā)布的*版本，除了可以幫助進(jìn)行分類分析，也可以快速比較多個(gè)數(shù)據(jù)集，區(qū)分宏基因組中基因的功能，此外還提供元數(shù)據(jù)metadata支持和數(shù)據(jù)可視化的新途徑。
4、Nature Methods
此外，近期Nature Methods雜志發(fā)布了一個(gè)名為TruSPADES的強(qiáng)大工具，可以大大提升研究者們測序宏基因組的能力。這種算法能將Illumina測序儀生成的300bp短讀取，合并成大約1萬bp的基因組片段（Synthetic Long Reads）。